Geeni
PALB2
partner and localizer of BRCA2
- HGNC 26144↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000083093↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 79728↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 16p12.2
- Koordinaatit
- Kromosomi 16: 23 603 165–23 641 310 (GRCh38)
- Eksonit
- 13 eksonia 38,1 kb:n alueella
- Proteiini
- 1 186 aminohappoa
- Periytyminen
- Autosomaalinen dominantti Autosomaalinen resessiivinen
- Tunnetaan myös nimellä
- FLJ21816, FANCN
- MANE Select -transkripti
- ENST00000261584.9NM_024675.4
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue PALB2 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja
DNA-korjausmekanismin häiriöön liittyvä sairaus
- Autosomaalinen resessiivinen
Sairaus, jonka taustalla on DNA:n korjausmekanismien häiriö.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 4 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Fanconin anemia
- Autosomaalinen resessiivinen
Fanconin anemia (FA) on perinnöllinen DNA:n korjaushäiriö, jolle on ominaista etenevä pansytopenia luuytimen vajaatoiminnan vuoksi, vaihtelevat synnynnäiset epämuodostumat ja alttius kehittää veri- tai kiinteitä kasvaimia.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 4 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
Hematopoieettisten kantasolujen siirto FA-spesifisellä vähennetyn intensiteetin valmistelulla; androgeenit (oksimetolone) siltahoitona; syöpäseuranta pään ja kaulan sekä gynekologisten syöpien varalta; geenihoito kliinisissä tutkimuksissa
Rintasyöpägeenit BRCA1/2:n lisäksi
- Perinnöllinen rintasyöpäAutosomaalinen dominantti
Perinnöllinen alttius rintasyöpään, jonka aiheuttavat variantit yhdessä useista geeneistä.
- 1 GenCC-arvioija arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelossa
Mitä tieto muuttaa
Geenistä riippuen voidaan suositella aiempaa ja tiiviimpää rintojen seulontaa, mukaan lukien MRI-tutkimus.
PALB2-geeniin liittyvät sairaudet
- Fanconin anemia, komplementaatioryhmä NAutosomaalinen resessiivinen
Mikä tahansa Fanconin anemia, jonka syy on PALB2-geenin mutaatio.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 4 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
- Haimasyöpä, alttius, 3Autosomaalinen dominantti
Mikä tahansa suvussa esiintyvä haimasyöpä, jonka syy on PALB2-geenin mutaatio.
- 2 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
- PALB2-geenin aiheuttama syöpäalttiusAutosomaalinen dominantti
PALB2-variantit, jotka lisäävät rintasyövän riskiä ja, vähemmässä määrin, haimasyövän ja munasarjasyövän riskiä.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 3 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
Rintojen seulonnan tehostaminen, mukaan lukien MRI-tutkimus. Riskiä pienentävää leikkausta harkitaan tapauskohtaisesti.
Periytyminen
- Autosomaalinen dominantti
- Yksi muuttunut kopio kummalta vanhemmalta tahansa riittää. Vanhempi, jolla on yksi, siirtää sen kullekin lapselleen todennäköisyydellä yksi kahdesta.
- Autosomaalinen resessiivinen
- Tarvitaan muuttunut kopio kummaltakin vanhemmalta. Yhdellä olet kantaja ja yleensä oireeton. Kun molemmat vanhemmat ovat kantajia, kullakin lapsella on yksi neljästä mahdollisuudesta periä kaksi muuttunutta kopiota.
PALB2-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
- Variantit, joilla on sivu
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 4 kb geenin 38,1 kb:stä; 3 561 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä PALB2
1 092
PALB2-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 38,1 kb geenistä PALB2, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 4 kb eksoneja.
Variantit, joilla on sivu (552)
Tässä ovat PALB2-variantit, joilla on sivu, eniten arvostelutähtiä saaneet ensin. Jokainen sivu kuvaa ClinVarin julkista tietuetta variantista, ei koskaan tulosta.
| Variantti | HGVS c. | Eksoni tai introni | Sijainti (GRCh38) | ClinVar-luokitus | Arvioinnin tila |
|---|---|---|---|---|---|
| A842Sfs*7 | c.2524_2535delinsTCAGA | Eksoni 6 | 23 629 255 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| c.108+1_108+2insC | Introni 2 | 23 638 068 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima | |
| c.2559C>T | Eksoni 6 | 23 629 231 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima | |
| c.3350+4A>G | Introni 12 | 23 607 860 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima | |
| c.3549C>A | Eksoni 13 | 23 603 471 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima | |
| E3X | c.7G>T | Eksoni 1 | 23 641 151 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| E178Nfs*15 | c.532del | Eksoni 4 | 23 636 013 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| G1121Vfs*3 | c.3362del | Eksoni 13 | 23 603 657 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| L531Cfs*30 | c.1592del | Eksoni 4 | 23 634 953 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| N280Tfs*8 | c.839del | Eksoni 4 | 23 635 706 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- BRIP1BRCA1 interacting DNA helicase 1Yhteisiä sairauksia: 3
- BRCA1BRCA1 DNA repair associatedYhteisiä sairauksia: 2
- BRCA2BRCA2 DNA repair associatedYhteisiä sairauksia: 2
- ERCC4ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunitYhteisiä sairauksia: 2
- FANCAFA complementation group AYhteisiä sairauksia: 2
- FANCBFA complementation group BYhteisiä sairauksia: 2
- FANCCFA complementation group CYhteisiä sairauksia: 2
- FANCD2FA complementation group D2Yhteisiä sairauksia: 2
- FANCEFA complementation group EYhteisiä sairauksia: 2
- FANCFFA complementation group FYhteisiä sairauksia: 2
- FANCGFA complementation group GYhteisiä sairauksia: 2
- FANCIFA complementation group IYhteisiä sairauksia: 2
Geeniin PALB2 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita PALB2 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the genitourinary system
- Abnormal kidney location
- Abnormal fallopian tube morphology
- Ovarian cancer
- Abnormally shaped kidney
- Nephroblastoma
- Urinary tract abnormalities
- Abnormal localisation of kidneys
- Abnormal preputium morphology
Näytä 17 piirrettä lisää
- Abnormality of the testis
- Abnormality of the uterus
- Absent kidney on one side
- Absent sperm in semen
- Absent testes
- Absent/small kidney
- Decreased fertility in males
- Frequent urinary tract infections
- Heart shaped uterus
- Horseshoe kidney
- Hydroureter
- Hypospadias
- Ovarian carcinoma
- Pelvic kidney
- Prostate cancer
- Renal failure
- Undescended testes
Abnormality of the digestive system
- Pancreatic adenocarcinoma
- Abdominal pain
- Anorexia
- Inability to properly digest food due to lack of pancreatic digestive enzymes
- Poor appetite
- Primary peritoneal carcinoma
- Extrahepatic cholestasis
- Functional intestinal obstruction
Näytä 15 piirrettä lisää
- Intestinal pseudo-obstruction
- Jaundice
- Abnormal connection between trachea and esophagus
- Abnormality of the liver
- Absent anus
- Cancer of the pancreas
- Colon cancer
- Duodenal stenosis
- Enlarged colon lacking nerve cells
- Intermittent diarrhea
- Liver cancer
- Meckel diverticulum
- Nausea and vomiting
- Peritoneal abscess
- Umbilical hernia
Abnormality of the eye
- Wide-set eyes
- Abnormally small eyeball
- Abnormality of the eye
- Abnormality of vision
- Absent/small iris
- Astigmatism
- Bulging eye
- Clouding of the lens of the eye
Näytä 4 piirrettä lisää
Abnormality of the nervous system
- Global developmental delay
- Intellectual disability
- Medulloblastoma
- Abnormal shape of nervous system
- Cancer of early nerve cells
- Cranial nerve paralysis
- Increased reflexes
- Split spine
Näytä 2 piirrettä lisää
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). PALB2-geeni: partner and localizer of BRCA2. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/palb2
Dante Labs. PALB2-geeni: partner and localizer of BRCA2 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/palb2
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa