Geeni
WT1
WT1 transcription factor
- HGNC 12796↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000184937↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 7490↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 11p13
- Koordinaatit
- Kromosomi 11: 32 387 775–32 435 539 (GRCh38)
- Eksonit
- 10 eksonia 47,8 kb:n alueella
- Proteiini
- 522 aminohappoa
- Tunnetaan myös nimellä
- WAGR, WIT-2, AWT1, NPHS4, WT-1
- Aiemmat symbolit
- GUD
- MANE Select -transkripti
- ENST00000452863.10NM_024426.6
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue WT1 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja
46,XY-sukupuolikehityksen erot ja gonadidysgenesis
- 46,XY-sukupuolikehityksen erot
XY-kromosomistoisilla henkilöillä esiintyvät sairaudet, joissa sukurauhasten tai sukupuolielinten kehitys poikkeaa tavanomaisesta. Ne aiheutuvat geenivariantista, kuten SRD5A2-, HSD17B3-, NR5A1-, MAP3K1-, DHH-, WT1-, CYP11A1- tai LHCGR-geenissä.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 2 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
Diagnoosi ohjaa hormonihoitoa, hedelmällisyysneuvontaa ja, jos dysgeneettisissä sukurauhasissa on Y-kromosomin aineksia, sukurauhaskasvainten riskin arviointia.
Perinnöllinen Wilmsin kasvain
Perinnöllinen alttius Wilmsin kasvaimelle (nefroblastoomalle), mukaan lukien WT1- ja REST-geeniin liittyvät muodot.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 3 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelossa
Mitä tieto muuttaa
Säännöllinen munuaisten ultraäänitutkimus pienellä iällä auttaa löytämään kasvaimet varhain. WT1-geenin kantajilla voidaan myös tarvita munuaisten toiminnan ja sukupuolirauhasten tarkastuksia.
WT1-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
- Variantit, joilla on sivu
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 3 kb geenin 47,8 kb:stä; 1 569 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä WT1
112
WT1-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 47,8 kb geenistä WT1, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 3 kb eksoneja.
Variantit, joilla on sivu (19)
Tässä ovat WT1-variantit, joilla on sivu, eniten arvostelutähtiä saaneet ensin. Jokainen sivu kuvaa ClinVarin julkista tietuetta variantista, ei koskaan tulosta.
| Variantti | HGVS c. | Eksoni tai introni | Sijainti (GRCh38) | ClinVar-luokitus | Arvioinnin tila |
|---|---|---|---|---|---|
| c.965+1G>A | Introni 4 | 32 417 576 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★2 tähteä neljästä kriteerit annettu, useita lähettäjiä, ei ristiriitoja | |
| c.1447+4C>T1432+4C>T | Introni 9 | 32 391 968 | Patogeeninen | ★★★★2 tähteä neljästä kriteerit annettu, useita lähettäjiä, ei ristiriitoja | |
| c.1447+5G>A1432+5G>A | Introni 9 | 32 391 967 | Patogeeninen | ★★★★2 tähteä neljästä kriteerit annettu, useita lähettäjiä, ei ristiriitoja | |
| c.1448-1G>A | Introni 9 | 32 389 180 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★2 tähteä neljästä kriteerit annettu, useita lähettäjiä, ei ristiriitoja | |
| G152Afs*11 | c.455del | Eksoni 1 | 32 434 905 | Patogeeninen/todennäköisesti patogeeninen | ★★★★2 tähteä neljästä kriteerit annettu, useita lähettäjiä, ei ristiriitoja |
| H446Q | c.1338C>A | Eksoni 8 | 32 392 682 | Patogeeninen | ★★★★2 tähteä neljästä kriteerit annettu, useita lähettäjiä, ei ristiriitoja |
| H450Y | c.1348C>T | Eksoni 8 | 32 392 672 | Patogeeninen/todennäköisesti patogeeninen | ★★★★2 tähteä neljästä kriteerit annettu, useita lähettäjiä, ei ristiriitoja |
| P137Rfs*26 | c.410del | Eksoni 1 | 32 434 950 | Patogeeninen/todennäköisesti patogeeninen | ★★★★2 tähteä neljästä kriteerit annettu, useita lähettäjiä, ei ristiriitoja |
| Q462X | c.1384C>T | Eksoni 9 | 32 392 035 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★2 tähteä neljästä kriteerit annettu, useita lähettäjiä, ei ristiriitoja |
| R374X | c.1120C>T | Eksoni 7 | 32 396 401 | Patogeeninen | ★★★★2 tähteä neljästä kriteerit annettu, useita lähettäjiä, ei ristiriitoja |
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- ARandrogen receptorYhteinen sairaus: 1
- ATRXATRX chromatin remodelerYhteinen sairaus: 1
- CYP11A1cytochrome P450 family 11 subfamily A member 1Yhteinen sairaus: 1
- DHHdesert hedgehog signaling moleculeYhteinen sairaus: 1
- DMRT1doublesex and mab-3 related transcription factor 1Yhteinen sairaus: 1
- GATA4GATA binding protein 4Yhteinen sairaus: 1
- HHAThedgehog acyltransferaseYhteinen sairaus: 1
- HSD17B3hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 3Yhteinen sairaus: 1
- MAP3K1mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1Yhteinen sairaus: 1
- NR5A1nuclear receptor subfamily 5 group A member 1Yhteinen sairaus: 1
- RESTRE1 silencing transcription factorYhteinen sairaus: 1
- SRD5A2steroid 5 alpha-reductase 2Yhteinen sairaus: 1
Geeniin WT1 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita WT1 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the genitourinary system
- Ambiguous genitalia in males
- Diffuse mesangial sclerosis
- Double uterus
- Double vagina
- Enlarged kidney
- Focal segmental glomerulosclerosis
- Glomerulopathy
- Gonadal dysgenesis
Näytä 53 piirrettä lisää
- Male pseudohermaphroditism
- Nephrotic syndrome
- Ovarian gonadoblastoma
- Primary amenorrhea
- Stage 5 chronic kidney disease
- Abnormal fallopian tube morphology
- Abnormal internal genitalia
- Abnormal labia morphology
- Abnormal scrotum morphology
- Abnormal sex determination
- Abnormal vagina morphology
- Abnormally closed or absent vagina
- Absent sperm in semen
- Ambiguous external genitalia
- Decreased fertility in females
- Decreased testicular size
- Dysplastic testis
- Enlarged clitoris
- Female external genitalia in individual with 46,XY karyotype
- Gonadal dysgenesis with female appearance, male
- Hypospadias
- Kidney damage
- Male infertility
- Nephroblastoma
- Polycystic ovaries
- Short penis
- Streak ovary
- Underdeveloped penis
- Underdeveloped vagina
- Urogenital sinus anomaly
- Vanishing testis
- Chronic kidney disease
- Displacement of the urethral meatus
- Gonadoblastoma
- Hydrometrocolpos
- Renal failure
- Undescended testes
- Abnormal kidney location
- Abnormal uterus morphology
- Abnormality of the uterus
- Blind vagina
- Crossed fused renal ectopia
- Ectopic testis
- Heart shaped uterus
- Horseshoe kidney
- Minimal change glomerulonephritis
- Ovarian cancer
- Testicular cancer
- Testicular gonadoblastoma
- Varicocele
- Atypical appearance of female genitals
- Gonadal tissue inappropriate for external genitalia or chromosomal sex
- True hermaphroditism
Abnormality of the cardiovascular system
- Retinal vascular tortuosity
- Swollen lymph nodes
- High blood pressure
- Swollen lymph nodes in center of chest
- Underdeveloped left heart
- Abnormality of the spleen
- Accessory spleen
- All organs on wrong side of body
Näytä 18 piirrettä lisää
- An opening in the wall separating the top two chambers of the heart
- Anomalous pulmonary venous return
- Aortic valve has two leaflets rather than three
- Cardiac total anomalous pulmonary venous connection
- Common atrium
- Conotruncal defect
- Heart tip and four chambers point towards right side of body
- Hole in heart wall separating two lower heart chambers
- Narrowing of aorta
- Narrowing of aortic valve
- Partial anomalous pulmonary venous return
- Patent ductus arteriosus
- Persistent left superior vena cava
- Right aortic arch
- Scimitar anomaly
- Tetralogy of Fallot
- Transposition of the great arteries
- Abnormal cardiovascular system morphology
Abnormality of the eye
- Absent iris
- Anterior subcapsular cataract
- Chorioretinal hypopigmentation
- Damage to outer layer of the cornea of the eye
- Displaced pupil
- Drooping of both upper eyelids
- Hypoplasia of the fovea
- Outward facing eye ball
Näytä 13 piirrettä lisää
Abnormality of the digestive system
- Abdominal bloating
- Abdominal mass
- Abdominal pain
- Abnormal peritoneum morphology
- Duplication of renal pelvis
- Enlarged liver
- Ileus
- Nausea and vomiting
Näytä 4 piirrettä lisää
Abnormality of the endocrine system
- Decreased serum estradiol
- Decreased serum testosterone level
- Elevated circulating follicle stimulating hormone level
- Elevated circulating luteinizing hormone level
- Hypergonadotropic hypogonadism
- Hypogonadotropic hypogonadism
- Increased circulating gonadotropin level
- Delayed puberty
Näytä 3 piirrettä lisää
Laboratory abnormality
- High urine protein levels
- Fluid retention
- Bloody urine
- Fever
- Foamy urine
- High blood calcium levels
- Low albumin
- Small amount of blood in urine
Näytä 2 piirrettä lisää
Abnormality of the respiratory system
- Neonatal respiratory distress
- Absent/small lungs
- Abnormal lung lobation
- Poorly developed lungs
- Pulmonary sequestration
- Congenital alveolar dysplasia
- Lung cancer
- Respiratory tract infection
Näytä 1 piirre lisää
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). WT1-geeni: WT1 transcription factor. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/wt1
Dante Labs. WT1-geeni: WT1 transcription factor [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/wt1
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa