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Gène

GPC4

glypican 4

Résumé

Localisation cytogénétique
Xq26.2
Coordonnées
Chromosome X : 133 300 103–133 415 489 (GRCh38)
Exons
9 exons sur 115,4 kb
Protéine
556 acides aminés
Aussi appelé
K-glypican
Transcrit MANE Select
ENST00000370828.4NM_001448.3
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

Les positions sur les pages de gènes et de variants suivent ce choix, dans ce navigateur.

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore GPC4. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de GPC4

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Sites connus associés à une maladie
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome X, avec un crochet à l'emplacement de GPC4. GPC4 et 4 gènes à proximité sur le chromosome X, de 132 857 796 à 133 857 795.Chromosome XXq26.2p22.33p22.32p22.31p22.2p22.13p22.12p22.11p21.3p21.2p21.1p11.4p11.3p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.3q23q24q25q26.1q26.2q26.3q27.1q27.2q27.3q28133 Mb133,2 Mb133,4 Mb133,6 Mb133,8 MbHS6ST2 : 132 626 015–132 961 395, brin inverseHS6ST2USP26 : 133 023 168–133 097 109, brin inverseUSP26TFDP3 : 133 216 662–133 218 354, brin inverseTFDP3GPC4 : 133 300 103–133 415 489, brin inverseGPC4GPC3 : 133 535 745–133 987 100, brin inverseGPC3Schéma de GPC4 : 9 exons sur le brin inverse du chromosome XExon 9 : 4 sites connus associés à une maladieExon 9 : 133 300 103–133 303 069, 2 967 basesExon 8 : 133 303 166–133 303 341, 176 basesExon 7 : 133 304 725–133 304 861, 137 basesExon 6 : 133 305 772–133 305 918, 147 basesExon 5 : 133 306 024–133 306 154, 131 basesExon 4 : 133 311 258–133 311 423, 166 basesExon 3 : 133 324 145–133 324 536, 392 basesExon 2 : 133 339 183–133 339 341, 159 basesExon 1 : 133 414 806–133 415 489, 684 bases9515′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 5 kb sur les 115,4 kb du gène ; 1 671 de ces bases codent pour la protéine.

Comment un test génomique lit GPC4

4

positions dans GPC4 où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène

Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

Un génome entier couvre les 115,4 kb de GPC4, introns compris, et pas seulement les 5 kb d'exons.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
  • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gène GPC4 : glypican 4. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/gpc4

Vancouver

Dante Labs. Gène GPC4 : glypican 4 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/gpc4

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