Gen
COL3A1
collagen type III alpha 1 chain
- HGNC 2201↗(otwiera się w nowej karcie)
- Gen Ensembl ENSG00000168542↗(otwiera się w nowej karcie)
- NCBI Gene 1281↗(otwiera się w nowej karcie)
Podsumowanie
- Lokalizacja cytogenetyczna
- 2q32.2
- Współrzędne
- Chromosom 2: 188 974 373–189 012 746 (GRCh38)
- Eksony
- 51 eksonów na odcinku 38,4 kb
- Białko
- 1466 aminokwasów
- Dziedziczenie
- Autosomalne recesywne
- Poprzednie symbole
- EDS4A
- Transkrypt MANE Select
- ENST00000304636.9NM_000090.4
- Typ locus
- gene with protein product
- Bardzo wysoka
- Pewna
- Niska
- Bardzo niska
Genom referencyjnyGRCh38hg38
Pozycje na stronach genów i wariantów zależą od tego wyboru, w tej przeglądarce.
Odczytaj COL3A1 oraz resztę swojego genomu dzięki jednemu badaniu.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
Zamawiam Genome TestWyselekcjonowany raport dotyczący tego genu
Zespół Ehlersa-Danlosa
- Polimikrogiria z zespołem Ehlers-Danlos typu naczyniowego lub bez niegoAutosomalne recesywne
Schorzenie wywołane przez dwuallelowe warianty COL3A1, łączące malformację mózgu (polimikrogirię) z cechami naczyniowego zespołu Ehlers-Danlos.
- 1 podmiot GenCC ocenia go jako definitywny lub silny
- ClinGen ocenia związek jako: definitywne
- 5 podmiotów GenCC ocenia go jako definitywny lub silny
- Na liście ACMG wtórnych wyników badania
Dziedziczenie
- Autosomalne recesywne
- Potrzebna jest zmieniona kopia od każdego z rodziców. Przy jednej zmienionej kopii osoba jest nosicielem i zwykle nie ma objawów; gdy oboje rodzice są nosicielami, każde dziecko ma szansę jeden do czterech odziedziczyć dwie kopie.
Budowa genu COL3A1
- Sekwencja kodująca
- Region nieulegający translacji
- Intron
- Kierunek transkrypcji
- Znane miejsca powodujące choroby
- Warianty z podstroną
Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.
Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.
Eksony stanowią 5,5 kb z 38,4 kb genu; 4401 z tych zasad kodują białko.
Jak test genomu odczytuje COL3A1
485
pozycje w COL3A1, w których ClinVar klasyfikuje zmianę jako patogenną lub prawdopodobnie patogenną
Żadne z nich nie przypada na region, który krótkie odczyty trudno odczytać.
Pełne sekwencjonowanie genomu obejmuje wszystkie 38,4 kb genu COL3A1, łącznie z intronami, a nie tylko 5,5 kb eksonów.
Warianty z podstroną (70)
Warianty COL3A1 z podstronami tutaj, najpierw te z największą liczbą gwiazdek recenzji. Każda podstrona opisuje publiczny zapis ClinVar dotyczący wariantu, a nie wynik.
| Wariant | Ekson lub intron | Pozycja (GRCh38) | Klasyfikacja ClinVar | Status recenzji |
|---|---|---|---|---|
| c.80-2A>T | Intron 1 | 188 984 758 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| c.636+5G>A | Intron 7 | 188 988 648 | Patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| c.691-2A>G | Intron 8 | 188 990 094 | Patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| c.852+2T>C | Intron 11 | 188 991 059 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| c.897+1G>A | Intron 12 | 188 991 532 | Patogenny/prawdopodobnie patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| c.1348-2A>G | Intron 19 | 188 994 722 | Patogenny/prawdopodobnie patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| c.1509+2T>C | Intron 21 | 188 995 101 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| c.1662+1G>A | Intron 23 | 188 996 179 | Patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| c.2823+1G>A | Intron 39 | 189 004 144 | Patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| c.3417+1G>A | Intron 46 | 189 007 939 | Patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
Geny powiązane z tymi samymi schorzeniami
- ADAMTS2ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 2Wspólne schorzenie: 1
- AEBP1AE binding protein 1Wspólne schorzenie: 1
- B3GALT6beta-1,3-galactosyltransferase 6Wspólne schorzenie: 1
- B4GALT7beta-1,4-galactosyltransferase 7Wspólne schorzenie: 1
- C1Rcomplement C1rWspólne schorzenie: 1
- C1Scomplement C1sWspólne schorzenie: 1
- CHST14carbohydrate sulfotransferase 14Wspólne schorzenie: 1
- COL12A1collagen type XII alpha 1 chainWspólne schorzenie: 1
- COL1A1collagen type I alpha 1 chainWspólne schorzenie: 1
- COL1A2collagen type I alpha 2 chainWspólne schorzenie: 1
- COL5A1collagen type V alpha 1 chainWspólne schorzenie: 1
- COL5A2collagen type V alpha 2 chainWspólne schorzenie: 1
Cechy powiązane z genem COL3A1
Human Phenotype Ontology wymienia te cechy jako objawy rzadkich schorzeń, które może wywoływać COL3A1. Na stronie każdej cechy znajdują się inne geny z nią powiązane.
Abnormality of the cardiovascular system
- Ascending aortic dissection
- Cerebral berry aneurysm
- Narrowing of pulmonic valve
- Varicose veins
- Abnormal circle of Willis morphology
- Arteriovenous fistula
- Descending aortic dissection
- High blood pressure
Pokaż jeszcze 15 cech
- Mini stroke
- Mitral valve prolapse
- Narrowing and hardening of arteries
- Telangiectasia of the skin
- Arterial dissection
- Bulge in wall of large artery that carries blood away from heart
- Bulge in wall of root of large artery that carries blood away from heart
- Bulging of wall of large artery located above heart
- Carotid cavernous fistula
- Renovascular hypertension
- Splenic rupture
- Tear in inner wall of large artery that carries blood away from heart
- Aneurysm
- Arterial rupture
- Brain aneurysm
Abnormality of limbs
- Club foot on both sides
- Increased mobility in finger joint
- Metacarpophalangeal joint hyperextensibility
- Club feet
- Short foot
- Small hand
- Dislocated hip since birth
- Breakdown of small bones of fingers
Pokaż jeszcze 3 cech
Abnormality of the respiratory system
- Collapsed lung
- Combined cystic and ground-glass pattern on pulmonary HRCT
- Nodular pattern on pulmonary HRCT
- Spontaneous collapsed lung
- Emphysema
- Coughing up blood
- Hemothorax
- Pulmonary bulla
Pokaż jeszcze 2 cech
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Bruising susceptibility
- Diffuse alveolar hemorrhage
- Low number of red blood cells or hemoglobin
- Internal bleeding
- Bleeding post-delivery
- Bleeding within the skull
- Subarachnoid hemorrhage
- Ecchymosis
Pokaż jeszcze 1 cechę
Linki zewnętrzne
Rekordy genów
Transkrypt
Białko
Skąd pochodzą te dane
- HGNC: symbol genu, jego nazwa, inne symbole i położenie.
- MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
- GenCC i ClinGen, wydanie 2026-10-16: z jakimi schorzeniami gen jest powiązany i jak silne jest to powiązanie.
- Lista ACMG dotycząca wtórnych wyników, SF v3.2.
- ClinVar i stratyfikacje GIAB: znane miejsca powodujące choroby oraz regiony, które krótkie odczyty trudno odczytać.
- Human Phenotype Ontology, wersja 2026-09-01: cechy powiązane z genem. Więcej informacji znajdą Państwo na hpo.jax.org.
- Wydanie danych 2026.10.16-c6eea6bf.
Cytuj tę stronę
Dante Labs. (b.d.). Gen COL3A1: collagen type III alpha 1 chain. Pobrano 17 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/col3a1
Dante Labs. Gen COL3A1: collagen type III alpha 1 chain [Internet]. [cytowano 17 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/col3a1
Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni