Genă
SPTAN1
spectrin alpha, non-erythrocytic 1
- HGNC 11273↗(se deschide într-un tab nou)
- Genă Ensembl ENSG00000197694↗(se deschide într-un tab nou)
- NCBI Gene 6709↗(se deschide într-un tab nou)
Rezumat
- Localizare citogenetică
- 9q34.11
- Coordonate
- Cromozomul 9: 128.552.587–128.633.662 (GRCh38)
- Exoni
- 57 de exoni pe 81,1 kb
- Proteină
- 2.477 de aminoacizi
- Transcriptul MANE Select
- ENST00000372739.7NM_001130438.3
- Tip de locus
- Care codifică proteine
- Foarte ridicată
- Ridicată
- Scăzută
- Foarte scăzută
Această pagină ca date
Adăugați .json la adresa paginii sau solicitați application/json pentru a o citi ca JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/sptan1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameCitiți SPTAN1 și restul genomului dumneavoastră cu un singur test.
De la 449 $Livrare gratuită · Rezultate în 6–8 săptămâni
Comandați Genome Test-ul meuRapoarte curatoriate relevante pentru această genă
Boala Charcot-Marie-Tooth
- Neuropatia motorie ereditară distală
Neuropatii ereditare care afectează în principal nervii motori, provocând slăbiciune și atrofie la nivelul mâinilor și picioarelor, inclusiv neuropatia asociată cu SORD.
- 1 transmițător GenCC o evaluează ca definitivă sau puternică
Atrofia musculară spinală
Un grup de tulburări caracterizate prin degenerarea celulelor din coarnele anterioare ale măduvei spinării, ducând la slăbiciune musculară progresivă și atrofie.
- 1 transmițător GenCC o evaluează ca definitivă sau puternică
▶Acționabilitate
Terapie genică (onasemnogen abeparvovec), terapie cu oligonucleotide antisens (nusinersen), modulator oral al splicing-ului (risdiplam), îngrijire de susținere
Grupări mai largi
Epilepsie (panel complet)
- Epilepsie
Una dintre cele 171 gene legate de ea
O tulburare cerebrală caracterizată prin episoade de descărcare neuronală anormal de intensă, care duc la episoade tranzitorii de disfuncție neurologică senzorială sau motorie ori de disfuncție psihică. Aceste episoade pot fi sau nu asociate cu pierderea cunoștinței sau cu convulsii.
- ClinGen evaluează legătura ca definitivă
- 6 de transmițători GenCC o evaluează ca definitivă sau puternică
Paraplegie spastică ereditară
- Paraplegia spastică ereditară (toate tipurile)
Una dintre cele 66 gene legate de ea
Termen generic care cuprinde toate formele de paraplegie spastică ereditară, inclusiv SPG4 (SPAST), cea mai frecventă formă dominantă, precum și SPG5A, SPG6, SPG10, SPG18, SPG30 și SPG31.
- 1 transmițător GenCC o evaluează ca definitivă sau puternică
Tulburări neurodegenerative ereditare
- Tulburare neurodegenerativă asociată cu KIF5AAutozomal dominantă
Una dintre cele 372 gene legate de ea
Cauzată de modificări ale unei copii a genei KIF5A, care codifică o proteină motorie cu o coadă de legare a cargoului. Diferite tipuri de modificări duc la afecțiuni diferite: paraplegie spastică ereditară de tip 10, o formă axonală a bolii Charcot-Marie-Tooth și scleroza laterală amiotrofică (SLA).
- 1 transmițător GenCC o evaluează ca definitivă sau puternică
▶Acționabilitate
Tratamentul este simptomatic și depinde de manifestări, incluzând kinetoterapie, medicamente antispastice și îngrijire multidisciplinară pentru SLA. Fiecare copil al unei persoane afectate are o șansă de 1 din 2 de a moșteni modificarea; consilierea genetică ajută familiile să înțeleagă acest lucru.
Neuropatii periferice ereditare rare
- Neuropatie periferică ereditară
Una dintre cele 233 gene legate de ea
Cauzată de modificări ale uneia dintre numeroasele gene necesare pentru menținerea sănătății fibrelor nervoase lungi. În acest raport, acestea includ IGHMBP2 și PLEKHG5, care sunt recesive.
- 1 transmițător GenCC o evaluează ca definitivă sau puternică
▶Acționabilitate
Fizioterapia, ortezele și terapia ocupațională ajută la menținerea mobilității, iar intervenția chirurgicală pentru deformările piciorului se efectuează atunci când este necesar. Unele forme necesită monitorizarea funcției respiratorii. Consilierea genetică ghidează testarea membrilor familiei în funcție de modelul de transmitere al genei implicate.
Structura genei SPTAN1
- Secvență codificatoare
- Regiune netranslată
- Intron
- Sensul transcripției
- Situri cunoscute asociate bolilor
- Regiuni pe care citirile scurte le găsesc dificile
Exonii transcriptului MANE Select al genei (versiunea v1.5), din NCBI și EMBL-EBI, pe genomul de referință GRCh38.
Benzile cromozomale din ideograma GRCh38 a UCSC (2022-10-29).
Genele din apropiere, din Ensembl, versiunea 116, pe GRCh38.
Exonii reprezintă 7,9 kb din cei 81,1 kb ai genei; 7.434 dintre aceste baze codifică proteina.
Secvenţiere SPTAN1
0Uşor
Cât de dificil este de secvenţiat SPTAN1 cu citiri scurte, din 100
0 · Uşor100 · Dificil
Aproape toţi exonii genei SPTAN1 se află în zone unde citirile scurte se aliniază curat.
Ce se adaugă: ponderea exonilor genei SPTAN1 din fiecare tip de regiune dificilă
- MapabilitatePorţiuni în care citirile de 100 sau 250 bp nu pot fi plasate unic, astfel încât o apelare acolo poate lipsi sau fi greşită. Pondere 35 %.0 %
- OmologieDuplicări segmentare: copii în alte zone ale genomului, cum sunt paralogii şi pseudogenele, cu identitate de 90% sau mai mare. Pondere 30 %.0 %
- RepetiţiiRepetiţii în tandem şi secvenţe de o singură bază, pe care citirile alunecă şi pe care s-ar putea să nu le acopere integral. Pondere 15 %.0 %
- Conţinut GCFerestre cu sub 25% sau peste 65% G şi C, pe care pregătirea bibliotecii le acoperă slab. Pondere 10 %.3,3 %
- Acoperire de referinţăGoluri în asamblarea de referinţă din apropiere, unde nu există secvenţă la care citirile să se alinieze. Pondere 10 %.0 %
Un scor Dante Labs din cercetarea noastră proprie, construit pe hărţile Genome in a Bottle ale NIST pentru regiunile greu de secvenţiat.Cum se calculează scorulFiecare bară reprezintă proporţia bazelor din exonii genei SPTAN1 aflate în acel tip de regiune dificilă. Oricare tip poate face singur o genă dificilă, iar fiecare tip suplimentar adaugă mai puţin: 0 când nicio bază nu se află în niciunul, 100 când fiecare bază se află acolo unde citirile nu pot fi plasate unic.
62
poziţii în SPTAN1 unde ClinVar clasifică o modificare drept patogenă sau probabil patogenă
Niciuna dintre acestea nu se află într-o regiune pe care citirile scurte o consideră dificilă.
Un genom întreg acoperă toţi cei 81,1 kb din SPTAN1, inclusiv intronii, nu doar cei 7,9 kb de exoni.
ClinVar pathogenic variants (63)
The SPTAN1 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogenă 14
- Patogenă/probabil patogenă 6
- Probabil patogenă 43
| Variantă | Conditions | Clasificare ClinVar | Stare de revizuire |
|---|---|---|---|
| NM_001130438.3(SPTAN1):c.55C>T (p.Arg19Trp) (opens in a new tab) | neuronopathy, distal hereditary motor, autosomal dominant 11 and 1 other | Patogenă/probabil patogenă | ★★★★2 stele din 4 criterii furnizate, mai mulți depunători, fără conflicte |
| NM_001130438.3(SPTAN1):c.3014G>A (p.Trp1005Ter) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 5 | Patogenă/probabil patogenă | ★★★★2 stele din 4 criterii furnizate, mai mulți depunători, fără conflicte |
| NM_001130438.3(SPTAN1):c.6616GAG[1] (p.Glu2207del) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 5 | Patogenă/probabil patogenă | ★★★★2 stele din 4 criterii furnizate, mai mulți depunători, fără conflicte |
| NM_001130438.3(SPTAN1):c.6899ACCAGCTGG[3] (p.2300DQL[3]) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 5 | Patogenă/probabil patogenă | ★★★★2 stele din 4 criterii furnizate, mai mulți depunători, fără conflicte |
| NM_001130438.3(SPTAN1):c.6899ACCAGCTGG[1] (p.2300DQL[1]) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 5 | Patogenă/probabil patogenă | ★★★★2 stele din 4 criterii furnizate, mai mulți depunători, fără conflicte |
| NM_001130438.3(SPTAN1):c.6922C>T (p.Arg2308Cys) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 5 | Patogenă/probabil patogenă | ★★★★2 stele din 4 criterii furnizate, mai mulți depunători, fără conflicte |
| NM_001130438.3(SPTAN1):c.3716A>G (p.His1239Arg) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 5 | Probabil patogenă | ★★★★2 stele din 4 criterii furnizate, mai mulți depunători, fără conflicte |
| NM_001130438.3(SPTAN1):c.4828C>T (p.Arg1610Trp) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 5 | Probabil patogenă | ★★★★2 stele din 4 criterii furnizate, mai mulți depunători, fără conflicte |
| NM_001130438.3(SPTAN1):c.6184C>T (p.Arg2062Trp) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 5 | Probabil patogenă | ★★★★2 stele din 4 criterii furnizate, mai mulți depunători, fără conflicte |
| NM_001130438.3(SPTAN1):c.6241AAG[2] (p.Lys2083del) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 5 and 1 other | Probabil patogenă | ★★★★2 stele din 4 criterii furnizate, mai mulți depunători, fără conflicte |
| NM_001130438.3(SPTAN1):c.6811G>A (p.Glu2271Lys) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 5 | Probabil patogenă | ★★★★2 stele din 4 criterii furnizate, mai mulți depunători, fără conflicte |
| NM_001130438.3(SPTAN1):c.6917GCATGC[3] (p.Arg2308_Met2309dup) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 5 | Probabil patogenă | ★★★★2 stele din 4 criterii furnizate, mai mulți depunători, fără conflicte |
| NM_001130438.3(SPTAN1):c.73C>T (p.Arg25Ter) (opens in a new tab) | developmental delay with or without epilepsy | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_001130438.3(SPTAN1):c.1033C>T (p.Gln345Ter) (opens in a new tab) | developmental delay with or without epilepsy | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_001130438.3(SPTAN1):c.1178_1200dup (p.Asp401delinsTrpLeuGlyLeuLysProCysTer) (opens in a new tab) | neuronopathy, distal hereditary motor, autosomal dominant 11 | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_001130438.3(SPTAN1):c.2848C>T (p.Arg950Ter) (opens in a new tab) | neuronopathy, distal hereditary motor, autosomal dominant 11 | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_001130438.3(SPTAN1):c.2988dup (p.Leu997fs) (opens in a new tab) | distal hereditary motor neuropathy | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_001130438.3(SPTAN1):c.3706C>T (p.Gln1236Ter) (opens in a new tab) | neuronopathy, distal hereditary motor, autosomal dominant 11 | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_001130438.3(SPTAN1):c.4343A>C (p.Gln1448Pro) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 5 | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_001130438.3(SPTAN1):c.4936C>T (p.Gln1646Ter) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 5 | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_001130438.3(SPTAN1):c.6031C>T (p.Arg2011Ter) (opens in a new tab) | hereditary spastic paraplegia | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_001130438.3(SPTAN1):c.6896_6904del (p.Trp2299_Gln2301del) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 5 | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_001130438.3(SPTAN1):c.6905_6946dup (p.Leu2302_Gln2315dup) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 5 | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_001130438.3(SPTAN1):c.6924_6929dup (p.Met2309_Gln2310insHisMet) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 5 | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_001130438.3(SPTAN1):c.7229C>T (p.Ser2410Phe) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 5 | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
See all 63 with every other SPTAN1 variant in ClinVar → (opens in a new tab)
Gene asociate acelorași afecțiuni
- BSCL2BSCL2 lipid droplet biogenesis associated, seipinAre 5 de afecțiuni în comun
- REEP1receptor accessory protein 1Are 5 de afecțiuni în comun
- ATP7AATPase copper transporting alphaAre 4 de afecțiuni în comun
- DCTN1dynactin subunit 1Are 4 de afecțiuni în comun
- DNAJB2DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B2Are 4 de afecțiuni în comun
- DYNC1H1dynein cytoplasmic 1 heavy chain 1Are 4 de afecțiuni în comun
- EMILIN1elastin microfibril interfacer 1Are 4 de afecțiuni în comun
- FBXO38F-box protein 38Are 4 de afecțiuni în comun
- GARS1glycyl-tRNA synthetase 1Are 4 de afecțiuni în comun
- HSPB8heat shock protein family B (small) member 8Are 4 de afecțiuni în comun
- IGHMBP2immunoglobulin mu DNA binding protein 2Are 4 de afecțiuni în comun
- PLEKHG5pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G5Are 4 de afecțiuni în comun
Trăsături asociate cu SPTAN1
Human Phenotype Ontology le enumeră drept caracteristici ale afecțiunilor rare pe care le poate provoca SPTAN1. Pagina fiecărei trăsături enumeră celelalte gene asociate cu aceasta.
Abnormality of the nervous system
- Abnormal gait
- Babinski sign
- Brisk knee jerk
- Clumsiness
- Decreased compound muscle action potential amplitude
- Delayed speech and language development
- Epilepsy
- High stepping
Afișați încă 46 de trăsături
- Impaired vibratory sensation
- IQ less than 20
- Jerking
- Loss of ability to walk
- Motor axonal neuropathy
- Motor delay
- Numbness
- Paroxysmal dyskinesia
- Peripheral axonal neuropathy
- Peripheral neuropathy
- Reading disability
- Reduced cerebral white matter volume
- Seizure affecting one half of brain
- Unsteady walk
- Wide based walk
- Willis-Ekbom disease
- Abnormal pyramidal sign
- Hypsarrhythmia
- Infantile spasms
- Loss of developmental milestones
- Abnormality of the nervous system
- Ataxia
- Atrophy/Degeneration affecting the brainstem
- Autism spectrum disorder
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Degeneration of cerebellum
- Intellectual disability
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Attention deficit
- Brief seizures with staring spells
- Dystonia
- EEG with frontal focal spikes
- EEG with polyspike wave complexes
- Febrile seizure (within the age range of 3 months to 6 years)
- Multifocal epileptiform discharges
- Myoclonic seizure
- Difficulty articulating speech
- Focal impaired awareness seizure
- Grand mal seizures
- Overactive lower leg reflex
- Sudden loss of muscle tone
- CNS hypomyelination
- Degeneration of cerebrum
- Epileptic encephalopathy
- Increased reflexes
- Intellectual disability, severe
Legături externe
Înregistrări ale genei
Transcript
Proteină
De unde provin aceste date
- HGNC: simbolul genei, denumirea, celelalte simboluri și localizarea.
- MANE Select v1.5, de la NCBI și EMBL-EBI: transcriptul, exonii și secvența codificatoare.
- GenCC și ClinGen, versiunea 2026-10-18: cu ce afecțiuni este asociată gena și cât de puternică este această asociere.
- Lista ACMG a rezultatelor secundare, SF v3.2.
- ClinVar și stratificările GIAB: poziții cunoscute asociate bolilor și regiunile în care citirile scurte întâmpină dificultăți.
- Stratificările genomului Genome in a Bottle, de la NIST: scorul de dificultate a secvențierii.
- Human Phenotype Ontology, versiunea 2026-09-01: trăsăturile asociate genei. Aflați mai multe la hpo.jax.org.
- Versiunea datelor 2026.10.18-8b139e39.
Citează această pagină
Dante Labs. (s.a.). Gena SPTAN1: spectrin alpha, non-erythrocytic 1. Accesat 18 octombrie 2026, de la https://dantelabs.com/ro/genes/sptan1
Dante Labs. Gena SPTAN1: spectrin alpha, non-erythrocytic 1 [Internet]. [citat 18 octombrie 2026]. Disponibil la: https://dantelabs.com/ro/genes/sptan1
Un test. Răspunsuri pentru o viață.
De la 449 $Livrare gratuită · Rezultate în 6–8 săptămâni