Gene
SPINK5
serine peptidase inhibitor Kazal type 5
- HGNC 15464↗(si apre in una nuova scheda)
- Gene Ensembl ENSG00000133710↗(si apre in una nuova scheda)
- NCBI Gene 11005↗(si apre in una nuova scheda)
Sintesi
- Localizzazione citogenetica
- 5q32
- Coordinate
- Cromosoma 5: 148.063.980–148.137.382 (GRCh38)
- Esoni
- 33 esoni su 73,4 kb
- Proteina
- 1064 amminoacidi
- Noto anche come
- VAKTI, LEKTI, LETKI, NETS, NS, FLJ21544, FLJ97536, FLJ97596, FLJ99794, DKFZp686K19184
- Trascritto MANE Select
- ENST00000256084.8NM_006846.4
- Tipo di locus
- gene with protein product
- Molto alta
- Buona
- Bassa
- Molto bassa
Genoma di riferimentoGRCh38hg38
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Sindrome da iper-IgE
Una condizione caratterizzata da livelli elevati di IgE sieriche, dermatite e infezioni respiratorie.
- ClinGen valuta il legame come definitivo
- 5 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
Raggruppamenti più ampi
Altri errori innati dell'immunità
- Immunodeficienza primaria
Uno di 114 geni collegati ad esso
Malattie ereditarie del sistema immunitario causate da alterazioni di singoli geni, che influiscono sul modo in cui l'organismo combatte le infezioni o regola l'infiammazione.
- ClinGen valuta il legame come definitivo
- 5 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
- Malattia da immunodeficienza
Uno di 170 geni collegati ad esso
Malattia caratterizzata da un deficit o da un'anomalia nei meccanismi dell'immunità, sia essa cellulare o umorale.
- ClinGen valuta il legame come definitivo
- 5 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
Cosa cambia sapendolo
HSCT per SCID e PID gravi; terapia sostitutiva con immunoglobuline (IVIG/SCIG) per i deficit anticorpali; leniolisib (Joenja, FDA 2023) per APDS; terapia genica per ADA-SCID; abatacept per il deficit di CTLA4/LRBA; profilassi antibiotica; G-CSF per CGD
Struttura di SPINK5
- Sequenza codificante
- Regione non tradotta
- Introne
- Direzione della trascrizione
- Siti noti causativi di malattia
- Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.
Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).
Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.
Gli esoni costituiscono 3,7 kb dei 73,4 kb del gene; 3195 di queste basi codificano la proteina.
Come un test genomico legge SPINK5
109
posizioni in SPINK5 in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena
Nessuna di esse si trova in una regione che le letture brevi faticano a leggere.
Un genoma intero copre tutti i 73,4 kb di SPINK5, introni inclusi, non solo i 3,7 kb di esoni.
Geni associati alle stesse condizioni
- DOCK8dedicator of cytokinesis 8Condivide 3 condizioni
- IL6Rinterleukin 6 receptorCondivide 3 condizioni
- IL6STinterleukin 6 cytokine family signal transducerCondivide 3 condizioni
- STAT3signal transducer and activator of transcription 3Condivide 3 condizioni
- STAT6signal transducer and activator of transcription 6Condivide 3 condizioni
- ZNF341zinc finger protein 341Condivide 3 condizioni
- AICDAactivation induced cytidine deaminaseCondivide 2 condizioni
- ATP6AP1ATPase H+ transporting accessory protein 1Condivide 2 condizioni
- BCL10BCL10 immune signaling adaptorCondivide 2 condizioni
- BCL11BBCL11 transcription factor BCondivide 2 condizioni
- BLNKB cell linkerCondivide 2 condizioni
- BTKBruton tyrosine kinaseCondivide 2 condizioni
Tratti collegati a SPINK5
L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che SPINK5 può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.
Abnormality of the integument
- Annular cutaneous lesion
- Brittle hair
- Brittle scalp hair
- Capillary malformation
- Coarse hair
- Congenital ichthyosiform erythroderma
- Congenital nonbullous ichthyosiform erythroderma
- Dry hair
Mostra altri 35 tratti
- Dry skin
- Erythematous plaque
- Eyebrow scaling skin
- Flattened and twisted hair
- Flexural lichenification
- Generalized scaling
- Hypergranulosis
- Hyperkeratosis
- Hypogranulosis
- Ichthyosis
- Mole
- Palmoplantar scaling skin
- Papule
- Parakeratosis
- Postnatal-onset ichthyosiform erythroderma
- Psoriasiform acanthosis
- Rete ridge elongation
- Scaling skin
- Skin plaque
- Spongiosis
- Thickening of upper layer of skin
- White scaling skin
- Abnormal hairshaft morphology
- Fine hair
- Irregular hyperpigmentation
- Itching
- Lichenification
- Sparse hair
- Trichorrhexis invaginata
- Darkened and thickened skin
- Hair loss
- Ichthyosis linearis circumflexa
- Trichorrhexis nodosa
- Alopecia totalis
- Skin cancer
Abnormality of the immune system
- Anaphylaxis
- Cow milk allergy
- Decreased circulating complement C3 concentration
- Drug allergy
- Egg allergy
- Fish allergy
- Humoral immunodeficiency
- Meningitis
Mostra altri 25 tratti
- Nut food product allergy
- Pimple
- Psoriasiform dermatitis
- Pustular rash
- Recurrent chest infections
- Recurrent sepsis
- Seborrheic dermatitis
- Skin rash
- Baby eczema
- Congenital exfoliative erythroderma
- Eczema
- Food allergy
- Immunologic hypersensitivity
- Recurrent infections
- Red scaly skin caused by inflammatory skin disease
- Allergy
- Asthma
- Infection in blood stream
- Pneumonia
- Recurrent pneumonia
- Recurrent respiratory infections
- Recurrent skin infections
- Seasonal allergy
- Impaired specific antibody response
- Neonatal sepsis
Abnormality of head or neck
- Absent eyebrow
- Facial puffiness
- Inflammation of corners of the mouth
- Inflammation of eyelids
- Pink eye
- Recurrent colds
- Recurrent sinus disease
- Sparse eyebrow
Mostra altri 6 tratti
Link esterni
Schede genetiche
Trascritto
Proteina
Da dove provengono questi dati
- HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
- MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
- GenCC e ClinGen, rilasciati 2026-10-16: a quali condizioni è associato il gene e con quale forza.
- La lista ACMG dei reperti secondari, SF v3.2.
- ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
- The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
- Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.
Cita questa pagina
Dante Labs. (s.d.). Gene SPINK5: serine peptidase inhibitor Kazal type 5. Consultato il 16 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/spink5
Dante Labs. Gene SPINK5: serine peptidase inhibitor Kazal type 5 [Internet]. [citato il 16 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/spink5
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