Γονίδιο
PORCN
porcupine O-acyltransferase
- HGNC 17652↗(ανοίγει σε νέα καρτέλα)
- Γονίδιο Ensembl ENSG00000102312↗(ανοίγει σε νέα καρτέλα)
- NCBI Gene 64840↗(ανοίγει σε νέα καρτέλα)
Σύνοψη
- Κυτογενετική θέση
- Xp11.23
- Συντεταγμένες
- Χρωμόσωμα X: 48.508.992–48.520.808 (GRCh38)
- Εξόνια
- 15 έξώνια σε 11,8 kb
- Πρωτεΐνη
- 461 αμινοξέα
- Γνωστό επίσης ως
- MG61, PORC, PPN, por
- Προηγούμενα σύμβολα
- DHOF
- Μεταγράφημα MANE Select
- ENST00000326194.11NM_203475.3
- Τύπος locus
- Κωδικοποιητικά πρωτεΐνες
- Πολύ υψηλή
- Υψηλή
- Χαμηλή
- Πολύ χαμηλή
Αυτή η σελίδα ως δεδομένα
Προσθέστε .json στη διεύθυνση της σελίδας ή ζητήστε application/json, για να τη διαβάσετε ως JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/porcn.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameΔιαβάστε το PORCN, και το υπόλοιπο γονιδίωμά σας, με μία εξέταση.
Από 449 $Δωρεάν αποστολή · Αποτελέσματα σε 6–8 εβδομάδες
Αποκτήστε το Genome Test σαςΕπιμελημένη αναφορά που σχετίζεται με αυτό το γονίδιο
Φοκαλ δερμική υποπλασία (σύνδρομο Goltz)
- Επικρατής, συνδεδεμένη με το X
Οφείλεται σε αλλαγές στο γονίδιο PORCN, που βρίσκεται στο X χρωμόσωμα και είναι απαραίτητο για την απελευθέρωση των πρωτεϊνών σηματοδότησης Wnt, οι οποίες καθοδηγούν την ανάπτυξη. Οι περισσότερες περιπτώσεις εμφανίζονται de novo· τα πάσχοντα αρσενικά συνήθως φέρουν την αλλαγή μόνο σε ορισμένα από τα κύτταρά τους.
- Η ClinGen αξιολογεί τη σύνδεση ως οριστική
- 5 υποβολείς του GenCC την αξιολογούν ως οριστική ή ισχυρή
▶Δυνατότητα δράσης
Φροντίδα από ειδικούς δερματολογίας, οφθαλμολογίας, οδοντιατρικής και χειρουργικής χεριού, με αφαίρεση των παπιλωμάτων και θεραπεία των δερματικών προβλημάτων όπου χρειάζεται. Οι περισσότερες περιπτώσεις είναι de novo, αλλά η μητέρα μπορεί να φέρει την αλλαγή, μερικές φορές μόνο σε ορισμένα από τα κύτταρά της· γι' αυτό η γενετική συμβουλευτική και ο έλεγχος των γονέων καθορίζουν τον κίνδυνο επανεμφάνισης.
Πώς είναι διαταγμένο το PORCN
- Κωδικοποιούσα αλληλουχία
- Μη μεταφραζόμενη περιοχή
- Ιντρόνιο
- Κατεύθυνση μεταγραφής
- Γνωστές θέσεις που προκαλούν νόσο
- Περιοχές που τα σύντομα αναγνώσματα βρίσκουν δύσκολες
Εξόνια του μεταγράφηματος MANE Select του γονιδίου (έκδοση v1.5), από τα NCBI και το EMBL-EBI, στο γονιδίωμα αναφοράς GRCh38.
Ζώνες χρωμοσωμάτων από το ιδεόγραμμα GRCh38 του UCSC (2022-10-29).
Γειτονικά γονίδια από την έκδοση 116 του Ensembl, στο GRCh38.
Τα εξόνια αποτελούν 1,9 kb από τα 11,8 kb του γονιδίου· 1.386 από αυτές τις βάσεις κωδικοποιούν την πρωτεΐνη.
Αλληλούχηση του PORCN
3Εύκολο
Πόσο δύσκολο είναι να αλληλουχηθεί το PORCN με σύντομα αναγνώσματα, από το 100
0 · Εύκολο100 · Δύσκολο
Σχεδόν όλα τα εξόνια του PORCN βρίσκονται σε σημεία όπου τα σύντομα αναγνώσματα αντιστοιχίζονται καθαρά.
Τι προσθέτει: το ποσοστό των εξονίων του PORCN σε κάθε είδος δύσκολης περιοχής
- ΧαρτογραφησιμότηταΤμήματα όπου αναγνώσματα των 100 ή 250 bp δεν μπορούν να τοποθετηθούν μοναδικά, οπότε μια κλήση εκεί μπορεί να λείπει ή να είναι λανθασμένη. Από μόνο του, ένα γονίδιο που βρίσκεται εξ ολοκλήρου σε αυτό το είδος περιοχής θα είχε βαθμολογία 100.0%
- ΟμολογίαΤμηματικές διπλασιάσεις: αντίγραφα αλλού στο γονιδίωμα, όπως παραλόγοι και ψευδογονίδια, με ταυτότητα 90% ή μεγαλύτερη. Από μόνο του, ένα γονίδιο που βρίσκεται εξ ολοκλήρου σε αυτό το είδος περιοχής θα είχε βαθμολογία 60.0%
- Κοινό με το chrYΟι ψευδοαυτοσωμικές περιοχές και η περιοχή X-transposed, όπου τα chrX και chrY φέρουν την ίδια ή σχεδόν την ίδια αλληλουχία, οπότε ένα ανάγνωσμα από το ένα μπορεί να τοποθετηθεί στο άλλο. Από μόνο του, ένα γονίδιο που βρίσκεται εξ ολοκλήρου σε αυτό το είδος περιοχής θα είχε βαθμολογία 60.0%
- Κάλυψη αναφοράςΚενά στο κοντινό σύνθετο γονιδίωμα αναφοράς, όπου δεν υπάρχει αλληλουχία με την οποία τα αναγνώσματα μπορούν να ευθυγραμμιστούν. Από μόνο του, ένα γονίδιο που βρίσκεται εξ ολοκλήρου σε αυτό το είδος περιοχής θα είχε βαθμολογία 50.0%
- ΕπαναλήψειςTandem επαναλήψεις και σειρές από μία βάση, πάνω στις οποίες τα αναγνώσματα ολισθαίνουν και ενδέχεται να μην τις καλύπτουν πλήρως. Από μόνο του, ένα γονίδιο που βρίσκεται εξ ολοκλήρου σε αυτό το είδος περιοχής θα είχε βαθμολογία 30.5,1%
- Περιεκτικότητα σε GCΠαράθυρα με λιγότερο από 25% ή περισσότερο από 65% G και C, τα οποία η προετοιμασία της βιβλιοθήκης καλύπτει αραιά. Από μόνο του, ένα γονίδιο που βρίσκεται εξ ολοκλήρου σε αυτό το είδος περιοχής θα είχε βαθμολογία 20.6%
Βαθμολογία της Dante Labs από δική μας έρευνα, βασισμένη στους χάρτες δύσκολα αλληλουχούμενων περιοχών Genome in a Bottle του NIST.Πώς βαθμολογείταιΚάθε ράβδος είναι το ποσοστό των βάσεων των εξονίων του PORCN σε αυτό το είδος δύσκολης περιοχής. Κάθε είδος μπορεί από μόνο του να κάνει ένα γονίδιο δύσκολο, και καθένα επιπλέον προσθέτει λιγότερο: 0 όταν καμία βάση δεν βρίσκεται σε κάποια, 100 όταν κάθε βάση βρίσκεται εκεί όπου τα αναγνώσματα δεν μπορούν να τοποθετηθούν μοναδικά.
25
θέσεις στο PORCN όπου το ClinVar κατατάσσει μια αλλαγή ως παθογόνο ή πιθανώς παθογόνο
Καμία από αυτές δεν βρίσκεται σε περιοχή που τα σύντομα αναγνώσματα δυσκολεύονται να καλύψουν.
Ένα πλήρες γονιδίωμα καλύπτει και τα 11,8 kb του PORCN, συμπεριλαμβανομένων των intronic περιοχών, και όχι μόνο τα 1,9 kb των εξονίων.
ClinVar pathogenic variants (26)
The PORCN variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Παθογόνο 13
- Πιθανώς παθογόνο 13
| Παραλλαγή | Conditions | Ταξινόμηση ClinVar | Κατάσταση αξιολόγησης |
|---|---|---|---|
| NM_203475.3(PORCN):c.268C>T (p.Arg90Ter) (opens in a new tab) | focal dermal hypoplasia | Παθογόνο | ★★★★2 αστέρια από 4 παρέχονται κριτήρια, πολλοί υποβολείς, χωρίς συγκρούσεις |
| NM_203475.3(PORCN):c.283C>T (p.Arg95Ter) (opens in a new tab) | focal dermal hypoplasia | Παθογόνο | ★★★★2 αστέρια από 4 παρέχονται κριτήρια, πολλοί υποβολείς, χωρίς συγκρούσεις |
| NM_203475.3(PORCN):c.727C>T (p.Arg243Ter) (opens in a new tab) | focal dermal hypoplasia | Παθογόνο | ★★★★2 αστέρια από 4 παρέχονται κριτήρια, πολλοί υποβολείς, χωρίς συγκρούσεις |
| NM_203475.3(PORCN):c.1094G>A (p.Arg365Gln) (opens in a new tab) | focal dermal hypoplasia | Παθογόνο | ★★★★2 αστέρια από 4 παρέχονται κριτήρια, πολλοί υποβολείς, χωρίς συγκρούσεις |
| NM_203475.3(PORCN):c.17del (p.Arg6fs) (opens in a new tab) | focal dermal hypoplasia | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_203475.3(PORCN):c.137-1G>C (opens in a new tab) | focal dermal hypoplasia | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_203475.3(PORCN):c.370C>T (p.Arg124Ter) (opens in a new tab) | focal dermal hypoplasia | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_203475.3(PORCN):c.373+1G>A (opens in a new tab) | focal dermal hypoplasia | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_203475.3(PORCN):c.502G>A (p.Gly168Arg) (opens in a new tab) | focal dermal hypoplasia | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_203475.3(PORCN):c.532C>T (p.Gln178Ter) (opens in a new tab) | focal dermal hypoplasia | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_203475.3(PORCN):c.846-2A>G (opens in a new tab) | focal dermal hypoplasia | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_203475.3(PORCN):c.946+2_946+3del (opens in a new tab) | focal dermal hypoplasia | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_203475.3(PORCN):c.1076dup (p.Tyr359Ter) (opens in a new tab) | focal dermal hypoplasia | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_203475.3(PORCN):c.-6_24delinsCCACC (p.Met1fs) (opens in a new tab) | focal dermal hypoplasia | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_203475.3(PORCN):c.31C>T (p.Gln11Ter) (opens in a new tab) | focal dermal hypoplasia | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_203475.3(PORCN):c.341T>G (p.Met114Arg) (opens in a new tab) | focal dermal hypoplasia | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_203475.3(PORCN):c.503G>T (p.Gly168Val) (opens in a new tab) | focal dermal hypoplasia | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_203475.3(PORCN):c.528C>G (p.Tyr176Ter) (opens in a new tab) | focal dermal hypoplasia | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_203475.3(PORCN):c.782T>C (p.Leu261Pro) (opens in a new tab) | focal dermal hypoplasia | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_203475.3(PORCN):c.874_877dup (p.Glu293fs) (opens in a new tab) | focal dermal hypoplasia | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_203475.3(PORCN):c.887G>C (p.Arg296Pro) (opens in a new tab) | focal dermal hypoplasia | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_203475.3(PORCN):c.1001A>G (p.Tyr334Cys) (opens in a new tab) | focal dermal hypoplasia | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_203475.3(PORCN):c.1077_1078insAAC (p.Tyr359_Val360insAsn) (opens in a new tab) | focal dermal hypoplasia | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_203475.3(PORCN):c.1186C>T (p.Arg396Ter) (opens in a new tab) | focal dermal hypoplasia | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_203475.3(PORCN):c.1356del (p.Cys453fs) (opens in a new tab) | focal dermal hypoplasia | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
See all 26 with every other PORCN variant in ClinVar → (opens in a new tab)
Χαρακτηριστικά που συνδέονται με το PORCN
Το Human Phenotype Ontology καταγράφει αυτά ως χαρακτηριστικά των σπάνιων παθήσεων που μπορεί να προκαλέσει το PORCN. Η σελίδα κάθε χαρακτηριστικού εμφανίζει τα άλλα γονίδια που συνδέονται με αυτό.
Abnormality of the integument
- Focal dermal aplasia/hypoplasia
- Grooved nails
- Patchy lightened skin
- Atypical nail growth
- Diffuse skin atrophy
- Longitudinal splitting of nail
- Mixed hypo- and hyperpigmentation of the skin
- Poor nail formation
Εμφάνιση 30 ακόμη χαρακτηριστικών
- Abnormal fat tissue distribution below the skin
- Absence of part of skin at birth
- Brittle hair
- Decreased ability to sweat
- Dry skin
- Fine hair
- Firm lump under the skin
- Fragile skin
- Freckling
- Itching
- Liver spots
- Papilloma
- Patchy baldness
- Photosensitive skin
- Skin erosion
- Skin nodule
- Small nail
- Sparse hair
- Thin skin
- Trichorrhexis nodosa
- Absent nails
- Atypical scarring of skin
- Flattened and twisted hair
- Pili canaliculi
- Poor wound healing
- Absent fingernail
- Absent toenail
- Linear hyperpigmentation
- Reticular hyperpigmentation
- Skin degeneration
Abnormality of limbs
- 3-4 finger cutaneous syndactyly
- Shortened 4th long bone of hand
- Split hand
- Cleft hand
- Left and right leg differ in length or width
- Thickening of palms and soles
- Webbed fingers or toes
- Absent fingers or toes
Εμφάνιση 15 ακόμη χαρακτηριστικών
- More than five fingers or toes on hands or feet
- Osteopathia striata
- Transverse terminal limb defect
- Absent fingers
- Dislocated hip since birth
- Duplication of bones of the toes
- Extra little finger
- Fused toes
- Missing toes
- Short finger
- Short finger bones
- Short fingers or toes
- Short long bone of foot
- Shortened long bone of hand
- Split foot
Abnormality of the eye
- Abnormally small eyeball
- Birth defect that causes a hole in the innermost layer at the back of the eye
- Cat eye
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Absence of eyeballs
- Clouding of the lens of the eye
- Cornea of eye less than 10mm in diameter
- Corneal opacity
Εμφάνιση 8 ακόμη χαρακτηριστικών
Abnormality of the musculoskeletal system
- Hernia
- Hunched back
- Short long bone
- Abnormality of the ribs
- Congenital diaphragmatic hernia
- Kyphoscoliosis
- Vertebral fusion
- Giant cell tumor of bone
Εμφάνιση 5 ακόμη χαρακτηριστικών
Abnormality of the digestive system
- Constipation
- Abdominal pain
- Absence or narrowing of first part of small bowel
- Acid reflux
- Aerophagia
- Inguinal hernia
- Intestinal malrotation
- Omphalocele
Εμφάνιση 4 ακόμη χαρακτηριστικών
Abnormality of the genitourinary system
- Underdeveloped labia
- Cystic kidney disease
- Absent/small kidney
- Horseshoe kidney
- Hydronephrosis
- Bifid ureter
- Double ureter
- Small clitoris
Εμφάνιση 1 ακόμη χαρακτηριστικού
Εξωτερικοί σύνδεσμοι
Εγγραφές γονιδίου
Μεταγράφημα
Πρωτεΐνη
Από πού προέρχονται αυτά
- HGNC: το σύμβολο, το όνομα, τα άλλα σύμβολα και η θέση του γονιδίου.
- MANE Select v1.5, από NCBI και EMBL-EBI: το μεταγράφημα, τα εξόνιά του και η κωδικοποιούσα αλληλουχία.
- GenCC και ClinGen, έκδοση 2026-10-19: ποιες παθήσεις συνδέονται με το γονίδιο και πόσο ισχυρή είναι αυτή η σύνδεση.
- Η λίστα δευτερευόντων ευρημάτων του ACMG, SF v3.2.
- ClinVar και οι στρωματοποιήσεις GIAB: γνωστές θέσεις που προκαλούν νόσο, και οι περιοχές που οι βραχείες αναγνώσεις βρίσκουν δύσκολες.
- Οι στρωματοποιήσεις γονιδιώματος Genome in a Bottle, από το NIST: η βαθμολογία δυσκολίας αλληλούχισης.
- Το Human Phenotype Ontology, έκδοση 2026-09-01: τα χαρακτηριστικά που συνδέονται με το γονίδιο. Μάθετε περισσότερα στο hpo.jax.org.
- Έκδοση δεδομένων 2026.10.19-9814e911.
Παραπομπή σε αυτή τη σελίδα
Dante Labs. (χ.η.). Γονίδιο PORCN: porcupine O-acyltransferase. Ανάκτηση 20 Οκτωβρίου 2026, από https://dantelabs.com/el/genes/porcn
Dante Labs. Γονίδιο PORCN: porcupine O-acyltransferase [Internet]. [ανακτήθηκε 20 Οκτωβρίου 2026]. Διαθέσιμο από: https://dantelabs.com/el/genes/porcn
Ένα τεστ. Απαντήσεις για όλη τη ζωή.
Από 449 $Δωρεάν αποστολή · Αποτελέσματα σε 6–8 εβδομάδες