Γονίδιο
TCF4
transcription factor 4
- HGNC 11634↗(ανοίγει σε νέα καρτέλα)
- Γονίδιο Ensembl ENSG00000196628↗(ανοίγει σε νέα καρτέλα)
- NCBI Gene 6925↗(ανοίγει σε νέα καρτέλα)
Σύνοψη
- Κυτογενετική θέση
- 18q21.2
- Συντεταγμένες
- Χρωμόσωμα 18: 55.222.185–55.588.192 (GRCh38)
- Εξόνια
- 20 έξώνια σε 366 kb
- Πρωτεΐνη
- 671 αμινοξέα
- Κληρονομικότητα
- Αυτοσωμικός επικρατής
- Γνωστό επίσης ως
- SEF2-1B, ITF2, bHLHb19, E2-2
- Μεταγράφημα MANE Select
- ENST00000354452.8NM_001083962.2
- Τύπος locus
- gene with protein product
- Πολύ υψηλή
- Υψηλή
- Χαμηλή
- Πολύ χαμηλή
Γονιδίωμα αναφοράςGRCh38hg38
Οι θέσεις στις σελίδες γονιδίων και παραλλαγών ακολουθούν αυτή την επιλογή, σε αυτό το πρόγραμμα περιήγησης.
Διαβάστε το TCF4, και το υπόλοιπο γονιδίωμά σας, με μία εξέταση.
Από 449 $Δωρεάν αποστολή · Αποτελέσματα σε 6–8 εβδομάδες
Αποκτήστε το Genome Test σαςΕπιμελημένες αναφορές που σχετίζονται με αυτό το γονίδιο
Κληρονομικές δυστροφίες κερατοειδούς
- Δυστροφία κερατοειδούς
Ομάδα κληρονομικών παθήσεων που επηρεάζουν ένα ή περισσότερα στρώματα του κερατοειδούς, όπως η δυστροφία ενδοθηλίου Fuchs (συχνά συνδεδεμένη με επέκταση επαναλήψεων στο TCF4), οι κοκκώδεις και πλεγματικές δυστροφίες που σχετίζονται με το TGFBI, και σπανιότερα είδη που προκαλούνται από γονίδια όπως τα SLC4A11, COL8A2, ZEB1 και CHST6.
- 1 υποβολέας GenCC την κατατάσσει ως οριστική ή ισχυρή
Τι αλλάζει με τη γνώση
Στους φορείς παραλλαγών του TGFBI συνήθως συνιστάται να αποφεύγουν τη διαθλαστική χειρουργική με laser (LASIK ή PRK), καθώς αυτή μπορεί να επιδεινώσει τα εναποθέματα. Η μεταμόσχευση κερατοειδούς μπορεί να αποκαταστήσει την όραση σε προχωρημένη νόσο.
Νοητική αναπηρία
- Σύνδρομο Pitt-HopkinsΑυτοσωμικός επικρατής
Μια πάθηση που προκαλείται από παραλλαγές του TCF4 και που προκαλεί διανοητική αναπηρία, ανωμαλίες του ρυθμού της αναπνοής και χαρακτηριστικά προσώπου.
- Το ClinGen κατατάσσει τη σύνδεση ως οριστική
- 5 υποβολείς GenCC την κατατάσσουν ως οριστική ή ισχυρή
Κληρονομικότητα
- Αυτοσωμικός επικρατής
- Ένα μεταλλαγμένο αντίγραφο, από οποιονδήποτε γονέα, αρκεί. Ένας γονέας που το έχει το μεταβιβάζει σε κάθε παιδί με πιθανότητα ένα προς δύο.
Πώς είναι διαταγμένο το TCF4
- Κωδικοποιούσα αλληλουχία
- Μη μεταφραζόμενη περιοχή
- Ιντρόνιο
- Κατεύθυνση μεταγραφής
- Γνωστές θέσεις που προκαλούν νόσο
- Περιοχές που τα σύντομα αναγνώσματα βρίσκουν δύσκολες
- Παραλλαγές με σελίδα
Εξόνια του μεταγράφηματος MANE Select του γονιδίου (έκδοση v1.5), από τα NCBI και το EMBL-EBI, στο γονιδίωμα αναφοράς GRCh38.
Ζώνες χρωμοσωμάτων από το ιδεόγραμμα GRCh38 του UCSC (2022-10-29).
Γειτονικά γονίδια από την έκδοση 116 του Ensembl, στο GRCh38.
Τα εξόνια αποτελούν 8 kb από τα 366 kb του γονιδίου· 2.016 από αυτές τις βάσεις κωδικοποιούν την πρωτεΐνη.
Πώς διαβάζει ένα τεστ γονιδιώματος το TCF4
176
θέσεις στο TCF4 όπου το ClinVar κατατάσσει μια μεταβολή ως παθογόνο ή πιθανώς παθογόνο
Καμία από αυτές δεν βρίσκεται σε περιοχή που τα σύντομα αναγνώσματα βρίσκουν δύσκολη.
Η ολόκληρη γονιδιωματική ανάλυση καλύπτει και τα 366 kb του TCF4, συμπεριλαμβανομένων των ιντρονίων, και όχι μόνο τα 8 kb των εξονίων.
Παραλλαγές με σελίδα (16)
Οι παραλλαγές του TCF4 με σελίδα εδώ, με τα περισσότερα αστέρια αξιολόγησης πρώτα. Κάθε σελίδα περιγράφει το δημόσιο αρχείο της ClinVar για την παραλλαγή, ποτέ ένα αποτέλεσμα.
| Παραλλαγή | HGVS c. | Εξόνιο ή ιντρόνιο | Θέση (GRCh38) | Ταξινόμηση ClinVar | Κατάσταση αξιολόγησης |
|---|---|---|---|---|---|
| c.990G>A | Εξόνιο 12 | 55.261.466 | Παθογόνο | ★★★★3 αστέρια από 4 ελέγχθηκε από ομάδα εμπειρογνωμόνων | |
| G496C | c.1486G>T | Εξόνιο 16 | 55.234.548 | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★3 αστέρια από 4 ελέγχθηκε από ομάδα εμπειρογνωμόνων |
| G592S | c.1774G>A | Εξόνιο 18 | 55.228.952 | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★3 αστέρια από 4 ελέγχθηκε από ομάδα εμπειρογνωμόνων |
| G656Rfs*55 | c.1965dup | Εξόνιο 19 | 55.228.275 | Παθογόνο | ★★★★3 αστέρια από 4 ελέγχθηκε από ομάδα εμπειρογνωμόνων |
| L609P | c.1826T>C | Εξόνιο 18 | 55.228.900 | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★3 αστέρια από 4 ελέγχθηκε από ομάδα εμπειρογνωμόνων |
| Q670Hfs*40 | c.2010_2011del | Εξόνιο 19 | 55.228.229 | Παθογόνο | ★★★★3 αστέρια από 4 ελέγχθηκε από ομάδα εμπειρογνωμόνων |
| R576Q | c.1727G>A | Εξόνιο 18 | 55.228.999 | Παθογόνο | ★★★★3 αστέρια από 4 ελέγχθηκε από ομάδα εμπειρογνωμόνων |
| R578H | c.1733G>A | Εξόνιο 18 | 55.228.993 | Παθογόνο | ★★★★3 αστέρια από 4 ελέγχθηκε από ομάδα εμπειρογνωμόνων |
| R580Q | c.1739G>A | Εξόνιο 18 | 55.228.987 | Παθογόνο | ★★★★3 αστέρια από 4 ελέγχθηκε από ομάδα εμπειρογνωμόνων |
| R580W | c.1738C>T | Εξόνιο 18 | 55.228.988 | Παθογόνο | ★★★★3 αστέρια από 4 ελέγχθηκε από ομάδα εμπειρογνωμόνων |
Γονίδια που σχετίζονται με τις ίδιες παθήσεις
- CHST6carbohydrate sulfotransferase 6Μοιράζεται 1 πάθηση
- COL17A1collagen type XVII alpha 1 chainΜοιράζεται 1 πάθηση
- COL8A2collagen type VIII alpha 2 chainΜοιράζεται 1 πάθηση
- DCNdecorinΜοιράζεται 1 πάθηση
- GRHL2grainyhead like transcription factor 2Μοιράζεται 1 πάθηση
- GSNgelsolinΜοιράζεται 1 πάθηση
- KRT12keratin 12Μοιράζεται 1 πάθηση
- KRT3keratin 3Μοιράζεται 1 πάθηση
- MCOLN1mucolipin TRP cation channel 1Μοιράζεται 1 πάθηση
- NLRP1NLR family pyrin domain containing 1Μοιράζεται 1 πάθηση
- OVOL2ovo like zinc finger 2Μοιράζεται 1 πάθηση
- PIKFYVEphosphoinositide kinase, FYVE-type zinc finger containingΜοιράζεται 1 πάθηση
Χαρακτηριστικά που συνδέονται με το TCF4
Το Human Phenotype Ontology καταγράφει αυτά ως χαρακτηριστικά των σπάνιων παθήσεων που μπορεί να προκαλέσει το TCF4. Η σελίδα κάθε χαρακτηριστικού εμφανίζει τα άλλα γονίδια που συνδέονται με αυτό.
Abnormality of the nervous system
- Intellectual disability, severe
- Repetitive movements
- Absent speech development
- Ataxia
- Difficulty finding words
- Difficulty sleeping
- Echoing another person's speech
- Global developmental delay
Εμφάνιση 20 ακόμη χαρακτηριστικών
- Inability to speak
- Intellectual disability
- IQ between 34 and 49
- Specific learning disability
- Aplasia/Hypoplasia of the corpus callosum
- Epilepsy
- Inability to coordinate movements when walking
- Pauses in breathing while sleeping
- Small cerebral cortex
- Small hippocampus
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Aggressive behavior
- Autism spectrum disorder
- Depression
- Happy demeanor
- Self-injurious behavior
- Ventriculomegaly
- Encephalopathy
- Incoordination
- Motor delay
Abnormality of the digestive system
- Acid reflux
- Abnormal biliary tract morphology
- Constipation
- Feeding difficulties
- Inflammation of the esophagus
- Slowed or blocked flow of bile from liver
- Stomach hernia
- Abnormal large intestine physiology
Εμφάνιση 18 ακόμη χαρακτηριστικών
- Accumulation of fluid in the abdomen
- Enlarged liver
- Hepatic fibrosis
- Scar tissue replaces healthy tissue in the liver
- Ulcerative colitis
- Abdominal pain
- Adenocarcinoma of the large intestine
- Bile duct cancer
- Celiac disease
- Chronic liver failure
- Gallstones
- Hepatocellular carcinoma
- Jaundice
- Liver inflammation
- Pancreatic inflammation
- Acute liver failure
- Enlarged colon lacking nerve cells
- Neoplasm of the gallbladder
Abnormality of head or neck
- Coarse facial features
- Deep philtrum
- Development of small head that was not present at birth
- Flared nostrils
- Sparse medial eyebrow
- Wide mouth
- Widely spaced teeth
- Abnormal dental position
Εμφάνιση 16 ακόμη χαρακτηριστικών
- Abnormality of the palate
- Abnormally small head
- Full cheeks
- Full lips
- Narrow forehead
- Nasal tip, upturned
- Overhanging nasal tip
- Prominent nasal bridge
- Short neck
- Short philtrum
- Unerupted adult teeth
- Upward slanting of the opening between the eyelids
- Triangular nasal tip
- Fetal nuchal edema
- Open mouth
- Wide nasal bridge
Abnormality of the eye
- Deeply set eye
- Abnormal corneal endothelium morphology
- Abnormal Descemet membrane morphology
- Astigmatism
- Close sighted
- Corneal opacity
- Decreased clarity of vision
- Reduced number of corneal endothelial cells
Εμφάνιση 7 ακόμη χαρακτηριστικών
Laboratory abnormality
- Fluid retention
- Elevated alkaline phosphatase of hepatic origin
- Fever
- High liver enzymes
- Decreased circulating vitamin K concentration
- Deficient in vitamin D
- Fluid around lungs
- Low albumin
Εμφάνιση 5 ακόμη χαρακτηριστικών
Εξωτερικοί σύνδεσμοι
Εγγραφές γονιδίου
Μεταγράφημα
Πρωτεΐνη
Από πού προέρχονται τα στοιχεία
- HGNC: το σύμβολο, το όνομα, τα άλλα σύμβολα και η θέση του γονιδίου.
- MANE Select v1.5, από το NCBI και το EMBL-EBI: το μεταγράφημα, τα εξόνια και η κωδικοποιούσα αλληλουχία.
- GenCC και ClinGen, έκδοση 2026-10-16: ποιες παθήσεις σχετίζονται με το γονίδιο και πόσο ισχυρή είναι η σχέση.
- Ο κατάλογος δευτερευόντων ευρημάτων του ACMG, SF v3.2.
- ClinVar και οι στρωματοποιήσεις GIAB: γνωστές θέσεις που προκαλούν νόσο και περιοχές που δυσκολεύουν τις αναγνώσεις μικρού μήκους.
- Το Human Phenotype Ontology, έκδοση 2026-09-01: τα χαρακτηριστικά που συνδέονται με το γονίδιο. Μάθετε περισσότερα στο hpo.jax.org.
- Έκδοση δεδομένων 2026.10.16-c6eea6bf.
Παραπομπή σε αυτή τη σελίδα
Dante Labs. (χ.η.). Γονίδιο TCF4: transcription factor 4. Ανάκτηση 17 Οκτωβρίου 2026, από https://dantelabs.com/el/genes/tcf4
Dante Labs. Γονίδιο TCF4: transcription factor 4 [Internet]. [ανακτήθηκε 17 Οκτωβρίου 2026]. Διαθέσιμο από: https://dantelabs.com/el/genes/tcf4
Ένα τεστ. Απαντήσεις για όλη τη ζωή.
Από 449 $Δωρεάν αποστολή · Αποτελέσματα σε 6–8 εβδομάδες