Gen
SMARCE1
SWI/SNF related BAF chromatin remodeling complex subunit E1
- HGNC 11109↗(yeni sekmede açılır)
- Ensembl gen ENSG00000073584↗(yeni sekmede açılır)
- NCBI Gene 6605↗(yeni sekmede açılır)
Özet
- Sitogenetik konum
- 17q21.2
- Koordinatlar
- Kromozom 17: 40.624.962–40.647.818 (GRCh38)
- Eksonlar
- 22,9 kb boyunca 11 ekson
- Protein
- 411 amino asit
- Kalıtım
- Otozomal dominant
- Diğer adları
- BAF57
- MANE Select transkripti
- ENST00000348513.12NM_003079.5
- Lokus türü
- gene with protein product
- Çok yüksek
- Yüksek
- Düşük
- Çok düşük
Referans genomGRCh38hg38
Gen ve varyant sayfalarındaki konumlar, bu tarayıcıda yaptığınız bu seçimi izler.
SMARCE1 ve genomunuzun geri kalanını tek bir testle okuyun.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde
Genome Test'imi alBu gen için derlenmiş ilgili rapor
Rabdoid Tümör ve SWI/SNF Tümör Yatkınlığı
- Ailesel meningiomOtozomal dominant
SMARCE1 varyantlarının neden olduğu berrak hücreli meningiomlar dahil olmak üzere meningiomlara kalıtsal yatkınlık.
- ClinGen bu bağlantıyı kesin olarak derecelendiriyor
- 3 GenCC bildiren kurum, bunu kesin veya güçlü olarak derecelendiriyor
Bilmenin neleri değiştirdiği
Beyin ve omurga görüntüleme incelemesi önerilebilir.
Kalıtım
- Otozomal dominant
- Ebeveynlerden birinden gelen tek bir değişmiş kopya yeterlidir. Değişmiş kopyaya sahip bir ebeveyn, bunu her çocuğuna ikide bir olasılıkla aktarır.
SMARCE1 geninin yapısı
- Kodlayan dizi
- Çevrilmeyen bölge
- İntron
- Transkripsiyon yönü
- Bilinen hastalığa yol açan bölgeler
- Kısa okumaların zorlandığı bölgeler
Genin MANE Select transkriptinin ekzonları (v1.5 sürümü), NCBI ve EMBL-EBI kaynaklı, GRCh38 referans genomu üzerinde.
Kromozom bantları, UCSC'nin GRCh38 ideogramından (2022-10-29).
Yakındaki genler, Ensembl 116 sürümünden, GRCh38 üzerinde.
Ekzonlar genin 22,9 kb uzunluğunun 5,2 kb'sini oluşturur; bu bazların 1.236 tanesi proteini kodlar.
Bir genom testi SMARCE1 genini nasıl okur
48
SMARCE1 içinde, ClinVar'ın bir değişikliği patojenik veya muhtemelen patojenik olarak sınıflandırdığı konumlar
Bunların 1 tanesi (%2,1), kısa okumaların zorlandığı bir bölgeye düşüyor.
- Low mappability (1 konum)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
Tam genom, SMARCE1 genindeki 22,9 kb'lik bölgenin tamamını kapsar; yalnızca 5,2 kb'lik ekzonları değil, intronlar da dahil olmak üzere.
SMARCE1 ile bağlantılı özellikler
Human Phenotype Ontology, SMARCE1 geninin neden olabileceği nadir hastalıklarda görülen özellikler olarak bunları listeler. Her özelliğin sayfasında, o özellikle bağlantılı diğer genler listelenir.
Abnormality of the nervous system
- Intracranial meningioma
- Abnormal brain FDG positron emission tomography
- Behavioral abnormality
- Epilepsy
- Focal T2 hypointense thalamic lesion
- Headache
- Intellectual disability, severe
- IQ between 34 and 49
32 özellik daha göster
- Seizure affecting one half of brain
- Abnormal central motor function
- Abnormal central sensory function
- Abnormal gait
- Abnormality of the cerebellum
- Absent speech development
- Agenesis of corpus callosum
- Aggressive behavior
- Ataxia
- Autism spectrum disorder
- Cognitive impairment
- Cranial nerve paralysis
- Memory impairment
- More active than typical
- Oral aversion
- Rise in pressure inside skull
- Simplified gyral pattern
- Spinal meningioma
- Too much cerebrospinal fluid in the brain
- Trigeminal neuralgia
- Weakness of one side of body
- Abnormal speech pattern
- Brain stem compression
- Can't control feelings
- Excessive daytime sleepiness
- Spasms on one side of the face
- Transient global amnesia
- Global developmental delay
- Intellectual disability
- Noncancerous growth of membranes covering brain
- Small cerebellum
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
Abnormality of head or neck
- Coarse facial features
- Full lower lip
- Prominent eyelashes
- Thick eyebrow
- Wide mouth
- Abnormal facial shape
- Broad nasal tip
- Broad philtrum
18 özellik daha göster
- Delayed eruption of teeth
- Depressed nasal bridge
- Low frontal hairline
- Nasal tip, upturned
- Recurrent colds
- Short nose
- Sparse scalp hair
- Thick nasal alae
- Thin red part of the upper lip
- Wide nasal base
- Abnormality of the sense of smell
- Bell's palsy
- Dandy-Walker malformation
- Abnormally small head
- Neoplasm of the tongue
- Long eyelashes
- Short philtrum
- Wide nose
Abnormality of the endocrine system
- Decreased circulating ACTH concentration
- Decreased circulating follicle stimulating hormone concentration
- Decreased circulating luteinizing hormone level
- Decreased serum estradiol
- Decreased serum testosterone level
- Hypogonadotropic hypogonadism
- Increased circulating prolactin concentration
- Low blood cortisol level
9 özellik daha göster
- Low thyroid gland function due to abnormal pituitary gland
- Secondary growth hormone deficiency
- Abnormal hypothalamus physiology
- Enlarged pituitary gland
- Hypothalamic hypothyroidism
- Neoplasm of the anterior pituitary
- Reduced circulating prolactin concentration
- Neoplasm of the posterior pituitary
- Papillary thyroid carcinoma
Abnormality of the integument
- Excessive hair growth
- Small nail
- Excessive hairiness
- Small fifth toenail
- Underdeveloped fifth fingernail
- Neurofibroma
- Skin cancer
- Poor toenail formation
1 özellik daha göster
Dış bağlantılar
Gen kayıtları
Transkript
Protein
Bilgilerin kaynağı
- HGNC: genin sembolü, adı, diğer sembolleri ve konumu.
- NCBI ve EMBL-EBI'dan MANE Select v1.5: transkript, eksonları ve kodlayıcı dizisi.
- GenCC ve ClinGen, 2026-10-16 sürümü: genin hangi durumlarla ilişkili olduğu ve bu ilişkinin ne kadar güçlü olduğu.
- ACMG ikincil bulgular listesi, SF v3.2.
- ClinVar ve GIAB tabakalandırmaları: bilinen hastalığa neden olan bölgeler ve kısa okumaların zorlandığı bölgeler.
- Human Phenotype Ontology, 2026-09-01 sürümü: genle bağlantılı özellikler. Daha fazla bilgi için hpo.jax.org adresini ziyaret edin.
- Veri sürümü 2026.10.16-c6eea6bf.
Bu sayfayı alıntıla
Dante Labs. (t.y.). SMARCE1 geni: SWI/SNF related BAF chromatin remodeling complex subunit E1. Erişim tarihi: 16 Ekim 2026, adres: https://dantelabs.com/tr/genes/smarce1
Dante Labs. SMARCE1 geni: SWI/SNF related BAF chromatin remodeling complex subunit E1 [Internet]. [alıntı tarihi 16 Ekim 2026]. Erişilebilir adres: https://dantelabs.com/tr/genes/smarce1
Tek bir test. Ömür boyu yanıtlar.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde