Gén
IFIH1
interferon induced with helicase C domain 1
- HGNC 18873↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000115267↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 64135↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 2q24.2
- Koordináták
- 2. kromoszóma: 162 267 074–162 318 684 (GRCh38)
- Exonok
- 16 exon, összesen 51,6 kb
- Fehérje
- 1025 aminosav
- Más néven ismert
- MDA-5, Hlcd, MDA5, IDDM19
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000649979.2NM_022168.4
- Lokusz típusa
- Fehérjét kódoló
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Ez az oldal adatként
Adja hozzá a .json végződést az oldal címéhez, vagy kérjen application/json típust, hogy JSON-ként olvassa be.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/ifih1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOlvassa el a IFIH1-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések
Aicardi-Goutieres Syndrome
- IFIH1-related type 1 interferonopathyAutoszomális domináns
IFIH1 gain-of-function variants causing Aicardi-Goutieres syndrome or Singleton-Merten syndrome.
- A ClinGen a kapcsolatot a következőként minősíti: bizonyított
- 5 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
- Autoszomális recesszív
Aicardi-Goutieres syndrome (AGS) is an inherited, subacute encephalopathy characterized by the association of basal ganglia calcification, leukodystrophy and cerebrospinal fluid (CSF) lymphocytosis.
- 4 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
Osteogenesis Imperfecta
A group of inherited connective tissue disorders causing fragile bones that break easily, often with blue sclerae, hearing loss and dental problems.
- 2 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
▶Beavatkozhatóság
Cyclic IV bisphosphonates (pamidronate, zoledronate); orthopedic rodding of long bones; physical therapy; denosumab (in clinical use for pediatric OI); romosozumab (in development); hearing monitoring; dental management for dentinogenesis imperfecta
Rare Monogenic Autoinflammatory Diseases
- PTPN2-related autoinflammation and autoimmunityAutoszomális domináns
Early-onset inflammatory and autoimmune disease, including colitis and arthritis, caused by variants in PTPN2.
- 4 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
Type I Interferonopathies
- Singleton-Merten syndrome 1Autoszomális domináns
Dental anomalies, calcification of the aorta and heart valves, and bone changes caused by IFIH1 gain-of-function variants.
- 2 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
Átfogóbb csoportosítások
Other Inborn Errors of Immunity
- Inborn error of immunity
A 114 hozzá kapcsolódó gén egyike
Inherited disorders of the immune system caused by changes in single genes, affecting how the body fights infection or regulates inflammation.
- 4 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
Inherited Neurodegenerative Disorders
- KIF5A-Related Neurodegenerative DisorderAutoszomális domináns
A 372 hozzá kapcsolódó gén egyike
Caused by changes in one copy of KIF5A, which encodes a motor protein with a cargo-binding tail. Different types of change lead to different conditions: hereditary spastic paraplegia type 10, an axonal form of Charcot-Marie-Tooth disease and amyotrophic lateral sclerosis (ALS).
- 4 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
▶Beavatkozhatóság
Care is symptomatic and depends on the presentation, including physiotherapy, antispasticity medicines and multidisciplinary ALS care. Each child of an affected person has a 1 in 2 chance of inheriting the change; genetic counselling helps families understand this.
Other Inherited Leukodystrophies
- Leukodystrophy (other and unspecified types)
A 80 hozzá kapcsolódó gén egyike
Inherited conditions that damage or prevent the normal formation of myelin, the white matter of the brain and spinal cord. Different types follow autosomal recessive, autosomal dominant or X-linked inheritance depending on the gene involved.
- 4 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
▶Beavatkozhatóság
Knowing the specific genetic cause can end a diagnostic search, guide supportive care and surveillance, show whether a specific treatment exists, and allow testing of relatives.
A IFIH1 felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Ismert betegségokozó helyek
- Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 51,6 kb-jából 3,6 kb-ot tesznek ki; ezek közül 3078 bázis kódolja a fehérjét.
IFIH1 szekvenálása
3Könnyű
Mennyire nehéz a IFIH1 szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-ból
0 · Könnyű100 · Nehéz
A IFIH1 exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.
Ami tovább nehezíti: a IFIH1 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban
- LeképezhetőségOlyan szakaszok, ahol a 100 vagy 250 bp-os olvasatok nem helyezhetők el egyértelműen, így a hívás ott hiányozhat vagy hibás lehet. Súly: 100%.0%
- HomológiaSzegmentális duplikációk: a genom más helyein lévő másolatok, például paralógok és pszeudogének, legalább 90%-os azonossággal. Súly: 60%.0%
- Shared with chrYThe pseudoautosomal regions and the X-transposed region, where chrX and chrY carry the same or nearly the same sequence, so reads from either may land on the other. Súly: 60%.0%
- Referencia-lefedettségA közeli referencia-összeszerelés hiányai, ahol nincs olyan szekvencia, amelyhez az olvasatok igazodhatnának. Súly: 50%.0%
- IsmétlődésekTandem ismétlődések és egyetlen bázisból álló ismétlések, amelyeken az olvasatok megcsúsznak, és amelyeket esetleg nem fognak át. Súly: 30%.5,8%
- GC-tartalomOlyan szakaszok, ahol a G és C bázisok aránya 25% alatti vagy 65% feletti, és amelyeket a könyvtárkészítés gyengén fed le. Súly: 20%.8,4%
A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein nyugszik, a nehezen szekvenálható régiókat mutatja be.Így számítjuk kiMinden oszlop a IFIH1 exonbázisainak azon arányát mutatja, amely az adott típusú nehéz régióban van. Bármelyik típus önmagában is nehézzé teheti a gént, a további típusok azonban egyre kevesebbet adnak hozzá: 0, ha egy bázis sem esik egyik típusba sem, 100, ha minden bázis olyan helyen van, ahol az olvasatok nem helyezhetők el egyértelműen.
20
a IFIH1 génben azok a pozíciók, ahol a ClinVar kórokozónak vagy valószínűleg kórokozónak minősít egy változást
Ezek közül egy sem esik olyan régióba, amelyet a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
A teljes genomszekvenálás a IFIH1 mind a 51,6 kb-os hosszát lefedi, beleértve az intronokat is, nem csak az exonok 3,6 kb-át.
ClinVar pathogenic variants (22)
The IFIH1 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogén 5
- Patogén/valószínűleg patogén 2
- Valószínűleg patogén 15
| Variáns | Conditions | ClinVar-besorolás | Felülvizsgálati állapot |
|---|---|---|---|
| NM_022168.4(IFIH1):c.2336G>A (p.Arg779His) (opens in a new tab) | Aicardi-Goutieres syndrome 7 and 3 others | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_022168.4(IFIH1):c.2335C>T (p.Arg779Cys) (opens in a new tab) | Aicardi-Goutieres syndrome 7 and 1 other | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_022168.4(IFIH1):c.2159G>A (p.Arg720Gln) (opens in a new tab) | Aicardi-Goutieres syndrome 7 and 1 other | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_022168.4(IFIH1):c.2465G>A (p.Arg822Gln) (opens in a new tab) | Aicardi-Goutieres syndrome 7 and 1 other | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_022168.4(IFIH1):c.2336G>T (p.Arg779Leu) (opens in a new tab) | Aicardi-Goutieres syndrome 7 and 1 other | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_022168.4(IFIH1):c.2936T>G (p.Leu979Trp) (opens in a new tab) | Aicardi-Goutieres syndrome 7 and 1 other | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_022168.4(IFIH1):c.1738C>T (p.Gln580Ter) (opens in a new tab) | Aicardi-Goutieres syndrome 7 | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_022168.4(IFIH1):c.2472A>C (p.Arg824Ser) (opens in a new tab) | Aicardi-Goutieres syndrome 7 | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_022168.4(IFIH1):c.2465G>C (p.Arg822Pro) (opens in a new tab) | Aicardi-Goutieres syndrome 7 and 1 other | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_022168.4(IFIH1):c.2068del (p.Leu690fs) (opens in a new tab) | immunodeficiency 95 | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_022168.4(IFIH1):c.2067del (p.Arg689fs) (opens in a new tab) | IFIH1-related type 1 interferonopathy and 1 other | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_022168.4(IFIH1):c.2035_2036del (p.Leu679fs) (opens in a new tab) | immunodeficiency 95 | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_022168.4(IFIH1):c.1943del (p.Gly648fs) (opens in a new tab) | immunodeficiency 95 | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_022168.4(IFIH1):c.1764del (p.Ala589fs) (opens in a new tab) | immunodeficiency 95 | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_022168.4(IFIH1):c.1583del (p.Leu528fs) (opens in a new tab) | immunodeficiency 95 | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_022168.4(IFIH1):c.1246A>C (p.Ile416Leu) (opens in a new tab) | Aicardi-Goutieres syndrome 7 | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_022168.4(IFIH1):c.1178A>T (p.Asp393Val) (opens in a new tab) | Aicardi-Goutieres syndrome 7 | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_022168.4(IFIH1):c.986T>C (p.Leu329Pro) (opens in a new tab) | Aicardi-Goutieres syndrome 7 and 1 other | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_022168.4(IFIH1):c.716dup (p.Met240fs) (opens in a new tab) | Aicardi-Goutieres syndrome 7 and 1 other | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_022168.4(IFIH1):c.454-1G>A (opens in a new tab) | Aicardi-Goutieres syndrome | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_022168.4(IFIH1):c.453+1G>A (opens in a new tab) | immunodeficiency 95 | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_022168.4(IFIH1):c.317C>A (p.Ser106Ter) (opens in a new tab) | immunodeficiency 95 | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
Ugyanazokhoz a betegségekhez kapcsolódó gének
- ADARadenosine deaminase RNA specific5 betegséget oszt meg
- RNASEH2Aribonuclease H2 subunit A5 betegséget oszt meg
- RNASEH2Bribonuclease H2 subunit B5 betegséget oszt meg
- RNASEH2Cribonuclease H2 subunit C5 betegséget oszt meg
- RNU7-1RNA, U7 small nuclear 15 betegséget oszt meg
- SAMHD1SAM and HD domain containing deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase 15 betegséget oszt meg
- TREX1three prime repair exonuclease 15 betegséget oszt meg
- POLR3ARNA polymerase III subunit A3 betegséget oszt meg
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 12 betegséget oszt meg
- AARS2alanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial2 betegséget oszt meg
- ABCD1ATP binding cassette subfamily D member 12 betegséget oszt meg
- ACER3alkaline ceramidase 32 betegséget oszt meg
A(z) IFIH1 génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) IFIH1 gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Abnormality of the nervous system
- Degeneration of cerebrum
- Global developmental delay
- Arrhinencephaly
- Cavity within brain
- IQ less than 20
- Multifocal cerebral white matter abnormalities
- Abnormal gait
- Abnormality of extrapyramidal motor function
Még 23 tulajdonság megjelenítése
- Brain degeneration
- Chronic CSF lymphocytosis
- Degeneration of cerebellum
- Dystonia
- Epilepsy
- Irritability
- Leukodystrophy
- Loss of developmental milestones
- Loss of speech
- Paralysis or weakness of one side of body
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Ventriculomegaly
- Abnormal pyramidal sign
- Delayed myelination
- Demyelinating peripheral neuropathy
- Headache
- Paralysis of all four limbs
- Tetraparesis
- Tremor
- Degeneration of the striatum
- Absent speech development
- Intellectual disability
- Waddling gait
Abnormality of the musculoskeletal system
- Involuntary muscle stiffness, contraction, or spasm
- Joint subluxation
- Low muscle tone in trunk
- Osteopenia
- Spasticity and rigidity of muscles
- Abnormal deposits of calcium in the brain
- Basal ganglia calcification
- Extrapyramidal muscular rigidity
Még 18 tulajdonság megjelenítése
- Intracerebral periventricular calcifications
- Arthritis
- Low muscle tone
- Lower limb spasticity
- Multiple joint contractures
- Muscle stiffness
- Poor head control
- Scoliosis
- Spastic paraparesis
- Spastic tetraplegia
- Enchondroma
- Loss of fat tissue in localized area
- Generalized decreased muscle tone
- Muscle fiber degeneration
- Muscle weakness
- Osteoporosis
- Spastic tetraparesis
- Tendon rupture
Abnormality of the cardiovascular system
- Enlarged liver and spleen
- Increased spleen size
- Cutis marmorata
- Enlarged and thickened heart muscle
- Enlarged heart
- Fluid around heart
- Generalized swelling of lymph nodes
- High blood pressure
Még 12 tulajdonság megjelenítése
- Hives
- Inflammation of blood vessel
- Raynaud phenomenon
- Bulge in wall of large artery that carries blood away from heart
- Calcification of the aorta
- Moyamoya phenomenon
- Aortic arch calcification
- Aortic valve calcification
- Cardiac failure
- Mitral valve calcification
- Narrowing of aortic valve
- Narrowing of blood vessel below aortic heart valve
Abnormality of limbs
- Breakdown of small bones of fingers
- Increased muscle tone of arm or leg
- Club feet
- Coxa valga
- Expanded metacarpals with widened medullary cavities
- Expanded metatarsals with widened medullary cavities
- Expanded phalanges with widened medullary cavities
- High-arched foot
Még 5 tulajdonság megjelenítése
Abnormality of the immune system
- Recurrent respiratory infections
- Recurrent viral pneumonia
- Autoimmunity
- Chilblains
- Increased circulating interferon-gamma concentration
- Inflammation of fat tissue
- Pneumonia
- Recurrent chest infections
Még 3 tulajdonság megjelenítése
Laboratory abnormality
- Episodic fever
- Fluid retention
- High liver enzymes
- Increased CSF interferon alpha
- Unexplained fevers
- Diabetes mellitus
- Elevated serum ferritin
- Fatty infiltration of liver
Még 2 tulajdonság megjelenítése
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Decreased blood lymphocyte number
- Low platelet count
- Hemolytic anemia
- Low blood cell count
- Low number of red blood cells or hemoglobin
- Neonatal alloimmune thrombocytopenia
- Rectal bleeding
- Vomiting blood
Még 1 tulajdonság megjelenítése
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Az adatok forrásai
- HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-19 kiadás: mely állapotokhoz kapcsolódik a gén, és milyen erős a kapcsolat.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- ClinVar és a GIAB-stratifikációk: ismert betegséget okozó helyek és azok a régiók, amelyeket a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
- A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.19-9814e911.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). IFIH1 gén: interferon induced with helicase C domain 1. Lekérve: 2026. október 19., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/ifih1
Dante Labs. IFIH1 gén: interferon induced with helicase C domain 1 [Internet]. [idézve: 2026. október 19.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/ifih1
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt