Gen
TCF4
transcription factor 4
- HGNC 11634↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000196628↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 6925↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 18q21.2
- Coördinaten
- Chromosoom 18: 55.222.185–55.588.192 (GRCh38)
- Exons
- 20 exons over 366 kb
- Eiwit
- 671 aminozuren
- Overerving
- Autosomaal dominant
- Ook bekend als
- SEF2-1B, ITF2, bHLHb19, E2-2
- MANE Select-transcript
- ENST00000354452.8NM_001083962.2
- Type locus
- gene with protein product
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
ReferentiegenoomGRCh38hg38
Posities op gen- en variantpagina's volgen deze keuze, in deze browser.
Lees TCF4 en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerde rapporten over dit gen
Erfelijke hoornvliesdystrofieën
- Hoornvliesdystrofie
Een groep erfelijke aandoeningen die een of meer lagen van het hoornvlies aantasten, waaronder de endotheeldystrofie van Fuchs (vaak gekoppeld aan een expansie van een TCF4-repeat), TGFBI-gerelateerde granulaire en latticedystrofieën, en zeldzamere vormen die worden veroorzaakt door genen zoals SLC4A11, COL8A2, ZEB1 en CHST6.
- 1 GenCC-indiener beoordeelt het als definitief of sterk
Wat weten verandert
Dragers van TGFBI-varianten wordt over het algemeen geadviseerd laserrefractiechirurgie (LASIK of PRK) te vermijden, omdat die de afzettingen kan verergeren. Een hoornvliestransplantatie kan het zicht herstellen bij gevorderde aandoening.
Intellectuele beperking
- Pitt-Hopkins-syndroomAutosomaal dominant
Een aandoening veroorzaakt door varianten in TCF4, die leidt tot verstandelijke beperking, onregelmatigheden in de ademhaling en kenmerkende gelaatstrekken.
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 5 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
Overerving
- Autosomaal dominant
- Eén veranderde kopie, van welke ouder dan ook, is voldoende. Een ouder die er één heeft, geeft die met een kans van één op twee door aan elk kind.
Opbouw van TCF4
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
- Gebieden die korte reads moeilijk vinden
- Varianten met een pagina
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 8 kb van de 366 kb van het gen; 2.016 van die basen coderen voor het eiwit.
Hoe een genoomtest TCF4 leest
176
posities in TCF4 waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen classificeert
Geen daarvan valt in een gebied dat korte reads moeilijk vinden.
Een volledig genoom dekt alle 366 kb van TCF4, inclusief introns, en niet alleen de 8 kb aan exonen.
Varianten met een pagina (16)
De TCF4-varianten met een pagina hier, eerst die met de meeste reviewsterren. Elke pagina beschrijft het openbare ClinVar-dossier van de variant, nooit een uitslag.
| Variant | HGVS c. | Exon of intron | Positie (GRCh38) | ClinVar-classificatie | Reviewstatus |
|---|---|---|---|---|---|
| c.990G>A | Exon 12 | 55.261.466 | Pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel | |
| G496C | c.1486G>T | Exon 16 | 55.234.548 | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| G592S | c.1774G>A | Exon 18 | 55.228.952 | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| G656Rfs*55 | c.1965dup | Exon 19 | 55.228.275 | Pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| L609P | c.1826T>C | Exon 18 | 55.228.900 | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| Q670Hfs*40 | c.2010_2011del | Exon 19 | 55.228.229 | Pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| R576Q | c.1727G>A | Exon 18 | 55.228.999 | Pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| R578H | c.1733G>A | Exon 18 | 55.228.993 | Pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| R580Q | c.1739G>A | Exon 18 | 55.228.987 | Pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| R580W | c.1738C>T | Exon 18 | 55.228.988 | Pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
Genen die aan dezelfde aandoeningen zijn gekoppeld
- CHST6carbohydrate sulfotransferase 6Deelt 1 aandoening
- COL17A1collagen type XVII alpha 1 chainDeelt 1 aandoening
- COL8A2collagen type VIII alpha 2 chainDeelt 1 aandoening
- DCNdecorinDeelt 1 aandoening
- GRHL2grainyhead like transcription factor 2Deelt 1 aandoening
- GSNgelsolinDeelt 1 aandoening
- KRT12keratin 12Deelt 1 aandoening
- KRT3keratin 3Deelt 1 aandoening
- MCOLN1mucolipin TRP cation channel 1Deelt 1 aandoening
- NLRP1NLR family pyrin domain containing 1Deelt 1 aandoening
- OVOL2ovo like zinc finger 2Deelt 1 aandoening
- PIKFYVEphosphoinositide kinase, FYVE-type zinc finger containingDeelt 1 aandoening
Kenmerken gekoppeld aan TCF4
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die TCF4 kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Abnormality of the nervous system
- Intellectual disability, severe
- Repetitive movements
- Absent speech development
- Ataxia
- Difficulty finding words
- Difficulty sleeping
- Echoing another person's speech
- Global developmental delay
Toon 20 kenmerken meer
- Inability to speak
- Intellectual disability
- IQ between 34 and 49
- Specific learning disability
- Aplasia/Hypoplasia of the corpus callosum
- Epilepsy
- Inability to coordinate movements when walking
- Pauses in breathing while sleeping
- Small cerebral cortex
- Small hippocampus
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Aggressive behavior
- Autism spectrum disorder
- Depression
- Happy demeanor
- Self-injurious behavior
- Ventriculomegaly
- Encephalopathy
- Incoordination
- Motor delay
Abnormality of the digestive system
- Acid reflux
- Abnormal biliary tract morphology
- Constipation
- Feeding difficulties
- Inflammation of the esophagus
- Slowed or blocked flow of bile from liver
- Stomach hernia
- Abnormal large intestine physiology
Toon 18 kenmerken meer
- Accumulation of fluid in the abdomen
- Enlarged liver
- Hepatic fibrosis
- Scar tissue replaces healthy tissue in the liver
- Ulcerative colitis
- Abdominal pain
- Adenocarcinoma of the large intestine
- Bile duct cancer
- Celiac disease
- Chronic liver failure
- Gallstones
- Hepatocellular carcinoma
- Jaundice
- Liver inflammation
- Pancreatic inflammation
- Acute liver failure
- Enlarged colon lacking nerve cells
- Neoplasm of the gallbladder
Abnormality of head or neck
- Coarse facial features
- Deep philtrum
- Development of small head that was not present at birth
- Flared nostrils
- Sparse medial eyebrow
- Wide mouth
- Widely spaced teeth
- Abnormal dental position
Toon 16 kenmerken meer
- Abnormality of the palate
- Abnormally small head
- Full cheeks
- Full lips
- Narrow forehead
- Nasal tip, upturned
- Overhanging nasal tip
- Prominent nasal bridge
- Short neck
- Short philtrum
- Unerupted adult teeth
- Upward slanting of the opening between the eyelids
- Triangular nasal tip
- Fetal nuchal edema
- Open mouth
- Wide nasal bridge
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool van het gen, de naam, andere symbolen en de locatie.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht 2026-10-16: aan welke aandoeningen het gen is gekoppeld, en hoe sterk dat verband is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende plaatsen en de regio's waar korte reads moeite mee hebben.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.16-c6eea6bf.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). TCF4-gen: transcription factor 4. Geraadpleegd op 16 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/tcf4
Dante Labs. TCF4-gen: transcription factor 4 [Internet]. [geraadpleegd 16 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/tcf4
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken