Gén
GJB2
gap junction protein beta 2
- HGNC 4284↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000165474↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 2706↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 13q12.11
- Koordináták
- 13. kromoszóma: 20 187 470–20 192 938 (GRCh38)
- Exonok
- 2 exon, összesen 5,5 kb
- Fehérje
- 226 aminosav
- Más néven ismert
- CX26, NSRD1
- Korábbi jelölések
- DFNB1, DFNA3
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000382848.5NM_004004.6
- Lokusz típusa
- Fehérjét kódoló
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Ez az oldal adatként
Adja hozzá a .json végződést az oldal címéhez, vagy kérjen application/json típust, hogy JSON-ként olvassa be.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/gjb2.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOlvassa el a GJB2-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések
Hearing Loss and Deafness
- Autosomal Dominant Nonsyndromic Hearing LossAutoszomális domináns
Autosomal dominant form of nonsyndromic deafness.
- 3 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
- Nonsyndromic Genetic Hearing Loss
A 97 hozzá kapcsolódó gén egyike
Inherited hearing loss without other medical features, including the common recessive forms caused by GJB2, OTOF, SLC26A4, STRC and many other genes, as well as dominant, X-linked and mitochondrial forms.
- A ClinGen a kapcsolatot a következőként minősíti: bizonyított
- 6 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
▶Beavatkozhatóság
Knowing the genetic cause can guide hearing support and cochlear implant decisions, gene-therapy trial eligibility (for example OTOF) and family counselling.
Hereditary Palmoplantar Keratodermas and Pachyonychia Congenita
- Hereditary palmoplantar keratoderma
Inherited thickening of the palms and soles, including pachyonychia congenita, mal de Meleda, Nagashima-type and Bothnian keratodermas, keratitis-ichthyosis-deafness syndrome, and the CTSC-related Papillon-Lefèvre and Haim-Munk syndromes.
- 4 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
▶Beavatkozhatóság
Diagnosis guides foot care and pain management; for CTSC-related forms early dental treatment protects the teeth, and GJB2-related forms warrant a hearing check.
A GJB2 felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Ismert betegségokozó helyek
- Oldallal rendelkező variánsok
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 5,5 kb-jából 2,3 kb-ot tesznek ki; ezek közül 681 bázis kódolja a fehérjét.
GJB2 szekvenálása
163
a GJB2 génben azok a pozíciók, ahol a ClinVar kórokozónak vagy valószínűleg kórokozónak minősít egy változást
Ezek közül egy sem esik olyan régióba, amelyet a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
A teljes genomszekvenálás a GJB2 mind a 5,5 kb-os hosszát lefedi, beleértve az intronokat is, nem csak az exonok 2,3 kb-át.
Oldallal rendelkező variánsok (22)
Az itt található, oldallal rendelkező GJB2 variánsok, a legtöbb csillaggal rendelkezők először. Minden oldal a variáns ClinVar nyilvános adatbázisbeli bejegyzését írja le, sosem egy eredményt.
| Variáns | HGVS c. | Exon vagy intron | Pozíció (GRCh38) | ClinVar-besorolás | Felülvizsgálati állapot |
|---|---|---|---|---|---|
| c.-22-2A>C | 1. intron | 20 189 605 | Valószínűleg patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte | |
| c.1A>G | 2. exon | 20 189 581 | Patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte | |
| c.1A>T | 2. exon | 20 189 581 | Valószínűleg patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte | |
| c.2T>C | 2. exon | 20 189 580 | Patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte | |
| c.2T>G | 2. exon | 20 189 580 | Patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte | |
| c.3G>A | 2. exon | 20 189 579 | Patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte | |
| E47K | c.139G>A | 2. exon | 20 189 443 | Patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| G12C | c.34G>T | 2. exon | 20 189 548 | Valószínűleg patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| G12Vfs*2 | c.35del | 2. exon | 20 189 546 | Patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| K188R | c.563A>G | 2. exon | 20 189 019 | Valószínűleg patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
ClinVar pathogenic variants (211)
The GJB2 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogén 104
- Patogén/valószínűleg patogén 16
- Valószínűleg patogén 91
| Variáns | Conditions | ClinVar-besorolás | Felülvizsgálati állapot |
|---|---|---|---|
| NM_004004.6(GJB2):c.583A>G (p.Met195Val) | nonsyndromic genetic hearing loss | Patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| NM_004004.6(GJB2):c.516G>C (p.Trp172Cys) | nonsyndromic genetic hearing loss | Patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| NM_004004.6(GJB2):c.235del (p.Leu79fs) | nonsyndromic genetic hearing loss | Patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| NM_004004.6(GJB2):c.167del (p.Leu56fs) | nonsyndromic genetic hearing loss | Patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| NM_004004.6(GJB2):c.139G>A (p.Glu47Lys) | nonsyndromic genetic hearing loss | Patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| NM_004004.6(GJB2):c.110T>C (p.Val37Ala) | nonsyndromic genetic hearing loss | Patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| NM_004004.6(GJB2):c.109G>A (p.Val37Ile) | nonsyndromic genetic hearing loss | Patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| NM_004004.6(GJB2):c.101T>C (p.Met34Thr) | nonsyndromic genetic hearing loss | Patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| NM_004004.6(GJB2):c.71G>A (p.Trp24Ter) | nonsyndromic genetic hearing loss | Patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| NM_004004.6(GJB2):c.56G>C (p.Ser19Thr) | nonsyndromic genetic hearing loss | Patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| NM_004004.6(GJB2):c.35del (p.Gly12fs) | nonsyndromic genetic hearing loss | Patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| NM_004004.6(GJB2):c.3G>A (p.Met1Ile) | nonsyndromic genetic hearing loss | Patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| NM_004004.6(GJB2):c.2T>G (p.Met1Arg) | nonsyndromic genetic hearing loss | Patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| NM_004004.6(GJB2):c.2T>C (p.Met1Thr) | nonsyndromic genetic hearing loss | Patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| NM_004004.6(GJB2):c.1A>G (p.Met1Val) | nonsyndromic genetic hearing loss | Patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| NM_004004.6(GJB2):c.584T>C (p.Met195Thr) | nonsyndromic genetic hearing loss | Valószínűleg patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| NM_004004.6(GJB2):c.563A>G (p.Lys188Arg) | nonsyndromic genetic hearing loss | Valószínűleg patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| NM_004004.6(GJB2):c.227T>C (p.Leu76Pro) | nonsyndromic genetic hearing loss | Valószínűleg patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| NM_004004.6(GJB2):c.109G>T (p.Val37Phe) | nonsyndromic genetic hearing loss | Valószínűleg patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| NM_004004.6(GJB2):c.34G>T (p.Gly12Cys) | nonsyndromic genetic hearing loss | Valószínűleg patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| NM_004004.6(GJB2):c.1A>T (p.Met1Leu) | nonsyndromic genetic hearing loss | Valószínűleg patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| NM_004004.6(GJB2):c.-22-2A>C | nonsyndromic genetic hearing loss | Valószínűleg patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| NM_004004.6(GJB2):c.632_633del (p.Cys211fs) (opens in a new tab) | GJB2-related disorder and 3 others | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_004004.6(GJB2):c.617A>G (p.Asn206Ser) (opens in a new tab) | Bart-Pumphrey syndrome and 10 others | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_004004.6(GJB2):c.598G>A (p.Gly200Arg) (opens in a new tab) | autosomal recessive nonsyndromic hearing loss 1A | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
See all 211 with every other GJB2 variant in ClinVar → (opens in a new tab)
Ugyanazokhoz a betegségekhez kapcsolódó gének
- GJB6gap junction protein beta 63 betegséget oszt meg
- GRHL2grainyhead like transcription factor 23 betegséget oszt meg
- ACTG1actin gamma 12 betegséget oszt meg
- ATP11AATPase phospholipid transporting 11A2 betegséget oszt meg
- ATP2B2ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 22 betegséget oszt meg
- CD164CD164 molecule2 betegséget oszt meg
- CEACAM16CEA cell adhesion molecule 16, tectorial membrane component2 betegséget oszt meg
- COCHcochlin2 betegséget oszt meg
- COL11A1collagen type XI alpha 1 chain2 betegséget oszt meg
- COL11A2collagen type XI alpha 2 chain2 betegséget oszt meg
- DIAPH1diaphanous related formin 12 betegséget oszt meg
- EYA4EYA transcriptional coactivator and phosphatase 42 betegséget oszt meg
A(z) GJB2 génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) GJB2 gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Abnormality of the integument
- Absent axillary hair
- Absent pubic hair
- Cobblestone-like hyperkeratosis
- Decreased ability to sweat
- Hyperkeratosis
- Ichthyosis
- Squamous cell carcinoma
- Knuckle pad
Még 19 tulajdonság megjelenítése
- White discoloration of nails
- Congenital ichthyosiform erythroderma
- Follicular hyperkeratosis
- Poor nail formation
- Premature aged appearance
- Scaling skin
- Skin plaque
- Sparse hair
- Thickening of upper layer of skin
- Abnormality of the nail
- Abnormality of the toenail
- Hair loss
- Hyperkeratotic papule
- Papule
- Thick nail
- Skin cancer
- Skin nodule
- Trichilemmoma
- Atypical nail growth
Abnormality of head or neck
- Decreased size of tooth
- Dry eye syndrome
- Sparse eyebrow
- Sparse eyelashes
- Sparse scalp hair
- Abnormal dentition
- Hair loss on scalp from scarring condition
- Pink eye
Még 14 tulajdonság megjelenítése
Abnormality of the eye
- Corneal inflammation
- Extreme sensitivity of the eyes to light
- New blood vessel formation in cornea
- Damage to outer layer of the cornea of the eye
- Limbal stem cell deficiency
- Punctate keratitis
- Visual loss
- Blindness
Még 3 tulajdonság megjelenítése
Abnormality of limbs
- Honeycomb palmoplantar hyperkeratosis
- Thickening of palms and soles
- Thickening of the outer layer of the skin of the palms and soles
- Autoamputation of digits
- Coxa valga
- Equinus calcaneus
- Inability to straighten knee
- Small kneecap
Még 2 tulajdonság megjelenítése
Abnormality of the immune system
- Red scaly skin caused by inflammatory skin disease
- Recurrent skin infections
- Folliculitis
- Psoriasiform dermatitis
- Recurrent bacterial skin infections
- Recurrent Candida infection
- Recurrent cutaneous fungal infections
- Acne inversa
Még 2 tulajdonság megjelenítése
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Az adatok forrásai
- HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-18 kiadás: mely állapotokhoz kapcsolódik a gén, és milyen erős a kapcsolat.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- ClinVar és a GIAB-stratifikációk: ismert betegséget okozó helyek és azok a régiók, amelyeket a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.18-8b139e39.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). GJB2 gén: gap junction protein beta 2. Lekérve: 2026. október 19., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/gjb2
Dante Labs. GJB2 gén: gap junction protein beta 2 [Internet]. [idézve: 2026. október 19.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/gjb2
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt