Gen
PALB2
partner and localizer of BRCA2
- HGNC 26144↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000083093↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 79728↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 16p12.2
- Koordinater
- Kromosom 16: 23 603 165–23 641 310 (GRCh38)
- Exoner
- 13 exoner på 38,1 kb
- Protein
- 1 186 aminosyror
- Arvsgång
- Autosomalt dominant Autosomalt recessiv
- Även känd som
- FLJ21816, FANCN
- MANE Select-transkript
- ENST00000261584.9NM_024675.4
- Lokustyp
- gene with protein product
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
ReferensgenomGRCh38hg38
Positioner på gen- och variantsidorna följer det här valet, i den här webbläsaren.
Läs PALB2, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterade rapporter som är relevanta för denna gen
DNA-reparationssjukdom
- Autosomalt recessiv
En sjukdom som bygger på en störning i DNA-reparationen.
- ClinGen bedömer kopplingen som definitiv
- 4 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Fanconi anemi
- Autosomalt recessiv
Fanconi anemi (FA) är en ärftlig DNA-reparationssjukdom som kännetecknas av progressiv pancytopeni med benmärgssvikt, varierande medfödda missbildningar och en benägenhet att utveckla hematologiska eller solida tumörer.
- ClinGen bedömer kopplingen som definitiv
- 4 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Vad kunskapen förändrar
Transplantation av hematopoetiska stamceller med FA-specifik konditionering med reducerad intensitet; androgener (oxymetolon) som brobehandling; cancerkontroll för huvud- och halscancer samt gynekologiska maligniteter; genterapi i kliniska prövningar
Gener för bröst- och äggstockscancer utöver BRCA1/2
- Ärftlig bröstcancerAutosomalt dominant
Ärftlig känslighet för bröstcancer orsakad av varianter i någon av flera gener.
- 1 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
- På ACMG:s lista över sekundära fynd
Vad kunskapen förändrar
Tidigare och mer intensiv mammografiundersökning, inklusive MRT, kan rekommenderas beroende på gen.
PALB2-relaterade sjukdomar
- Fanconi anemi, komplementationsgrupp NAutosomalt recessiv
Fanconis anemi där sjukdomen orsakas av en mutation i PALB2-genen.
- ClinGen bedömer kopplingen som definitiv
- 4 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
- Mottaglighet för bukspottkörtelcancer, 3Autosomalt dominant
Familjär bukspottkörtelcancer där sjukdomen orsakas av en mutation i PALB2-genen.
- 2 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
- PALB2-relaterad cancerpredispositionAutosomalt dominant
PALB2-varianter som ökar risken för bröstcancer och, i mindre grad, bukspottkörtelcancer och äggstockscancer.
- ClinGen bedömer kopplingen som definitiv
- 3 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Vad kunskapen förändrar
Utökad bröstscreening med MR, med riskreducerande kirurgi diskuterad i varje enskilt fall.
Nedärvning
- Autosomalt dominant
- En förändrad kopia, från någon av föräldrarna, räcker. En förälder som har en sådan för den vidare till varje barn med en chans på en av två.
- Autosomalt recessiv
- Det krävs en förändrad kopia från vardera föräldern. Med en är du bärare och oftast opåverkad. När båda föräldrarna är bärare har varje barn en chans på en av fyra att ärva två.
Så är PALB2 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
- Varianter med egen sida
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 4 kb av genens 38,1 kb, och 3 561 av dessa baser kodar för proteinet.
Så läser ett genomtest PALB2
1 092
positioner i PALB2 där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
Inget av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.
En helgenomsanalys täcker alla 38,1 kb av PALB2, med introner inräknade, inte bara de 4 kb exoner.
Varianter med egen sida (552)
De PALB2-varianter som har en egen sida här, med flest recensionsstjärnor först. Varje sida beskriver ClinVars offentliga register över varianten, aldrig ett resultat.
| Variant | HGVS c. | Exon eller intron | Position (GRCh38) | ClinVar-klassificering | Granskningsstatus |
|---|---|---|---|---|---|
| A842Sfs*7 | c.2524_2535delinsTCAGA | Exon 6 | 23 629 255 | Patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel |
| c.108+1_108+2insC | Intron 2 | 23 638 068 | Sannolikt patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel | |
| c.2559C>T | Exon 6 | 23 629 231 | Sannolikt patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel | |
| c.3350+4A>G | Intron 12 | 23 607 860 | Sannolikt patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel | |
| c.3549C>A | Exon 13 | 23 603 471 | Patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel | |
| E3X | c.7G>T | Exon 1 | 23 641 151 | Patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel |
| E178Nfs*15 | c.532del | Exon 4 | 23 636 013 | Patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel |
| G1121Vfs*3 | c.3362del | Exon 13 | 23 603 657 | Sannolikt patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel |
| L531Cfs*30 | c.1592del | Exon 4 | 23 634 953 | Patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel |
| N280Tfs*8 | c.839del | Exon 4 | 23 635 706 | Patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel |
Gener kopplade till samma tillstånd
- BRIP1BRCA1 interacting DNA helicase 1Delar 3 tillstånd
- BRCA1BRCA1 DNA repair associatedDelar 2 tillstånd
- BRCA2BRCA2 DNA repair associatedDelar 2 tillstånd
- ERCC4ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunitDelar 2 tillstånd
- FANCAFA complementation group ADelar 2 tillstånd
- FANCBFA complementation group BDelar 2 tillstånd
- FANCCFA complementation group CDelar 2 tillstånd
- FANCD2FA complementation group D2Delar 2 tillstånd
- FANCEFA complementation group EDelar 2 tillstånd
- FANCFFA complementation group FDelar 2 tillstånd
- FANCGFA complementation group GDelar 2 tillstånd
- FANCIFA complementation group IDelar 2 tillstånd
Egenskaper kopplade till PALB2
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som PALB2 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Abnormality of the genitourinary system
- Abnormal kidney location
- Abnormal fallopian tube morphology
- Ovarian cancer
- Abnormally shaped kidney
- Nephroblastoma
- Urinary tract abnormalities
- Abnormal localisation of kidneys
- Abnormal preputium morphology
Visa ytterligare 17 egenskaper
- Abnormality of the testis
- Abnormality of the uterus
- Absent kidney on one side
- Absent sperm in semen
- Absent testes
- Absent/small kidney
- Decreased fertility in males
- Frequent urinary tract infections
- Heart shaped uterus
- Horseshoe kidney
- Hydroureter
- Hypospadias
- Ovarian carcinoma
- Pelvic kidney
- Prostate cancer
- Renal failure
- Undescended testes
Abnormality of the digestive system
- Pancreatic adenocarcinoma
- Abdominal pain
- Anorexia
- Inability to properly digest food due to lack of pancreatic digestive enzymes
- Poor appetite
- Primary peritoneal carcinoma
- Extrahepatic cholestasis
- Functional intestinal obstruction
Visa ytterligare 15 egenskaper
- Intestinal pseudo-obstruction
- Jaundice
- Abnormal connection between trachea and esophagus
- Abnormality of the liver
- Absent anus
- Cancer of the pancreas
- Colon cancer
- Duodenal stenosis
- Enlarged colon lacking nerve cells
- Intermittent diarrhea
- Liver cancer
- Meckel diverticulum
- Nausea and vomiting
- Peritoneal abscess
- Umbilical hernia
Abnormality of the eye
- Wide-set eyes
- Abnormally small eyeball
- Abnormality of the eye
- Abnormality of vision
- Absent/small iris
- Astigmatism
- Bulging eye
- Clouding of the lens of the eye
Visa ytterligare 4 egenskaper
Abnormality of the nervous system
- Global developmental delay
- Intellectual disability
- Medulloblastoma
- Abnormal shape of nervous system
- Cancer of early nerve cells
- Cranial nerve paralysis
- Increased reflexes
- Split spine
Visa ytterligare 2 egenskaper
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppt 2026-10-16: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt kopplingen är.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsorsakande positioner och de regioner där korta läsningar har svårt.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.16-c6eea6bf.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). PALB2-genen: partner and localizer of BRCA2. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/palb2
Dante Labs. PALB2-genen: partner and localizer of BRCA2 [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/palb2
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor