Geen
PIGA
phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class A
- HGNC 8957↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000165195↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 5277↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- Xp22.2
- Koordinaadid
- Kromosoom X: 15 319 456–15 335 523 (GRCh38)
- Eksonid
- 6 eksonit, ulatus 16,1 kb
- Valk
- 484 aminohapet
- Pärilikkus
- X-seotud retsessiivne
- Tuntud ka kui
- GPI3, PIG-A
- MANE Select transkript
- ENST00000333590.6NM_002641.4
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
VõrdlusgenoomGRCh38hg38
Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.
Loe PIGA ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanded
GPI-ankurdumise biosünteesi defektid
- PIGA-ga seotud mitmete kaasasündinud anomaaliate, hüpotoonia ja krampide sündroom (MCAHS2)X-seotud retsessiivne
X-seotud GPI-ankru defekt, mida põhjustavad pärilikud või uued idurakuvariandid geenis PIGA. Haigestuvad peamiselt poisid. Iseloomulik on varajases eas algav epilepsia, madal lihastoonus ja arengu viivitus.
- 3 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
- Mitmete kaasasündinud anomaaliate, hüpotoonia ja krampide sündroom
GPI-ankru defektide rühm (PIGN, PIGA, PIGT, PIGQ ja nendega seotud geenid), mille korral esineb madal lihastoonus, krambid, arengu viivitus ja kaasasündinud anomaaliad.
- 3 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
- GPI-ankurdumise biosünteesi häired
Pärilike seisundite rühm, mida põhjustavad GPI ankru moodustamiseks ja kinnitamiseks vajalike geenide PIG, PGAP ja nendega seotud geenide variandid. Tavaliselt kaasnevad arengu viivitus, madal lihastoonus ja epilepsia.
- 3 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Laiemad rühmad
Glükosüleerimise kaasasündinud häired
- Glükosüleerimise kaasasündinud häired (CDG)
Üks 98 sellega seotud geenist
Suur rühm pärilikke haigusi, mille puhul suhkruahelad (glükaanid) ei moodustu ega kinnitu valkudele ja lipiididele õigesti; need mõjutavad sageli aju, maksa, vere hüübimist, kasvu ja paljusid teisi elundisüsteeme. Enamik neist on autosomaalselt retsessiivse pärilikkusega, kuid osa on X-seotud või autosomaalselt dominantse pärilikkusega.
- 3 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Epilepsia (täielik paneel)
- Epilepsia
Üks 171 sellega seotud geenist
Ajuhaigus, mida iseloomustavad ebanormaalselt suurenenud neuronite aktiivsuse episoodid, mis põhjustavad ajutisi sensoorse või motoorse neuroloogilise talitlushäire või psüühilise talitlushäire episoode. Need episoodid võivad olla seotud teadvuse kaotuse või krampidega, aga ei pruugi.
- 3 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Pärandumine
- X-seotud retsessiivne
- Muutus on X-kromosoomis, seega mõjutab üks koopia isaseid, kellel on üks X-kromosoom, samas kui ühe koopiaga emased on tavaliselt kandjad. Kandjast ema annab selle igale lapsele kahe võimalusest ühe tõenäosusega.
Kuidas PIGA on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 3,6 kb kogupikkusega 16,1 kb; neist 1455 alust kodeerivad valku.
Kuidas genoomitest loetakse PIGA
22
kohad geenis PIGA, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist 8 (36%) asuvad lõikudes, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.
- Segmental duplications (8 kohta)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni PIGA 16,1 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (3,6 kb).
Samade haigustega seotud geenid
- PIGNphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class NJagab 3 haigust
- PIGQphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class QJagab 3 haigust
- PIGTphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class TJagab 3 haigust
- ALG13ALG13 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitJagab 2 haigust
- ATP6AP2ATPase H+ transporting accessory protein 2Jagab 2 haigust
- CADcarbamoyl-phosphate synthetase 2, aspartate transcarbamylase, and dihydroorotaseJagab 2 haigust
- KCTD7potassium channel tetramerization domain containing 7Jagab 2 haigust
- NUS1NUS1 dehydrodolichyl diphosphate synthase subunitJagab 2 haigust
- PGAP2post-GPI attachment to proteins 2Jagab 2 haigust
- PGAP3post-GPI attachment to proteins phospholipase 3Jagab 2 haigust
- PIGBphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class BJagab 2 haigust
- PIGGphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class G (EMM blood group)Jagab 2 haigust
Geeniga PIGA seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida PIGA võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of the nervous system
- Abnormal cerebral white matter morphology
- Absent septum pellucidum
- Absent speech development
- Absent/small cerebral white matter
- Aplasia/Hypoplasia of the corpus callosum
- Arrhinencephaly
- Autism
- Babinski sign
Näita veel 64 tunnust
- Brisk reflexes
- Cerebral white matter hypoplasia
- CNS hypomyelination
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Degeneration of cerebellum
- Degeneration of cerebrum
- Diffuse leukoencephalopathy
- Dystonia
- EEG with burst suppression
- EEG with generalized polyspikes
- Encephalopathy
- Epilepsy
- Epileptic encephalopathy
- Exaggerated startle response
- Febrile seizure (within the age range of 3 months to 6 years)
- Focal clonic seizure
- Focal seizure with eyelid myoclonia
- Generalized myoclonic seizure
- Generalized tonic seizure
- Generalized-onset seizure
- Gliosis
- Global developmental delay
- Grand mal seizures
- Grasp reflex
- Head titubation
- Hypsarrhythmia
- Inability to walk
- Increased reflexes
- Instability or lack of coordination of central trunk muscles
- IQ between 34 and 49
- IQ less than 20
- Jerking
- Loss of brain cells
- Loss of developmental milestones
- Motor delay
- Neuronal loss in the cerebral cortex
- Paralysis of all four limbs
- Poor eye contact
- Postural tremor
- Profound global developmental delay
- Repeated seizures without recovery between them
- Small cerebellum
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Ventriculomegaly
- Widened subarachnoid space
- Cognitive impairment
- Infantile spasms
- Multifocal epileptiform discharges
- Neurodevelopmental delay
- Abnormality of the nervous system
- Bilateral tonic-clonic seizure with focal onset
- Focal emotional seizure with laughing
- Focal hemiclonic seizure
- Focal impaired awareness seizure
- Headache
- Lateral ventricle dilatation
- Myoclonic seizure
- Olfactory lobe absence
- Abnormal corpus callosum morphology
- Ataxia
- Delayed myelination
- Epileptic spasm
- Lethargy
- Abnormal pons morphology
Abnormality of head or neck
- Abnormality of the area between the eyebrows
- Abnormality of the brow of the face
- Abnormality of the face
- Abnormality of the philtrum
- Absence of adult teeth
- Asymmetry of the posterior head
- Broad forehead
- Broad head shape
Näita veel 37 tunnust
- Broad opening between the eyelids
- Coarse facial features
- Decreased facial expression
- Decreased size of tooth
- Decreased volume of lip
- Delayed eruption of teeth
- Development of small head that was not present at birth
- Facial asymmetry
- Failure of development of all teeth
- Flat back of skull
- High frontal hairline
- High, narrow palate
- Increased size of gum ridge
- Redundant neck skin
- Round face
- Short opening between the eyelids
- Thickened skin folds of neck
- Widely spaced teeth
- Abnormally small head
- Depressed nasal bridge
- Downturned corners of mouth
- Gum enlargement
- High palate
- Metopic synostosis
- Narrow mouth
- Nasal tip, upturned
- Prominent back of the head
- Short neck
- Upward slanting of the opening between the eyelids
- Wide fontanelles
- Yellowing of the whites of the eyes
- Zygomatic flattening
- Pierre-Robin sequence
- Big calvaria
- Increased head circumference
- Little lower jaw
- Triangular mouth
Laboratory abnormality
- Abnormal circulating iron concentration
- Abnormal liver iron concentration
- Decreased circulating hepcidin concentration
- Elevated circulating iron concentration
- Elevated serum ferritin
- Elevated transferrin saturation
- Fatty infiltration of liver
- Fluid retention
Näita veel 16 tunnust
- Increased CSF glutamate concentration
- Increased iron concentration in liver
- Elevated alkaline phosphatase
- Hemoglobin in urine
- Decreased circulating haptoglobin concentration
- Decreased circulating iron concentration
- Hemosiderinuria
- Increased blood urea nitrogen
- Increased circulating lactate dehydrogenase concentration
- Microvesicular hepatic steatosis
- Unconjugated hyperbilirubinemia
- High urine protein levels
- Glucose in urine
- Renal Fanconi syndrome
- Hydrops fetalis
- Paroxysmal nocturnal hemoglobinuria
Abnormality of the eye
- Abnormal macular morphology
- Abnormal visual fixation
- Abnormality of eye movement
- Breakdown of light-sensitive cells in back of eye
- Cerebral visual impairment
- Close sighted
- Drooping of both upper eyelids
- Moderate visual impairment
Näita veel 3 tunnust
Abnormality of the genitourinary system
- Hydronephrosis
- Testicular degeneration
- Vesicoureteral reflux
- Chronic kidney disease
- Duplicated collecting system
- Acute kidney injury
- Difficulty getting a full erection
- Hypospadias
Näita veel 3 tunnust
Abnormality of limbs
- Abnormal feet structure
- Deep palm line
- Short finger
- Tapered finger
- Broad palm
- Elbow flexion contracture
- Hip contracture
- Inability to straighten knee
Näita veel 1 tunnus
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). PIGA geen: phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class A. Vaadatud 16. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/piga
Dante Labs. PIGA geen: phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class A [Internet]. [viidatud 16. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/piga
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast