Genas
SPTAN1
spectrin alpha, non-erythrocytic 1
- HGNC 11273↗(atsidaro naujame skirtuke)
- Ensembl genas ENSG00000197694↗(atsidaro naujame skirtuke)
- NCBI Gene 6709↗(atsidaro naujame skirtuke)
Santrauka
- Citogenetinė vieta
- 9q34.11
- Koordinatės
- Chromosoma 9: 128 552 587–128 633 662 (GRCh38)
- Eksonai
- 57 eksonų per 81,1 kb
- Baltymas
- 2 477 aminorūgščių
- MANE Select transkriptas
- ENST00000372739.7NM_001130438.3
- Lokuso tipas
- Baltymus koduojantys
- Labai aukštas
- Patikimas
- Žemas
- Labai žemas
Ši puslapis kaip duomenys
Norėdami perskaityti jį kaip JSON, pridėkite .json prie puslapio adreso arba nurodykite application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/sptan1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePerskaitykite SPTAN1 ir likusį savo genomą su vienu tyrimu.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites
Įsigyti savo Genome TestKuruotos ataskaitos, susijusios su šiuo genu
Charcot-Marie-Tooth liga
- Distalinė paveldima motorinė neuropatija
Paveldėtos neuropatijos, daugiausia pažeidžiančios motorinius nervus ir sukeliančios rankų bei kojų silpnumą ir nykimą, įskaitant su SORD susijusią neuropatiją.
- 1 GenCC pateikėjas vertina jį kaip definityvų arba stiprų
Spinalinė raumenų atrofija
Ligų grupė, kuriai būdinga nugarinio smegenų kaulo priekinių ragų ląstelių degeneracija, sukelianti progresuojantį raumenų silpnumą ir atrofiją.
- 1 GenCC pateikėjas vertina jį kaip definityvų arba stiprų
▶Veiksmingumas
Genų terapija (onasemnogenas abeparvovekas), antisensinių oligonukleotidų terapija (nusinersenas), geriamasis splaisingą modifikuojantis vaistas (risdiplamas), palaikomoji priežiūra
Platesnės grupės
Epilepsija (pilnas tyrimas)
- Epilepsija
Susijusi su 171 genu
Smegenų sutrikimas, pasireiškiantis epizodais, kai neuronai nenormaliai intensyviai išsikrauna, dėl ko atsiranda trumpalaikiai jutimo ar judesio neurologinio funkcijos sutrikimo arba psichikos funkcijos sutrikimo epizodai. Šie epizodai gali būti susiję arba nesusiję su sąmonės netekimu ar traukuliais.
- ClinGen vertina ryšį kaip definityvų
- 6 GenCC pateikėjų vertina jį kaip definityvų arba stiprų
Paveldima spastinė paraplegija
- Paveldimos spastinės paraplegijos (visi tipai)
Vienas iš 66 su juo susijusių genų
Bendras terminas, apimantis visas paveldimas spastines paraplegijas, įskaitant SPG4 (SPAST) – dažniausią dominuojančią formą – taip pat SPG5A, SPG6, SPG10, SPG18, SPG30 ir SPG31.
- 1 GenCC pateikėjas vertina jį kaip definityvų arba stiprų
Kaip išdėstytas SPTAN1
- Koduojanti seka
- Netransliuojama sritis
- Intronas
- Transkripcijos kryptis
- Žinomos su liga susijusios vietos
- Ruožai, kuriuos trumpi skaitiniai sunkiai aptinka
Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.
Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).
Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.
Eksonai sudaro 7,9 kb iš 81,1 kb geno; 7 434 šių bazių koduoja baltymą.
Sekoskaita: SPTAN1
0Maža
Kiek sunku sekti SPTAN1 trumpaisiais skaitiniais, iš 100Kiekvienas stulpelis rodo SPTAN1 egzonų bazių dalį tokio tipo sunkiuose regionuose. Balas juos sveria pagal tai, kiek kiekvienas iš jų apsunkina trumpųjų skaitinių iškvietimą: 0, kai nė viena bazė nepatenka į jokį regioną, 100, kai kiekviena bazė patenka į visus jų.
- Atvaizdavimas į genomąRuožai, kuriuose 100 arba 250 bp skaitinių negali būti vienareikšmiškai įtvirtinti, todėl ten esantis rezultatas gali būti nerastas arba klaidingas. Svoris: 35 %.0 %
- HomologijaSegmentinės dublikacijos: kopijos kituose genomo vietose, pavyzdžiui paralogai ir pseudogenai, kai tapatumas 90 % ar didesnis. Svoris: 30 %.0 %
- PasikartojimaiTandeminiai pasikartojimai ir vieno nukleotido serijos, kuriose skaitiniai slysta ir gali neapimti. Svoris: 15 %.0 %
- GC kiekisLangai, kurių GC kiekis yra mažesnis nei 25 % arba didesnis nei 65 %, ir kuriuos bibliotekos paruošimas apima silpnai. Svoris: 10 %.3,3 %
- Nuorodinio genomo aprėptisSpragos nuorodinėje sekoje šalia, kur nėra sekos, prie kurios trumpieji skaitiniai galėtų prisijungti. Svoris: 10 %.0 %
62
SPTAN1 pozicijos, kuriose ClinVar pakitimą klasifikuoja kaip patogeninį arba greičiausiai patogeninį
Nė viena iš jų nepatenka į sritį, kurią trumpieji skaitiniai sunkiai aptinka.
Visas genomo sekoskaita apima visus 81,1 kb geno SPTAN1, įskaitant intronus, o ne tik 7,9 kb eksonų.
Genai, susieti su tomis pačiomis būklėmis
- BSCL2BSCL2 lipid droplet biogenesis associated, seipinTuri 3 bendrų būklių
- REEP1receptor accessory protein 1Turi 3 bendrų būklių
- ATP7AATPase copper transporting alphaTuri 2 bendrų būklių
- DCTN1dynactin subunit 1Turi 2 bendrų būklių
- DNAJB2DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B2Turi 2 bendrų būklių
- DYNC1H1dynein cytoplasmic 1 heavy chain 1Turi 2 bendrų būklių
- EMILIN1elastin microfibril interfacer 1Turi 2 bendrų būklių
- FBXO38F-box protein 38Turi 2 bendrų būklių
- GARS1glycyl-tRNA synthetase 1Turi 2 bendrų būklių
- HACE1HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1Turi 2 bendrų būklių
- HSPB8heat shock protein family B (small) member 8Turi 2 bendrų būklių
- IGHMBP2immunoglobulin mu DNA binding protein 2Turi 2 bendrų būklių
Savybės, susijusios su SPTAN1
Žmogaus fenotipų ontologija šias savybes nurodo kaip retų ligų, kurias gali sukelti SPTAN1, požymius. Kiekvienos savybės puslapyje nurodyti kiti su ja susiję genai.
Abnormality of the nervous system
- Abnormal gait
- Babinski sign
- Brisk knee jerk
- Clumsiness
- Decreased compound muscle action potential amplitude
- Delayed speech and language development
- Epilepsy
- High stepping
Rodyti dar 46 savybių
- Impaired vibratory sensation
- IQ less than 20
- Jerking
- Loss of ability to walk
- Motor axonal neuropathy
- Motor delay
- Numbness
- Paroxysmal dyskinesia
- Peripheral axonal neuropathy
- Peripheral neuropathy
- Reading disability
- Reduced cerebral white matter volume
- Seizure affecting one half of brain
- Unsteady walk
- Wide based walk
- Willis-Ekbom disease
- Abnormal pyramidal sign
- Hypsarrhythmia
- Infantile spasms
- Loss of developmental milestones
- Abnormality of the nervous system
- Ataxia
- Atrophy/Degeneration affecting the brainstem
- Autism spectrum disorder
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Degeneration of cerebellum
- Intellectual disability
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Attention deficit
- Brief seizures with staring spells
- Dystonia
- EEG with frontal focal spikes
- EEG with polyspike wave complexes
- Febrile seizure (within the age range of 3 months to 6 years)
- Multifocal epileptiform discharges
- Myoclonic seizure
- Difficulty articulating speech
- Focal impaired awareness seizure
- Grand mal seizures
- Overactive lower leg reflex
- Sudden loss of muscle tone
- CNS hypomyelination
- Degeneration of cerebrum
- Epileptic encephalopathy
- Increased reflexes
- Intellectual disability, severe
Išorinės nuorodos
Geno įrašai
Transkriptas
Baltymas
Iš kur tai paimta
- HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
- MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo egzonai ir koduojanti seka.
- GenCC ir ClinGen, išleista 2026-10-17: su kokiomis ligomis genas siejamas ir kaip stipriai.
- ACMG antrinių radinių sąrašas, SF v3.2.
- ClinVar ir GIAB stratifikacijos: žinomos ligas sukeliančios vietos ir regionai, kuriuos trumpieji skaitiniai sunkiai nustato.
- Genome in a Bottle genomo stratifikacijos iš NIST: sekoskaitos sunkumo balas.
- Žmogaus fenotipų ontologija, versija 2026-09-01: su genu susijusios savybės. Daugiau informacijos rasite hpo.jax.org.
- Duomenų išleidimas 2026.10.18-e609d43e.
Cituoti šį puslapį
Dante Labs. (be datos). SPTAN1 genas: spectrin alpha, non-erythrocytic 1. Pasiekta 2026 m. spalio 18 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/sptan1
Dante Labs. SPTAN1 genas: spectrin alpha, non-erythrocytic 1 [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 18 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/sptan1
Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites