Genă
SMARCE1
SWI/SNF related BAF chromatin remodeling complex subunit E1
- HGNC 11109↗(se deschide într-un tab nou)
- Genă Ensembl ENSG00000073584↗(se deschide într-un tab nou)
- NCBI Gene 6605↗(se deschide într-un tab nou)
Rezumat
- Localizare citogenetică
- 17q21.2
- Coordonate
- Cromozomul 17: 40.624.962–40.647.818 (GRCh38)
- Exoni
- 11 de exoni pe 22,9 kb
- Proteină
- 411 de aminoacizi
- Mod de transmitere
- Autozomal dominantă
- Denumiri alternative
- BAF57
- Transcriptul MANE Select
- ENST00000348513.12NM_003079.5
- Tip de locus
- gene with protein product
- Foarte ridicată
- Ridicată
- Scăzută
- Foarte scăzută
Genom de referințăGRCh38hg38
Pozițiile de pe paginile genelor și variantelor urmează această alegere, în acest browser.
Citiți SMARCE1 și restul genomului dumneavoastră cu un singur test.
De la 449 $Livrare gratuită · Rezultate în 6–8 săptămâni
Comandați Genome Test-ul meuRaport curatoriat relevant pentru această genă
Predispoziție la tumori rabdoide și tumori din familia SWI/SNF
- Meningiom familialAutozomal dominantă
Predispoziție ereditară la meningioame, inclusiv meningioame cu celule clare cauzate de variante ale SMARCE1.
- ClinGen evaluează legătura drept definitivă
- 3 de evaluatori GenCC o clasifică drept definitivă sau puternică
Ce schimbă cunoașterea
Poate fi recomandată imagistica creierului și a coloanei vertebrale.
Mod de transmitere
- Autozomal dominantă
- Este suficientă o copie modificată, de la oricare dintre părinți. Un părinte care o are o transmite fiecărui copil cu o șansă de unu la doi.
Structura genei SMARCE1
- Secvență codificatoare
- Regiune netranslată
- Intron
- Sensul transcripției
- Situri cunoscute asociate bolilor
- Regiuni pe care citirile scurte le găsesc dificile
Exonii transcriptului MANE Select al genei (versiunea v1.5), din NCBI și EMBL-EBI, pe genomul de referință GRCh38.
Benzile cromozomale din ideograma GRCh38 a UCSC (2022-10-29).
Genele din apropiere, din Ensembl, versiunea 116, pe GRCh38.
Exonii reprezintă 5,2 kb din cei 22,9 kb ai genei; 1.236 dintre aceste baze codifică proteina.
Cum citește un test genomic SMARCE1
48
poziții în SMARCE1 în care ClinVar clasifică o modificare drept patogenă sau probabil patogenă
1 dintre ele (2,1 %) se află într-o regiune pe care citirile scurte o găsesc dificilă.
- Low mappability (1 sit)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
Un test genomic complet acoperă toți cei 22,9 kb ai genei SMARCE1, inclusiv intronii, nu doar cei 5,2 kb de exoni.
Trăsături asociate cu SMARCE1
Human Phenotype Ontology le enumeră drept caracteristici ale afecțiunilor rare pe care le poate provoca SMARCE1. Pagina fiecărei trăsături enumeră celelalte gene asociate cu aceasta.
Abnormality of the nervous system
- Intracranial meningioma
- Abnormal brain FDG positron emission tomography
- Behavioral abnormality
- Epilepsy
- Focal T2 hypointense thalamic lesion
- Headache
- Intellectual disability, severe
- IQ between 34 and 49
Afișați încă 32 de trăsături
- Seizure affecting one half of brain
- Abnormal central motor function
- Abnormal central sensory function
- Abnormal gait
- Abnormality of the cerebellum
- Absent speech development
- Agenesis of corpus callosum
- Aggressive behavior
- Ataxia
- Autism spectrum disorder
- Cognitive impairment
- Cranial nerve paralysis
- Memory impairment
- More active than typical
- Oral aversion
- Rise in pressure inside skull
- Simplified gyral pattern
- Spinal meningioma
- Too much cerebrospinal fluid in the brain
- Trigeminal neuralgia
- Weakness of one side of body
- Abnormal speech pattern
- Brain stem compression
- Can't control feelings
- Excessive daytime sleepiness
- Spasms on one side of the face
- Transient global amnesia
- Global developmental delay
- Intellectual disability
- Noncancerous growth of membranes covering brain
- Small cerebellum
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
Abnormality of head or neck
- Coarse facial features
- Full lower lip
- Prominent eyelashes
- Thick eyebrow
- Wide mouth
- Abnormal facial shape
- Broad nasal tip
- Broad philtrum
Afișați încă 18 de trăsături
- Delayed eruption of teeth
- Depressed nasal bridge
- Low frontal hairline
- Nasal tip, upturned
- Recurrent colds
- Short nose
- Sparse scalp hair
- Thick nasal alae
- Thin red part of the upper lip
- Wide nasal base
- Abnormality of the sense of smell
- Bell's palsy
- Dandy-Walker malformation
- Abnormally small head
- Neoplasm of the tongue
- Long eyelashes
- Short philtrum
- Wide nose
Abnormality of the endocrine system
- Decreased circulating ACTH concentration
- Decreased circulating follicle stimulating hormone concentration
- Decreased circulating luteinizing hormone level
- Decreased serum estradiol
- Decreased serum testosterone level
- Hypogonadotropic hypogonadism
- Increased circulating prolactin concentration
- Low blood cortisol level
Afișați încă 9 de trăsături
- Low thyroid gland function due to abnormal pituitary gland
- Secondary growth hormone deficiency
- Abnormal hypothalamus physiology
- Enlarged pituitary gland
- Hypothalamic hypothyroidism
- Neoplasm of the anterior pituitary
- Reduced circulating prolactin concentration
- Neoplasm of the posterior pituitary
- Papillary thyroid carcinoma
Abnormality of the integument
- Excessive hair growth
- Small nail
- Excessive hairiness
- Small fifth toenail
- Underdeveloped fifth fingernail
- Neurofibroma
- Skin cancer
- Poor toenail formation
Afișați încă 1 trăsătură
Legături externe
Înregistrări ale genei
Transcript
Proteină
De unde provin acestea
- HGNC: simbolul genei, numele, alte simboluri și localizarea.
- MANE Select v1.5, de la NCBI și EMBL-EBI: transcriptul, exonii și secvența codificatoare.
- GenCC și ClinGen, publicate în 2026-10-16: de care afecțiuni este legată gena și cât de puternică este legătura.
- Lista ACMG de descoperiri secundare, SF v3.2.
- ClinVar și stratificările GIAB: locurile cunoscute asociate bolilor și regiunile pe care citirile scurte le consideră dificile.
- Human Phenotype Ontology, versiunea 2026-09-01: trăsăturile asociate genei. Aflați mai multe la hpo.jax.org.
- Versiunea datelor 2026.10.16-c6eea6bf.
Citează această pagină
Dante Labs. (s.a.). Gena SMARCE1: SWI/SNF related BAF chromatin remodeling complex subunit E1. Accesat 17 octombrie 2026, de la https://dantelabs.com/ro/genes/smarce1
Dante Labs. Gena SMARCE1: SWI/SNF related BAF chromatin remodeling complex subunit E1 [Internet]. [citat 17 octombrie 2026]. Disponibil la: https://dantelabs.com/ro/genes/smarce1
Un test. Răspunsuri pentru o viață.
De la 449 $Livrare gratuită · Rezultate în 6–8 săptămâni