Gén
GJA1
gap junction protein alpha 1
- HGNC 4274↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000152661↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 2697↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 6q22.31
- Koordináták
- 6. kromoszóma: 121 435 646–121 449 727 (GRCh38)
- Exonok
- 2 exon, összesen 14,1 kb
- Fehérje
- 382 aminosav
- Más néven ismert
- CX43, ODD, ODOD, SDTY3
- Korábbi jelölések
- ODDD, GJAL
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000282561.4NM_000165.5
- Lokusz típusa
- gene with protein product
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Olvassa el a GJA1-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentés
Hereditary Palmoplantar Keratodermas and Pachyonychia Congenita
- Hereditary palmoplantar keratoderma
Inherited thickening of the palms and soles, including pachyonychia congenita, mal de Meleda, Nagashima-type and Bothnian keratodermas, keratitis-ichthyosis-deafness syndrome, and the CTSC-related Papillon-Lefèvre and Haim-Munk syndromes.
- 2 GenCC-beküldő definitívnek vagy erősnek minősíti
Mit változtat az ismeret
Diagnosis guides foot care and pain management; for CTSC-related forms early dental treatment protects the teeth, and GJB2-related forms warrant a hearing check.
A GJA1 felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Ismert betegségokozó helyek
- Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 14,1 kb-jából 3,1 kb-ot tesznek ki; ezek közül 1149 bázis kódolja a fehérjét.
Hogyan olvassa a genomteszt a(z) GJA1 gént
38
pozíció a(z) GJA1 génben, ahol a ClinVar a változást kórokozónak vagy valószínűleg kórokozónak minősíti
Ezek közül 38 (100%) olyan régiókba esik, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek.
- Low mappability (8 hely)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
- Segmental duplications (38 hely)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
A teljes genom a GJA1 gén mind a 14,1 kb-ját lefedi, az intronokat is beleértve, nem csak az 3,1 kb exonját.
Ugyanazokhoz a betegségekhez kapcsolódó gének
- AAGABalpha and gamma adaptin binding protein1 betegséget oszt meg
- AP1B1adaptor related protein complex 1 subunit beta 11 betegséget oszt meg
- AQP5aquaporin 51 betegséget oszt meg
- CTSCcathepsin C1 betegséget oszt meg
- DSG1desmoglein 11 betegséget oszt meg
- DSPdesmoplakin1 betegséget oszt meg
- GJB2gap junction protein beta 21 betegséget oszt meg
- GJB3gap junction protein beta 31 betegséget oszt meg
- GJB4gap junction protein beta 41 betegséget oszt meg
- GJB6gap junction protein beta 61 betegséget oszt meg
- GRHL2grainyhead like transcription factor 21 betegséget oszt meg
- KDSR3-ketodihydrosphingosine reductase1 betegséget oszt meg
A(z) GJA1 génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) GJA1 gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Abnormality of head or neck
- Decreased width of baby teeth
- Delayed eruption of teeth
- Enlargement of facial bones
- Flat nose
- Little lower jaw
- Sparse eyebrow
- Underdeveloped tissue around nostril
- Wide fontanelles
Még 57 tulajdonság megjelenítése
- Abnormal tooth enamel
- Abnormality of the nose
- Abnormally small head
- Broad columella
- Cleft palate
- Decreased number of teeth
- Dental cavities
- Depressed nasal bridge
- Early loss of baby teeth
- Enlargement of craniofacial bones
- Narrow nasal bridge
- Sparse eyelashes
- Sparse scalp hair
- Wide nasal bridge
- Big lower jaw
- Central cleft upper lip
- Corners of eye widely separated
- Enlargement of skull bones
- High forehead
- High palate
- Large cranial suture
- Nasal tip, upturned
- Short nose
- Wide gum ridges
- Absent eyebrow
- Bell's palsy
- Eye folds
- Non-midline cleft of the upper lip
- Taurodontia
- Upward slanting of the opening between the eyelids
- Abnormal nasopharynx morphology
- Absence of a tooth
- Bad bite
- Big calvaria
- Blockage of nose
- Bony paranasal bossing
- Broad head shape
- Cleft upper lip
- Coarse facial features
- Decreased size of maxilla
- Decreased size of teeth
- Decreased size of tooth
- Decreased volume of lip
- Delayed eruption of permanent teeth
- Dental crowding
- Downward slanting of the opening between the eyelids
- Early tooth loss
- Frontal bossing
- Long nose
- Long philtrum
- Low hanging columella
- Macrodontia of permanent maxillary central incisor
- Narrow mouth
- Narrow nose
- Narrow opening between the eyelids
- Short opening between the eyelids
- Thin dental enamel
Abnormality of limbs
- Plantar hyperkeratosis
- Thickening of palms and soles
- Webbed 4th-5th finger
- Abnormality of the wide portion of a long bone
- Curvature of little finger
- Finger syndactyly
- Fused toes
- Joint contracture of the 5th finger
Még 28 tulajdonság megjelenítése
- 3-4 finger cutaneous syndactyly
- Absent/small middle finger bone of the hand
- Curvature of digit
- Flexion contracture of finger
- Patchy palmoplantar hyperkeratosis
- Permanent flexion of the finger
- Abnormal shape of shaft of long bone
- Extra finger
- Extra thumb
- Madelung deformity
- Short big toe
- Short fingers or toes
- Short toe
- Tapered finger
- Absent middle bone of little finger
- Club-shaped outermost end of thighbone
- Curvature of outermost bone of little finger
- Flared wide portion of long bone
- Hip dislocation
- Metaphyseal dysplasia
- Outward turned elbows
- Short 5th finger
- Short foot
- Short middle bone of the little finger
- Small hand
- Uneven increase in bone density in finger bone
- Webbed 2nd, 3rd and 4th toes
- Webbed 3rd-4th toes
Abnormality of the integument
- Atypical nail growth
- Brittle hair
- Chicken skin
- Fine hair
- Hair loss
- Hypergranulosis
- Hyperkeratosis
- Orthokeratosis
Még 28 tulajdonság megjelenítése
- Patchy darkened skin
- Sparse hair
- Thickening of upper layer of skin
- White discoloration of nails
- Abnormal blistering of the skin
- Abnormality of the nail
- Flat, discolored area of skin
- Hyperpigmented skin patches
- Photosensitive skin
- Poor nail formation
- Abnormal fingernails
- Abnormality of the hair
- Curly hair
- Dry skin
- Generalized hypotrichosis
- Grooved nails
- Irregular hyperpigmentation
- Sclerodactyly
- Slow-growing hair
- Absent hair
- Cracked skin
- Dry hair
- Excessive hairiness over body
- Poor wound healing
- Scaling skin
- Skin cancer
- Trichorrhexis nodosa
- Brittle nails
Abnormality of the eye
- Abnormally small eyeball
- Glaucoma
- Uveitis
- Wide-set eyes
- Cornea of eye less than 10mm in diameter
- Abnormality of the eye
- Abnormality of vision
- Abnormally close eyes
Még 13 tulajdonság megjelenítése
Abnormality of the cardiovascular system
- Palmoplantar erythema
- Redness of skin or mucous membrane
- Underdeveloped left heart
- Underdeveloped aortic arch
- Abnormal cardiovascular system morphology
- Abnormal heart rate
- An opening in the wall separating the top two chambers of the heart
- Blushed cheeks
Még 4 tulajdonság megjelenítése
Abnormality of the ear
- Abnormality of the ear
- Abnormally shaped ears
- Conductive deafness
- Deafness in one ear
- Hearing impairment
- Prominent ear
- Sensorineural hearing impairment
- Large earlobe
Még 2 tulajdonság megjelenítése
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Honnan származnak az adatok
- HGNC: a gén szimbóluma, neve, egyéb szimbólumai és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI-tól és az EMBL-EBI-tól: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-16 kiadás: mely betegségekkel kapcsolódik a gén, és milyen erősen.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- ClinVar és a GIAB-rétegződések: ismert, betegséget okozó helyek, valamint azok a régiók, amelyeket a rövid leolvasások nehezen térképeznek fel.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.16-c6eea6bf.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). GJA1 gén: gap junction protein alpha 1. Lekérve: 2026. október 17., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/gja1
Dante Labs. GJA1 gén: gap junction protein alpha 1 [Internet]. [idézve: 2026. október 17.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/gja1
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt