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Gène

GPC3

glypican 3

Résumé

Localisation cytogénétique
Xq26.2
Coordonnées
Chromosome X : 133 535 745–133 985 594 (GRCh38)
Exons
8 exons sur 449,9 kb
Protéine
580 acides aminés
Aussi appelé
OCI-5, SGBS, SGBS1, SGB, DGSX
Symboles précédents
SDYS
Transcrit MANE Select
ENST00000370818.8NM_004484.4
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

Les positions sur les pages de gènes et de variants suivent ce choix, dans ce navigateur.

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore GPC3. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de GPC3

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Sites connus associés à une maladie
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome X, avec un crochet à l'emplacement de GPC3. GPC3 et 5 gènes à proximité sur le chromosome X, de 133 085 895 à 134 435 444.Chromosome XXq26.2p22.33p22.32p22.31p22.2p22.13p22.12p22.11p21.3p21.2p21.1p11.4p11.3p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.3q23q24q25q26.1q26.2q26.3q27.1q27.2q27.3q28133,2 Mb133,4 Mb133,6 Mb133,8 Mb134 Mb134,2 Mb134,4 MbUSP26 : 133 023 168–133 097 109, brin inverseUSP26TFDP3 : 133 216 662–133 218 354, brin inverseTFDP3GPC4 : 133 298 158–133 416 214, brin inverseGPC4GPC3 : 133 535 745–133 985 594, brin inverseGPC3CCDC160 : 134 237 047–134 247 585, brin directCCDC160PHF6 : 134 373 284–134 428 792, brin directPHF6Schéma de GPC3 : 8 exons sur le brin inverse du chromosome XExon 8 : 2 sites connus associés à une maladieExon 7 : 5 sites connus associés à une maladieExon 6 : 5 sites connus associés à une maladieExon 5 : 2 sites connus associés à une maladieExon 4 : 2 sites connus associés à une maladieExon 3 : 14 sites connus associés à une maladieExon 2 : 6 sites connus associés à une maladieExon 1 : 4 sites connus associés à une maladieExon 8 : 133 535 745–133 536 293, 549 basesExon 7 : 133 596 440–133 596 599, 160 basesExon 6 : 133 661 730–133 661 850, 121 basesExon 5 : 133 692 369–133 692 494, 126 basesExon 4 : 133 699 895–133 700 028, 134 basesExon 3 : 133 753 482–133 754 176, 695 basesExon 2 : 133 953 050–133 953 211, 162 basesExon 1 : 133 985 275–133 985 594, 320 bases876543215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 2,3 kb sur les 449,9 kb du gène ; 1 743 de ces bases codent pour la protéine.

Comment un test génomique lit GPC3

47

positions dans GPC3 où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène

Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

Un génome entier couvre les 449,9 kb de GPC3, introns compris, et pas seulement les 2,3 kb d'exons.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
  • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

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Dante Labs. (s.d.). Gène GPC3 : glypican 3. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/gpc3

Vancouver

Dante Labs. Gène GPC3 : glypican 3 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/gpc3

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