Gen
TCF4
transcription factor 4
- HGNC 11634↗(otwiera się w nowej karcie)
- Gen Ensembl ENSG00000196628↗(otwiera się w nowej karcie)
- NCBI Gene 6925↗(otwiera się w nowej karcie)
Podsumowanie
- Lokalizacja cytogenetyczna
- 18q21.2
- Współrzędne
- Chromosom 18: 55 222 185–55 588 192 (GRCh38)
- Eksony
- 20 eksonów na odcinku 366 kb
- Białko
- 671 aminokwasów
- Dziedziczenie
- Autosomalne dominujące
- Znany również jako
- SEF2-1B, ITF2, bHLHb19, E2-2
- Transkrypt MANE Select
- ENST00000354452.8NM_001083962.2
- Typ locus
- gene with protein product
- Bardzo wysoka
- Pewna
- Niska
- Bardzo niska
Genom referencyjnyGRCh38hg38
Pozycje na stronach genów i wariantów zależą od tego wyboru, w tej przeglądarce.
Odczytaj TCF4 oraz resztę swojego genomu dzięki jednemu badaniu.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
Zamawiam Genome TestWyselekcjonowane raporty dotyczące tego genu
Dziedziczne dystrofie rogówki
- Dystrofia rogówki
Grupa dziedzicznych schorzeń dotyczących jednej lub kilku warstw rogówki, m.in. dystrofia śródbłonka Fuchsa (często związana z ekspansją powtórzeń w genie TCF4), ziarnista i siateczkowa dystrofia związana z genem TGFBI oraz rzadsze postacie wywoływane przez geny takie jak SLC4A11, COL8A2, ZEB1 i CHST6.
- 1 podmiot GenCC ocenia go jako definitywny lub silny
Co zmienia znajomość wyniku
Osobom, u których wykryto warianty w genie TGFBI, zazwyczaj zaleca się unikanie laserowych zabiegów refrakcyjnych (LASIK lub PRK), ponieważ mogą one nasilić złogi. W zaawansowanej chorobie przeszczep rogówki może przywrócić widzenie.
Niepełnosprawność intelektualna
- Zespół Pitta-HopkinsaAutosomalne dominujące
Schorzenie wywołane wariantami genu TCF4, które powoduje niepełnosprawność intelektualną, nieprawidłowości oddychania oraz charakterystyczne rysy twarzy.
- ClinGen ocenia związek jako: definitywne
- 5 podmiotów GenCC ocenia go jako definitywny lub silny
Dziedziczenie
- Autosomalne dominujące
- Wystarczy jedna zmieniona kopia, od któregokolwiek z rodziców. Rodzic, który ją ma, przekazuje ją każdemu dziecku z szansą jeden do dwóch.
Budowa genu TCF4
- Sekwencja kodująca
- Region nieulegający translacji
- Intron
- Kierunek transkrypcji
- Znane miejsca powodujące choroby
- Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
- Warianty z podstroną
Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.
Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.
Eksony stanowią 8 kb z 366 kb genu; 2016 z tych zasad kodują białko.
Jak test genomu odczytuje TCF4
176
pozycje w TCF4, w których ClinVar klasyfikuje zmianę jako patogenną lub prawdopodobnie patogenną
Żadne z nich nie przypada na region, który krótkie odczyty trudno odczytać.
Pełne sekwencjonowanie genomu obejmuje wszystkie 366 kb genu TCF4, łącznie z intronami, a nie tylko 8 kb eksonów.
Warianty z podstroną (16)
Warianty TCF4 z podstronami tutaj, najpierw te z największą liczbą gwiazdek recenzji. Każda podstrona opisuje publiczny zapis ClinVar dotyczący wariantu, a nie wynik.
| Wariant | HGVS c. | Ekson lub intron | Pozycja (GRCh38) | Klasyfikacja ClinVar | Status recenzji |
|---|---|---|---|---|---|
| c.990G>A | Ekson 12 | 55 261 466 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów | |
| G496C | c.1486G>T | Ekson 16 | 55 234 548 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| G592S | c.1774G>A | Ekson 18 | 55 228 952 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| G656Rfs*55 | c.1965dup | Ekson 19 | 55 228 275 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| L609P | c.1826T>C | Ekson 18 | 55 228 900 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| Q670Hfs*40 | c.2010_2011del | Ekson 19 | 55 228 229 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| R576Q | c.1727G>A | Ekson 18 | 55 228 999 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| R578H | c.1733G>A | Ekson 18 | 55 228 993 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| R580Q | c.1739G>A | Ekson 18 | 55 228 987 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| R580W | c.1738C>T | Ekson 18 | 55 228 988 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
Geny powiązane z tymi samymi schorzeniami
- CHST6carbohydrate sulfotransferase 6Wspólne schorzenie: 1
- COL17A1collagen type XVII alpha 1 chainWspólne schorzenie: 1
- COL8A2collagen type VIII alpha 2 chainWspólne schorzenie: 1
- DCNdecorinWspólne schorzenie: 1
- GRHL2grainyhead like transcription factor 2Wspólne schorzenie: 1
- GSNgelsolinWspólne schorzenie: 1
- KRT12keratin 12Wspólne schorzenie: 1
- KRT3keratin 3Wspólne schorzenie: 1
- MCOLN1mucolipin TRP cation channel 1Wspólne schorzenie: 1
- NLRP1NLR family pyrin domain containing 1Wspólne schorzenie: 1
- OVOL2ovo like zinc finger 2Wspólne schorzenie: 1
- PIKFYVEphosphoinositide kinase, FYVE-type zinc finger containingWspólne schorzenie: 1
Cechy powiązane z genem TCF4
Human Phenotype Ontology wymienia te cechy jako objawy rzadkich schorzeń, które może wywoływać TCF4. Na stronie każdej cechy znajdują się inne geny z nią powiązane.
Abnormality of the nervous system
- Intellectual disability, severe
- Repetitive movements
- Absent speech development
- Ataxia
- Difficulty finding words
- Difficulty sleeping
- Echoing another person's speech
- Global developmental delay
Pokaż jeszcze 20 cech
- Inability to speak
- Intellectual disability
- IQ between 34 and 49
- Specific learning disability
- Aplasia/Hypoplasia of the corpus callosum
- Epilepsy
- Inability to coordinate movements when walking
- Pauses in breathing while sleeping
- Small cerebral cortex
- Small hippocampus
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Aggressive behavior
- Autism spectrum disorder
- Depression
- Happy demeanor
- Self-injurious behavior
- Ventriculomegaly
- Encephalopathy
- Incoordination
- Motor delay
Abnormality of the digestive system
- Acid reflux
- Abnormal biliary tract morphology
- Constipation
- Feeding difficulties
- Inflammation of the esophagus
- Slowed or blocked flow of bile from liver
- Stomach hernia
- Abnormal large intestine physiology
Pokaż jeszcze 18 cech
- Accumulation of fluid in the abdomen
- Enlarged liver
- Hepatic fibrosis
- Scar tissue replaces healthy tissue in the liver
- Ulcerative colitis
- Abdominal pain
- Adenocarcinoma of the large intestine
- Bile duct cancer
- Celiac disease
- Chronic liver failure
- Gallstones
- Hepatocellular carcinoma
- Jaundice
- Liver inflammation
- Pancreatic inflammation
- Acute liver failure
- Enlarged colon lacking nerve cells
- Neoplasm of the gallbladder
Abnormality of head or neck
- Coarse facial features
- Deep philtrum
- Development of small head that was not present at birth
- Flared nostrils
- Sparse medial eyebrow
- Wide mouth
- Widely spaced teeth
- Abnormal dental position
Pokaż jeszcze 16 cech
- Abnormality of the palate
- Abnormally small head
- Full cheeks
- Full lips
- Narrow forehead
- Nasal tip, upturned
- Overhanging nasal tip
- Prominent nasal bridge
- Short neck
- Short philtrum
- Unerupted adult teeth
- Upward slanting of the opening between the eyelids
- Triangular nasal tip
- Fetal nuchal edema
- Open mouth
- Wide nasal bridge
Linki zewnętrzne
Rekordy genów
Transkrypt
Białko
Skąd pochodzą te dane
- HGNC: symbol genu, jego nazwa, inne symbole i położenie.
- MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
- GenCC i ClinGen, wydanie 2026-10-16: z jakimi schorzeniami gen jest powiązany i jak silne jest to powiązanie.
- Lista ACMG dotycząca wtórnych wyników, SF v3.2.
- ClinVar i stratyfikacje GIAB: znane miejsca powodujące choroby oraz regiony, które krótkie odczyty trudno odczytać.
- Human Phenotype Ontology, wersja 2026-09-01: cechy powiązane z genem. Więcej informacji znajdą Państwo na hpo.jax.org.
- Wydanie danych 2026.10.16-c6eea6bf.
Cytuj tę stronę
Dante Labs. (b.d.). Gen TCF4: transcription factor 4. Pobrano 16 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/tcf4
Dante Labs. Gen TCF4: transcription factor 4 [Internet]. [cytowano 16 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/tcf4
Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni