Genas
PALB2
partner and localizer of BRCA2
- HGNC 26144↗(atsidaro naujame skirtuke)
- Ensembl genas ENSG00000083093↗(atsidaro naujame skirtuke)
- NCBI Gene 79728↗(atsidaro naujame skirtuke)
Santrauka
- Citogenetinė vieta
- 16p12.2
- Koordinatės
- Chromosoma 16: 23 603 165–23 641 310 (GRCh38)
- Eksonai
- 13 eksonų per 38,1 kb
- Baltymas
- 1 186 aminorūgščių
- Paveldėjimas
- Autosominis dominantinis Autosominis recesyvinis
- Taip pat žinomas kaip
- FLJ21816, FANCN
- MANE Select transkriptas
- ENST00000261584.9NM_024675.4
- Lokuso tipas
- gene with protein product
- Labai aukštas
- Patikimas
- Žemas
- Labai žemas
Atskaitos genomasGRCh38hg38
Pozicijos genų ir variantų puslapiuose rodomos pagal šį pasirinkimą šioje naršyklėje.
Perskaitykite PALB2 ir likusį savo genomą su vienu tyrimu.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites
Įsigyti savo Genome TestKuruotos ataskaitos, susijusios su šiuo genu
DNA taisymo sutrikimo liga
- Autosominis recesyvinis
Liga, kurios pagrindas – DNR taisymo mechanizmo sutrikimas.
- ClinGen šį ryšį įvertina kaip apibrėžtas
- 4 GenCC vertintojų įvertina jį kaip apibrėžtą arba stiprų
Fankonio anemija
- Autosominis recesyvinis
Fankonio anemija (FA) yra paveldimas DNR taisymo sutrikimas, kuriam būdinga progresuojanti pancitopenija dėl kaulų smegenų nepakankamumo, įvairios įgimtos malformacijos ir polinkis susirgti hematologiniais ar kietaisiais navikais.
- ClinGen šį ryšį įvertina kaip apibrėžtas
- 4 GenCC vertintojų įvertina jį kaip apibrėžtą arba stiprų
Ką duoda žinojimas
Hemopoetinių kamieninių ląstelių transplantacija taikant FA specifinį sumažinto intensyvumo kondicionavimą; androgenai (oksimetolonas) kaip tiltinė terapija; vėžio priežiūra galvos ir kaklo bei ginekologinių piktybinių navikų atveju; genų terapija klinikiniuose tyrimuose
Krūties ir kiaušidžių vėžio genai, išskyrus BRCA1/2
- Paveldimas krūties vėžysAutosominis dominantinis
Paveldimas polinkis į krūties vėžį, kurį sukelia vieno iš kelių genų variantai.
- 1 GenCC vertintojas įvertina jį kaip apibrėžtą arba stiprų
- Įtrauktas į ACMG antrinių rezultatų sąrašą
Ką duoda žinojimas
Priklausomai nuo geno, gali būti rekomenduojama anksčiau ir intensyviau tirti krūtis, įskaitant MRT.
Su PALB2 genu susijusios ligos
- Fanconi anemijos komplementacijos grupė NAutosominis recesyvinis
Bet kuri Fanconi anemija, kurios priežastis – mutacija PALB2 gene.
- ClinGen šį ryšį įvertina kaip apibrėžtas
- 4 GenCC vertintojų įvertina jį kaip apibrėžtą arba stiprų
- Kasos vėžio polinkis, 3 tipasAutosominis dominantinis
Bet koks šeiminis kasos karcinomos atvejis, kurio priežastis – mutacija PALB2 gene.
- 2 GenCC vertintojų įvertina jį kaip apibrėžtą arba stiprų
- Su PALB2 susijęs polinkis į vėžįAutosominis dominantinis
PALB2 variantai, didinantys krūties vėžio riziką, o mažesniu mastu – kasos ir kiaušidžių vėžio riziką.
- ClinGen šį ryšį įvertina kaip apibrėžtas
- 3 GenCC vertintojų įvertina jį kaip apibrėžtą arba stiprų
Ką duoda žinojimas
Sustiprinta krūties tyrimų programa, įskaitant MRT, o profilaktinės operacijos aptariamos individualiai.
Paveldėjimas
- Autosominis dominantinis
- Pakanka vieno pakitusio egzemplioriaus iš bet kurio iš tėvų. Tėvas ar motina, turintys tokį pakitimą, perduoda jį kiekvienam vaikui su vienos iš dviejų tikimybe.
- Autosominis recesyvinis
- Reikia pakitusio egzemplioriaus iš kiekvieno iš tėvų. Turint vieną, esate nešiotojas ir paprastai neturite požymių; kai abu tėvai yra nešiotojai, kiekvienas vaikas su vienos iš keturių tikimybe paveldės du.
Kaip išdėstytas PALB2
- Koduojanti seka
- Netransliuojama sritis
- Intronas
- Transkripcijos kryptis
- Žinomos su liga susijusios vietos
- Ruožai, kuriuos trumpi skaitiniai sunkiai aptinka
- Variantai su puslapiu
Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.
Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).
Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.
Eksonai sudaro 4 kb iš 38,1 kb geno; 3 561 šių bazių koduoja baltymą.
Kaip genomo tyrimas nuskaito PALB2
1 092
PALB2 geno pozicijų, kuriose ClinVar pakitimą klasifikuoja kaip patogeninį arba tikriausiai patogeninį
Nė viena iš jų nepatenka į sritį, kurią trumpi skaitiniai sunkiai aptinka.
Viso genomo sekvenavimas apima visus 38,1 kb PALB2 geno, įskaitant intronus, o ne tik 4 kb eksonų.
Variantų su puslapiais (552)
Čia pateikiami PALB2 variantai su puslapiais, pirma – su daugiausia apžvalgos žvaigždučių. Kiekviename puslapyje aprašomas viešas ClinVar įrašas apie variantą, niekada ne rezultatas.
| Variantas | HGVS c. | Eksonas ar intronas | Pozicija (GRCh38) | ClinVar klasifikacija | Apžvalgos būsena |
|---|---|---|---|---|---|
| A842Sfs*7 | c.2524_2535delinsTCAGA | Eksonas 6 | 23 629 255 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| c.108+1_108+2insC | Intronas 2 | 23 638 068 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė | |
| c.2559C>T | Eksonas 6 | 23 629 231 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė | |
| c.3350+4A>G | Intronas 12 | 23 607 860 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė | |
| c.3549C>A | Eksonas 13 | 23 603 471 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė | |
| E3X | c.7G>T | Eksonas 1 | 23 641 151 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| E178Nfs*15 | c.532del | Eksonas 4 | 23 636 013 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| G1121Vfs*3 | c.3362del | Eksonas 13 | 23 603 657 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| L531Cfs*30 | c.1592del | Eksonas 4 | 23 634 953 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| N280Tfs*8 | c.839del | Eksonas 4 | 23 635 706 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
Genai, susieti su tomis pačiomis būklėmis
- BRIP1BRCA1 interacting DNA helicase 1Turi 3 bendrų būklių
- BRCA1BRCA1 DNA repair associatedTuri 2 bendrų būklių
- BRCA2BRCA2 DNA repair associatedTuri 2 bendrų būklių
- ERCC4ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunitTuri 2 bendrų būklių
- FANCAFA complementation group ATuri 2 bendrų būklių
- FANCBFA complementation group BTuri 2 bendrų būklių
- FANCCFA complementation group CTuri 2 bendrų būklių
- FANCD2FA complementation group D2Turi 2 bendrų būklių
- FANCEFA complementation group ETuri 2 bendrų būklių
- FANCFFA complementation group FTuri 2 bendrų būklių
- FANCGFA complementation group GTuri 2 bendrų būklių
- FANCIFA complementation group ITuri 2 bendrų būklių
Savybės, susijusios su PALB2
Žmogaus fenotipų ontologija šias savybes nurodo kaip retų ligų, kurias gali sukelti PALB2, požymius. Kiekvienos savybės puslapyje nurodyti kiti su ja susiję genai.
Abnormality of the genitourinary system
- Abnormal kidney location
- Abnormal fallopian tube morphology
- Ovarian cancer
- Abnormally shaped kidney
- Nephroblastoma
- Urinary tract abnormalities
- Abnormal localisation of kidneys
- Abnormal preputium morphology
Rodyti dar 17 savybių
- Abnormality of the testis
- Abnormality of the uterus
- Absent kidney on one side
- Absent sperm in semen
- Absent testes
- Absent/small kidney
- Decreased fertility in males
- Frequent urinary tract infections
- Heart shaped uterus
- Horseshoe kidney
- Hydroureter
- Hypospadias
- Ovarian carcinoma
- Pelvic kidney
- Prostate cancer
- Renal failure
- Undescended testes
Abnormality of the digestive system
- Pancreatic adenocarcinoma
- Abdominal pain
- Anorexia
- Inability to properly digest food due to lack of pancreatic digestive enzymes
- Poor appetite
- Primary peritoneal carcinoma
- Extrahepatic cholestasis
- Functional intestinal obstruction
Rodyti dar 15 savybių
- Intestinal pseudo-obstruction
- Jaundice
- Abnormal connection between trachea and esophagus
- Abnormality of the liver
- Absent anus
- Cancer of the pancreas
- Colon cancer
- Duodenal stenosis
- Enlarged colon lacking nerve cells
- Intermittent diarrhea
- Liver cancer
- Meckel diverticulum
- Nausea and vomiting
- Peritoneal abscess
- Umbilical hernia
Abnormality of the nervous system
- Global developmental delay
- Intellectual disability
- Medulloblastoma
- Abnormal shape of nervous system
- Cancer of early nerve cells
- Cranial nerve paralysis
- Increased reflexes
- Split spine
Rodyti dar 2 savybių
Išorinės nuorodos
Geno įrašai
Transkriptas
Baltymas
Iš kur tai
- HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
- MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo eksonai ir koduojanti seka.
- GenCC ir ClinGen, išleista 2026-10-16: kokioms būklėms genas susijęs ir kaip stipriai.
- ACMG antrinių radinių sąrašas, SF v3.2.
- ClinVar ir GIAB stratifikacijos: žinomos ligas sukeliančios vietos ir sritys, kurias trumpieji skaitiniai sunkiai nustato.
- Žmogaus fenotipų ontologija, versija 2026-09-01: su genu susijusios savybės. Daugiau informacijos rasite hpo.jax.org.
- Duomenų išleidimas 2026.10.16-c6eea6bf.
Cituoti šį puslapį
Dante Labs. (be datos). PALB2 genas: partner and localizer of BRCA2. Pasiekta 2026 m. spalio 17 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/palb2
Dante Labs. PALB2 genas: partner and localizer of BRCA2 [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 17 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/palb2
Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites