Gen
PALB2
partner and localizer of BRCA2
- HGNC 26144↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000083093↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 79728↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 16p12.2
- Souřadnice
- Chromozom 16: 23 603 165–23 641 310 (GRCh38)
- Exony
- 13 exonů na 38,1 kb
- Protein
- 1 186 aminokyselin
- Dědičnost
- Autozomálně dominantní Autozomálně recesivní
- Další názvy
- FLJ21816, FANCN
- Transkript MANE Select
- ENST00000261584.9NM_024675.4
- Typ lokusu
- gene with protein product
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Referenční genomGRCh38hg38
Pozice na stránkách genů a variant se řídí touto volbou v tomto prohlížeči.
Přečtěte si PALB2 i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorované reporty související s tímto genem
DNA Repair Disease
- Autozomálně recesivní
A disease that has its basis in the disruption of DNA repair.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 4 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Fanconi Anemia
- Autozomálně recesivní
Fanconi anemia (FA) is a hereditary DNA repair disorder characterized by progressive pancytopenia with bone marrow failure, variable congenital malformations and predisposition to develop hematological or solid tumors.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 4 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Co přináší znalost
Hematopoietic stem cell transplantation using FA-specific reduced-intensity conditioning; androgens (oxymetholone) as bridge therapy; cancer surveillance for head/neck and gynecological malignancies; gene therapy in clinical trials
Breast and Ovarian Cancer Genes Beyond BRCA1/2
- Hereditary breast cancerAutozomálně dominantní
Inherited susceptibility to breast cancer caused by variants in one of several genes.
- 1 zadavatel GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
- V seznamu ACMG pro sekundární nálezy
Co přináší znalost
Earlier and more intensive breast screening, including MRI, may be recommended depending on the gene.
PALB2 related diseases
- Fanconi Anemia Complementation Group NAutozomálně recesivní
Any Fanconi anemia in which the cause of the disease is a mutation in the PALB2 gene.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 4 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
- Pancreatic Cancer, Susceptibility To, 3Autozomálně dominantní
Any familial pancreatic carcinoma in which the cause of the disease is a mutation in the PALB2 gene.
- 2 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
- PALB2-related cancer predispositionAutozomálně dominantní
PALB2 variants that raise the risk of breast cancer and, to a lesser degree, pancreatic and ovarian cancer.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 3 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Co přináší znalost
Enhanced breast screening including MRI, with risk-reducing surgery discussed case by case.
Dědičnost
- Autozomálně dominantní
- Stačí jedna změněná kopie od kteréhokoli z rodičů. Rodič, který ji má, ji předá každému dítěti s pravděpodobností jedna ku dvěma.
- Autozomálně recesivní
- Je potřeba změněná kopie od každého z rodičů. S jednou kopií jste nositelem a obvykle nejste postiženi; pokud jsou oba rodiče nositeli, má každé dítě pravděpodobnost jedna ku čtyřem, že zdědí dvě.
Jak je PALB2 uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
- Varianty se stránkou
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 4 kb z 38,1 kb genu; 3 561 těchto bází kódují protein.
Jak genetický test čte PALB2
1 092
pozic v genu PALB2, které ClinVar řadí mezi patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Žádné z nich neleží v oblasti, kterou krátká čtení obtížně zachycují.
Celý genom pokrývá všech 38,1 kb genu PALB2, včetně intronů, nikoli jen 4 kb exonů.
Varianty se stránkou (552)
Varianty genu PALB2 se stránkou zde, nejdříve ty s nejvyšším počtem hvězdiček hodnocení. Každá stránka popisuje veřejný záznam ClinVar o variantě, nikoli výsledek.
| Varianta | HGVS c. | Exon nebo intron | Pozice (GRCh38) | Klasifikace ClinVar | Stav hodnocení |
|---|---|---|---|---|---|
| A842Sfs*7 | c.2524_2535delinsTCAGA | Exon 6 | 23 629 255 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| c.108+1_108+2insC | Intron 2 | 23 638 068 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem | |
| c.2559C>T | Exon 6 | 23 629 231 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem | |
| c.3350+4A>G | Intron 12 | 23 607 860 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem | |
| c.3549C>A | Exon 13 | 23 603 471 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem | |
| E3X | c.7G>T | Exon 1 | 23 641 151 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| E178Nfs*15 | c.532del | Exon 4 | 23 636 013 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| G1121Vfs*3 | c.3362del | Exon 13 | 23 603 657 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| L531Cfs*30 | c.1592del | Exon 4 | 23 634 953 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| N280Tfs*8 | c.839del | Exon 4 | 23 635 706 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
Geny spojené se stejnými onemocněními
- BRIP1BRCA1 interacting DNA helicase 1Sdílí 3 onemocnění
- BRCA1BRCA1 DNA repair associatedSdílí 2 onemocnění
- BRCA2BRCA2 DNA repair associatedSdílí 2 onemocnění
- ERCC4ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunitSdílí 2 onemocnění
- FANCAFA complementation group ASdílí 2 onemocnění
- FANCBFA complementation group BSdílí 2 onemocnění
- FANCCFA complementation group CSdílí 2 onemocnění
- FANCD2FA complementation group D2Sdílí 2 onemocnění
- FANCEFA complementation group ESdílí 2 onemocnění
- FANCFFA complementation group FSdílí 2 onemocnění
- FANCGFA complementation group GSdílí 2 onemocnění
- FANCIFA complementation group ISdílí 2 onemocnění
Rysy spojené s PALB2
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit PALB2. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Abnormality of the genitourinary system
- Abnormal kidney location
- Abnormal fallopian tube morphology
- Ovarian cancer
- Abnormally shaped kidney
- Nephroblastoma
- Urinary tract abnormalities
- Abnormal localisation of kidneys
- Abnormal preputium morphology
Zobrazit ještě 17 rysů
- Abnormality of the testis
- Abnormality of the uterus
- Absent kidney on one side
- Absent sperm in semen
- Absent testes
- Absent/small kidney
- Decreased fertility in males
- Frequent urinary tract infections
- Heart shaped uterus
- Horseshoe kidney
- Hydroureter
- Hypospadias
- Ovarian carcinoma
- Pelvic kidney
- Prostate cancer
- Renal failure
- Undescended testes
Abnormality of the digestive system
- Pancreatic adenocarcinoma
- Abdominal pain
- Anorexia
- Inability to properly digest food due to lack of pancreatic digestive enzymes
- Poor appetite
- Primary peritoneal carcinoma
- Extrahepatic cholestasis
- Functional intestinal obstruction
Zobrazit ještě 15 rysů
- Intestinal pseudo-obstruction
- Jaundice
- Abnormal connection between trachea and esophagus
- Abnormality of the liver
- Absent anus
- Cancer of the pancreas
- Colon cancer
- Duodenal stenosis
- Enlarged colon lacking nerve cells
- Intermittent diarrhea
- Liver cancer
- Meckel diverticulum
- Nausea and vomiting
- Peritoneal abscess
- Umbilical hernia
Abnormality of the nervous system
- Global developmental delay
- Intellectual disability
- Medulloblastoma
- Abnormal shape of nervous system
- Cancer of early nerve cells
- Cranial nerve paralysis
- Increased reflexes
- Split spine
Zobrazit ještě 2 rysů
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud údaje pocházejí
- HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-16: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
- Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen PALB2: partner and localizer of BRCA2. Staženo 17. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/palb2
Dante Labs. Gen PALB2: partner and localizer of BRCA2 [Internet]. [citováno 17. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/palb2
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů