Geen
PIGN
phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class N
- HGNC 8967↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000197563↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 23556↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 18q21.33
- Koordinaadid
- Kromosoom 18: 62 041 164–62 187 056 (GRCh38)
- Eksonid
- 31 eksonit, ulatus 145,9 kb
- Valk
- 931 aminohapet
- Pärilikkus
- Autosoomne retsessiivne
- Tuntud ka kui
- MCD4, PIG-N
- MANE Select transkript
- ENST00000640252.2NM_176787.5
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
VõrdlusgenoomGRCh38hg38
Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.
Loe PIGN ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanded
GPI-ankurdumise biosünteesi defektid
- PIGN-ga seotud mitmete kaasasündinud anomaaliate, hüpotoonia ja krampide sündroom (MCAHS1)Autosoomne retsessiivne
GPI-ankru defekt, mida põhjustavad PIGN-i variandid. Esineb madal lihastoonus, varajased krambid, arengu viivitus ja kaasasündinud anomaaliad.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 4 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
- Mitmete kaasasündinud anomaaliate, hüpotoonia ja krampide sündroom
GPI-ankru defektide rühm (PIGN, PIGA, PIGT, PIGQ ja nendega seotud geenid), mille korral esineb madal lihastoonus, krambid, arengu viivitus ja kaasasündinud anomaaliad.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 4 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
- GPI-ankurdumise biosünteesi häired
Pärilike seisundite rühm, mida põhjustavad GPI ankru moodustamiseks ja kinnitamiseks vajalike geenide PIG, PGAP ja nendega seotud geenide variandid. Tavaliselt kaasnevad arengu viivitus, madal lihastoonus ja epilepsia.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 4 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Laiemad rühmad
Glükosüleerimise kaasasündinud häired
- Glükosüleerimise kaasasündinud häired (CDG)
Üks 98 sellega seotud geenist
Suur rühm pärilikke haigusi, mille puhul suhkruahelad (glükaanid) ei moodustu ega kinnitu valkudele ja lipiididele õigesti; need mõjutavad sageli aju, maksa, vere hüübimist, kasvu ja paljusid teisi elundisüsteeme. Enamik neist on autosomaalselt retsessiivse pärilikkusega, kuid osa on X-seotud või autosomaalselt dominantse pärilikkusega.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 4 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Pärandumine
- Autosoomne retsessiivne
- Selleks on vaja muudetud koopiat kummastki vanemast. Ühe koopia korral oled kandja ja tavaliselt ei avaldu see sinul haigusena; kui mõlemad vanemad on kandjad, on igal lapsel neljast ühe võimalus pärida kaks koopiat.
Kuidas PIGN on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 7,9 kb kogupikkusega 145,9 kb; neist 2796 alust kodeerivad valku.
Kuidas genoomitest loetakse PIGN
161
kohad geenis PIGN, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist 6 (3,7%) asuvad lõikudes, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.
- Segmental duplications (6 kohta)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni PIGN 145,9 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (7,9 kb).
Samade haigustega seotud geenid
- PIGAphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class AJagab 3 haigust
- PIGTphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class TJagab 3 haigust
- PGAP2post-GPI attachment to proteins 2Jagab 2 haigust
- PGAP3post-GPI attachment to proteins phospholipase 3Jagab 2 haigust
- PIGGphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class G (EMM blood group)Jagab 2 haigust
- PIGLphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class LJagab 2 haigust
- PIGOphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class OJagab 2 haigust
- PIGQphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class QJagab 2 haigust
- PIGVphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class VJagab 2 haigust
- PIGWphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class WJagab 2 haigust
- PIGYphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class YJagab 2 haigust
- ST3GAL5ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 5Jagab 2 haigust
Geeniga PIGN seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida PIGN võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of head or neck
- Broad forehead
- High palate
- Little lower jaw
- Long philtrum
- Short neck
- Tented mouth
- Wide nasal bridge
- Big calvaria
Näita veel 32 tunnust
- Big head present at birth
- Central cleft upper lip
- Cleft palate
- Coarse facial features
- Nasal tip, upturned
- Non-midline cleft of the upper lip
- Prominent palatine ridges
- Thickened skin folds of neck
- Wide mouth
- Abnormal posterior cranial fossa morphology
- Asymmetric crying face
- Dandy-Walker malformation
- Decreased volume of lower lip
- Eye folds
- Full cheeks
- Gum enlargement
- Increased nuchal translucency
- Inflammation of eyelids
- Monobrow
- Narrow mouth
- Prominent back of the head
- Short nose
- Small forehead
- Small retruded chin
- Smooth philtrum
- Thin red part of the upper lip
- Upward slanting of the opening between the eyelids
- Decreased volume of lip
- Depressed nasal bridge
- Frontal bossing
- Narrow forehead
- Open mouth
Abnormality of the nervous system
- Epilepsy
- Global developmental delay
- Intellectual disability
- Severe global developmental delay
- Agenesis of corpus callosum
- Choreoathetosis
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Decreased reflex response
Näita veel 10 tunnust
Abnormality of the cardiovascular system
- Abnormal cardiac septum morphology
- Patent foramen ovale
- Tetralogy of Fallot
- Abnormal aortic arch morphology
- Abnormal aortic morphology
- An opening in the wall separating the top two chambers of the heart
- Bulge in wall of root of large artery that carries blood away from heart
- Increased blood pressure in blood vessels of lungs
Abnormality of the digestive system
- Acid reflux
- Feeding difficulties in infancy
- Abnormal anus position
- Absence or narrowing of first part of small bowel
- Absent anus
- Enlarged colon lacking nerve cells
- Intestinal malrotation
- Narrowing of anal opening
Näita veel 3 tunnust
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). PIGN geen: phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class N. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/pign
Dante Labs. PIGN geen: phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class N [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/pign
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast