Gen
SPTAN1
spectrin alpha, non-erythrocytic 1
- HGNC 11273↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000197694↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 6709↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 9q34.11
- Koordinater
- Kromosom 9: 128 552 587–128 633 662 (GRCh38)
- Exoner
- 57 exoner på 81,1 kb
- Protein
- 2 477 aminosyror
- MANE Select-transkript
- ENST00000372739.7NM_001130438.3
- Lokustyp
- gene with protein product
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
ReferensgenomGRCh38hg38
Positioner på gen- och variantsidorna följer det här valet, i den här webbläsaren.
Läs SPTAN1, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterade rapporter som är relevanta för denna gen
Charcot-Marie-Tooth-sjukdom
- Distal hereditär motorisk neuropati
Ärftliga neuropatier som främst påverkar motoriska nerver och ger svaghet och muskelatrofi i händer och fötter, inklusive SORD-relaterad neuropati.
- 1 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Spinal muskelatrofi
En grupp sjukdomar som kännetecknas av degeneration av främre hornceller i ryggmärgen, vilket leder till progressiv muskelsvaghet och muskelatrofi.
- 1 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Vad kunskapen förändrar
Genterapi (onasemnogenabeparvovec), antisensoligonukleotidbehandling (nusinersen), oral splicingmodifierare (risdiplam), understödjande vård
Bredare grupperingar
Epilepsi (fullständig panel)
- Epilepsi
En av 171 gener kopplade till den
En hjärnsjukdom som kännetecknas av episoder med onormalt ökad neuronal urladdning, vilket ger övergående episoder av sensoriska eller motoriska neurologiska störningar eller psykiska störningar. Dessa episoder kan, men behöver inte, vara förknippade med medvetslöshet eller krampanfall.
- ClinGen bedömer kopplingen som definitiv
- 6 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Hereditär spastisk paraplegi
- Hereditär spastisk paraplegi (alla typer)
En av 66 gener kopplade till den
Samlingsbegrepp för alla hereditära spastiska paraplegier, inklusive SPG4 (SPAST), den vanligaste dominanta formen, samt SPG5A, SPG6, SPG10, SPG18, SPG30 och SPG31.
- 1 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Så är SPTAN1 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 7,9 kb av genens 81,1 kb, och 7 434 av dessa baser kodar för proteinet.
Så läser ett genomtest SPTAN1
62
positioner i SPTAN1 där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
Inget av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.
En helgenomsanalys täcker alla 81,1 kb av SPTAN1, med introner inräknade, inte bara de 7,9 kb exoner.
Gener kopplade till samma tillstånd
- BSCL2BSCL2 lipid droplet biogenesis associated, seipinDelar 3 tillstånd
- REEP1receptor accessory protein 1Delar 3 tillstånd
- ATP7AATPase copper transporting alphaDelar 2 tillstånd
- DCTN1dynactin subunit 1Delar 2 tillstånd
- DNAJB2DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B2Delar 2 tillstånd
- DYNC1H1dynein cytoplasmic 1 heavy chain 1Delar 2 tillstånd
- EMILIN1elastin microfibril interfacer 1Delar 2 tillstånd
- FBXO38F-box protein 38Delar 2 tillstånd
- GARS1glycyl-tRNA synthetase 1Delar 2 tillstånd
- HACE1HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1Delar 2 tillstånd
- HSPB8heat shock protein family B (small) member 8Delar 2 tillstånd
- IGHMBP2immunoglobulin mu DNA binding protein 2Delar 2 tillstånd
Egenskaper kopplade till SPTAN1
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som SPTAN1 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Abnormality of the nervous system
- Abnormal gait
- Babinski sign
- Brisk knee jerk
- Clumsiness
- Decreased compound muscle action potential amplitude
- Delayed speech and language development
- Epilepsy
- High stepping
Visa ytterligare 46 egenskaper
- Impaired vibratory sensation
- IQ less than 20
- Jerking
- Loss of ability to walk
- Motor axonal neuropathy
- Motor delay
- Numbness
- Paroxysmal dyskinesia
- Peripheral axonal neuropathy
- Peripheral neuropathy
- Reading disability
- Reduced cerebral white matter volume
- Seizure affecting one half of brain
- Unsteady walk
- Wide based walk
- Willis-Ekbom disease
- Abnormal pyramidal sign
- Hypsarrhythmia
- Infantile spasms
- Loss of developmental milestones
- Abnormality of the nervous system
- Ataxia
- Atrophy/Degeneration affecting the brainstem
- Autism spectrum disorder
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Degeneration of cerebellum
- Intellectual disability
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Attention deficit
- Brief seizures with staring spells
- Dystonia
- EEG with frontal focal spikes
- EEG with polyspike wave complexes
- Febrile seizure (within the age range of 3 months to 6 years)
- Multifocal epileptiform discharges
- Myoclonic seizure
- Difficulty articulating speech
- Focal impaired awareness seizure
- Grand mal seizures
- Overactive lower leg reflex
- Sudden loss of muscle tone
- CNS hypomyelination
- Degeneration of cerebrum
- Epileptic encephalopathy
- Increased reflexes
- Intellectual disability, severe
Abnormality of the musculoskeletal system
- Difficulty walking up stairs
- Distal lower limb amyotrophy
- Double-Jointed
- Frequent falls
- Low muscle tone
- Pigeon chest
- Scoliosis
- Spastic tetraplegia
Visa ytterligare 5 egenskaper
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppt 2026-10-16: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt kopplingen är.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsorsakande positioner och de regioner där korta läsningar har svårt.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.16-c6eea6bf.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). SPTAN1-genen: spectrin alpha, non-erythrocytic 1. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/sptan1
Dante Labs. SPTAN1-genen: spectrin alpha, non-erythrocytic 1 [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/sptan1
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor