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Gène

PTPN22

protein tyrosine phosphatase non-receptor type 22

Résumé

Localisation cytogénétique
1p13.2
Coordonnées
Chromosome 1 : 113 813 811–113 871 712 (GRCh38)
Exons
21 exons sur 57,9 kb
Protéine
807 acides aminés
Aussi appelé
Lyp, Lyp1, Lyp2
Symboles précédents
PTPN8
Transcrit MANE Select
ENST00000359785.10NM_015967.8
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore PTPN22. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de PTPN22

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 1, avec un crochet à l'emplacement de PTPN22. PTPN22 et 9 gènes à proximité sur le chromosome 1, de 113 342 762 à 114 342 761.Chromosome 11p13.2p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q44113,4 Mb113,6 Mb113,8 Mb114 Mb114,2 MbMAGI3 : 113 390 390–113 687 431, brin directMAGI3PHTF1 : 113 696 052–113 759 908, brin inversePHTF1RSBN1 : 113 761 429–113 812 551, brin inverseRSBN1PTPN22 : 113 813 811–113 871 712, brin inversePTPN22BCL2L15 : 113 876 816–113 887 588, brin inverseBCL2L15AP4B1 : 113 894 194–113 905 722, brin inverseAP4B1DCLRE1B : 113 904 403–113 914 140, brin directDCLRE1BHIPK1 : 113 929 324–113 977 869, brin directHIPK1OLFML3 : 113 979 024–114 035 572, brin directOLFML3SYT6 : 114 089 291–114 153 880, brin inverseSYT6Schéma de PTPN22 : 21 exons sur le brin inverse du chromosome 1Exon 21 : 113 813 811–113 814 969, 1 159 basesExon 20 : 113 819 577–113 819 654, 78 basesExon 19 : 113 825 142–113 825 172, 31 basesExon 18 : 113 829 592–113 829 707, 116 basesExon 17 : 113 829 949–113 830 029, 81 basesExon 16 : 113 833 111–113 833 138, 28 basesExon 15 : 113 834 309–113 834 439, 131 basesExon 14 : 113 834 910–113 834 993, 84 basesExon 13 : 113 837 590–113 838 407, 818 basesExon 12 : 113 838 544–113 838 620, 77 basesExon 11 : 113 848 540–113 848 626, 87 basesExon 10 : 113 852 027–113 852 104, 78 basesExon 9 : 113 854 471–113 854 537, 67 basesExon 8 : 113 854 907–113 855 049, 143 basesExon 7 : 113 856 382–113 856 441, 60 basesExon 6 : 113 856 548–113 856 619, 72 basesExon 5 : 113 857 738–113 857 776, 39 basesExon 4 : 113 858 478–113 858 573, 96 basesExon 3 : 113 859 002–113 859 078, 77 basesExon 2 : 113 859 352–113 859 460, 109 basesExon 1 : 113 871 537–113 871 712, 176 bases21201510515′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 3,6 kb sur les 57,9 kb du gène ; 2 424 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène PTPN22 : protein tyrosine phosphatase non-receptor type 22. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/ptpn22

Vancouver

Dante Labs. Gène PTPN22 : protein tyrosine phosphatase non-receptor type 22 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/ptpn22

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