Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi

Geeni

JAGN1

jagunal vesicle mediated transporter 1

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
3p25.3
Koordinaatit
Kromosomi 3: 9 890 610–9 894 349 (GRCh38)
Eksonit
2 eksonia 3,7 kb:n alueella
Proteiini
183 aminohappoa
Tunnetaan myös nimellä
GL009, FLJ14602
MANE Select -transkripti
ENST00000647897.1NM_032492.4
Lokustyyppi
gene with protein product
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

ViitegenomiGRCh38

Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.

Tähän geeniin liittyvä kuratoitu raportti

JAGN1-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
  • Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
  • Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Kromosomi 3, jossa hakasulke osoittaa JAGN1-geenin sijainnin. JAGN1 ja 30 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 3, välillä 9 392 480–10 392 479.Kromosomi 33p25.3p26.3p26.2p26.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25.1q25.2q25.31q25.32q25.33q26.1q26.2q26.31q26.32q26.33q27.1q27.2q27.3q28q299,4 Mb9,6 Mb9,8 Mb10 Mb10,2 MbSETD5: 9 397 609–9 479 240, juoste eteenpäinSETD5LHFPL4: 9 498 361–9 553 862, juoste taaksepäinLHFPL4MTMR14: 9 649 307–9 702 394, juoste eteenpäinMTMR14CPNE9: 9 703 691–9 729 908, juoste eteenpäinCPNE9BRPF1: 9 731 726–9 748 019, juoste eteenpäinBRPF1OGG1: 9 749 938–9 791 067, juoste eteenpäinOGG1CAMK1: 9 757 341–9 770 606, juoste taaksepäinTADA3: 9 779 964–9 793 011, juoste taaksepäinARPC4: 9 792 484–9 807 704, juoste eteenpäinARPC4ARPC4-TTLL3: 9 793 082–9 835 401, juoste eteenpäinARPC4-TTLL3TTLL3: 9 808 086–9 856 087, juoste eteenpäinTTLL3RPUSD3: 9 831 633–9 844 602, juoste taaksepäinRPUSD3CIDEC: 9 864 169–9 891 008, juoste taaksepäinCIDECJAGN1: 9 890 610–9 894 349, juoste eteenpäinJAGN1IL17RE: 9 902 612–9 916 402, juoste eteenpäinIL17REIL17RC: 9 917 040–9 933 630, juoste eteenpäinIL17RC: 9 917 116–9 945 385, juoste eteenpäinCRELD1: 9 933 791–9 945 413, juoste eteenpäinPRRT3: 9 939 450–9 952 442, juoste taaksepäinEMC3: 9 957 217–10 011 202, juoste taaksepäinEMC3FANCD2: 10 026 370–10 101 937, juoste eteenpäinFANCD2FANCD2OS: 10 081 317–10 108 290, juoste taaksepäinFANCD2OSBRK1: 10 115 590–10 135 082, juoste eteenpäinBRK1VHL: 10 141 764–10 153 676, juoste eteenpäinVHLIRAK2: 10 164 862–10 243 756, juoste eteenpäinIRAK2TATDN2: 10 248 023–10 281 218, juoste eteenpäinTATDN2: 10 249 042–10 249 366, juoste eteenpäin: 10 249 372–10 285 796, juoste eteenpäinGHRL: 10 285 666–10 292 959, juoste taaksepäinGHRLSEC13: 10 293 131–10 321 207, juoste taaksepäinSEC13ATP2B2: 10 324 023–10 708 060, juoste taaksepäinATP2B2JAGN1-kaavio: 2 eksonia kromosomin 3 juosteella, eteenpäinEksoni 1: 5 tunnettua tautia aiheuttavaa kohtaaEksoni 2: 3 tunnettua tautia aiheuttavaa kohtaaEkson 1: 9 890 610–9 890 811, 202 emästäEkson 2: 9 892 915–9 894 349, 1 435 emästä125′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 1,6 kb geenin 3,7 kb:stä; 552 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

Miten genomitesti lukee geeniä JAGN1

8

JAGN1-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi

Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.

Kokogenomi kattaa kaikki 3,7 kb geenistä JAGN1, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 1,6 kb eksoneja.

Mistä tieto on peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
  • ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
  • ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
  • Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
  • Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). JAGN1-geeni: jagunal vesicle mediated transporter 1. Haettu 16. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/jagn1

Vancouver

Dante Labs. JAGN1-geeni: jagunal vesicle mediated transporter 1 [Internet]. [viitattu 16. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/jagn1

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test