Geen
VHL
von Hippel-Lindau tumor suppressor
- HGNC 12687↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000134086↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 7428↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 3p25.3
- Koordinaadid
- Kromosoom 3: 10 141 778–10 153 667 (GRCh38)
- Eksonid
- 3 eksonit, ulatus 11,9 kb
- Valk
- 213 aminohapet
- Pärilikkus
- Autosoomne dominantne Autosoomne retsessiivne
- Tuntud ka kui
- VHL1
- MANE Select transkript
- ENST00000256474.3NM_000551.4
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
Loe VHL ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanded
Pärilik feokromotsütoom ja paraganglioom
- Pärilik feokromotsütoomAutosoomne dominantne
Pärilik eelsoodumus neerupealise medulla katehhoolamiine tootvatele kasvajatele.
- 1 GenCC-i esitaja hindab seda kindlaks või tugevaks
Mida teadmine muudab
Biokeemiline sõeluuring ja pildidiagnostika võimaldavad kasvajad varakult avastada ja eemaldada.
Neerukasvaja
Neeru primaarne või metastaatiline pahaloomuline kasvaja.
- 1 GenCC-i esitaja hindab seda kindlaks või tugevaks
Polütsteemia
- Tšuvaši polütsteemiaAutosoomne retsessiivne
Tšuvaši erütrotsütoos on haruldane geneetiline, kaasasündinud sekundaarse polütsteemia haigus, mida iseloomustavad kõrgenenud hemoglobiini, hematokriti ja seerumi erütropoetiini tase ning normaalne hapniku afiinsus. Tavaliselt avaldub see peavalu, pearingluse, hingeldamise ja/või naha punetusena. Patsientidel on suurenenud risk verejooksude, trombooside ja varajase surma tekkeks.
- 2 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Kuseteede ja neerude kasvaja
- Kuseteede süsteemi neoplasm
Kuseteede süsteemi haarav healoomuline või pahaloomuline, esmane või metastaatiline neoplasm.
- 1 GenCC-i esitaja hindab seda kindlaks või tugevaks
Von Hippel-Lindau tõbi
- Autosoomne dominantne
VHL-iga seotud kasvajate eelsoodumuse sündroom, mille korral esinevad hemangioblastoomid, neerurakk-kartsinoom, feokromotsütoom ja kõhunäärme neuroendokriinsed kasvajad.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 4 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
- ACMG teisese leiu loetelus
Mida teadmine muudab
Eluaegne mitmeelundiline jälgimine, neeru säilitav kirurgia, belzutifan (HIF-2α inhibiitor), kaskaadne testimine, sünnieelne nõustamine
Pärandumine
- Autosoomne dominantne
- Üks muudetud koopia kumbast vanemast tahes on piisav. Vanem, kellel see on, annab selle edasi igale lapsele kahe võimalusest ühe tõenäosusega.
- Autosoomne retsessiivne
- Selleks on vaja muudetud koopiat kummastki vanemast. Ühe koopia korral oled kandja ja tavaliselt ei avaldu see sinul haigusena; kui mõlemad vanemad on kandjad, on igal lapsel neljast ühe võimalus pärida kaks koopiat.
Kuidas VHL on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
- Variandid, millel on leht
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 4,4 kb kogupikkusega 11,9 kb; neist 642 alust kodeerivad valku.
Kuidas genoomitest loetakse VHL
251
kohad geenis VHL, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist 3 (1,2%) asuvad lõikudes, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.
- Low mappability (3 kohta)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni VHL 11,9 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (4,4 kb).
Variandid, millel on leht (129)
Siin on VHL variandid, millel on leht, kõige rohkem hindamistähti kõigepealt. Iga leht kirjeldab ClinVari avalikku andmekogu variandi kohta, mitte tulemust.
| Variant | HGVS c. | Ekson või intron | Positsioon (GRCh38) | ClinVari klassifikatsioon | Ülevaatuse staatus |
|---|---|---|---|---|---|
| c.341-2A>G | Intron 1 | 10 146 512 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud | |
| c.463+1G>A | Intron 2 | 10 146 637 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud | |
| E70X | c.208G>T | Ekson 1 | 10 142 055 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| E160Sfs*10 | c.477del | Ekson 3 | 10 149 797 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| F136Lfs*23 | c.408del | Ekson 2 | 10 146 578 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| K196X | c.586A>T | Ekson 3 | 10 149 909 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| N78S | c.233A>G | Ekson 1 | 10 142 080 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| N141Kfs*3 | c.422dup | Ekson 2 | 10 146 593 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| P86L | c.257C>T | Ekson 1 | 10 142 104 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| Q195X | c.583C>T | Ekson 3 | 10 149 906 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
Samade haigustega seotud geenid
- SDHBsuccinate dehydrogenase complex iron sulfur subunit BJagab 3 haigust
- BAP1BRCA1 associated deubiquitinase 1Jagab 2 haigust
- ELP4elongator acetyltransferase complex subunit 4Jagab 2 haigust
- FLCNfolliculinJagab 2 haigust
- METMET proto-oncogene, receptor tyrosine kinaseJagab 2 haigust
- PAX6paired box 6Jagab 2 haigust
- RETret proto-oncogeneJagab 2 haigust
- TP53tumor protein p53Jagab 2 haigust
- TRIM28tripartite motif containing 28Jagab 2 haigust
- MAXMYC associated transcriptional regulator XJagab 1 haigust
- SDHAsuccinate dehydrogenase complex flavoprotein subunit AJagab 1 haigust
- SDHAF2succinate dehydrogenase complex assembly factor 2Jagab 1 haigust
Geeniga VHL seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida VHL võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of the cardiovascular system
- Increased blood pressure in blood vessels of lungs
- Decrease in blood pressure upon standing up
- Fainting spell
- High blood pressure
- Hypertension associated with pheochromocytoma
- Hypertensive retinopathy
- Palpitations
- Positive regitine blocking test
Näita veel 18 tunnust
- Sinus tachycardia
- Abnormal heart rate
- Abnormal left ventricular function
- Arachnoid hemangiomatosis
- Cardiac failure
- Disease of the heart muscle
- Hypertensive crisis
- Inflammation of heart muscle
- Stroke
- Heart attack
- Elevated heart rate
- Hepatic hemangioma
- Intermittent high blood pressure
- Low blood pressure
- Narrowing of kidney artery
- Pulmonary capillary hemangiomatosis
- Strawberry mark
- Varicose veins
Abnormality of the nervous system
- Headache
- Cerebellar hemangioblastoma
- Episodic paroxysmal anxiety
- Recurrent paroxysmal headache
- Anxiety
- Cranial nerve compression
- Inability to move vocal cords
- Panic attack
Näita veel 3 tunnust
Laboratory abnormality
- Elevated urinary catecholamines
- Elevated urinary dopamine
- Elevated urinary epinephrine level
- Elevated urinary norepinephrine level
- High blood calcium levels
- High urine protein levels
- Blood in urine
- Elevated calcitonin
Näita veel 1 tunnus
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). VHL geen: von Hippel-Lindau tumor suppressor. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/vhl
Dante Labs. VHL geen: von Hippel-Lindau tumor suppressor [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/vhl
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast