Gén
PALB2
partner and localizer of BRCA2
- HGNC 26144↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000083093↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 79728↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 16p12.2
- Koordináták
- 16. kromoszóma: 23 603 165–23 641 310 (GRCh38)
- Exonok
- 13 exon, összesen 38,1 kb
- Fehérje
- 1186 aminosav
- Öröklődés
- Autoszomális domináns Autoszomális recesszív
- Más néven ismert
- FLJ21816, FANCN
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000261584.9NM_024675.4
- Lokusz típusa
- gene with protein product
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Referencia genomGRCh38hg38
A gén- és variánsoldalakon a pozíciók ennek a választásnak megfelelően jelennek meg, ebben a böngészőben.
Olvassa el a PALB2-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések
DNA Repair Disease
- Autoszomális recesszív
A disease that has its basis in the disruption of DNA repair.
- A ClinGen szerint a kapcsolat besorolása: definitív
- 4 GenCC-beküldő definitívnek vagy erősnek minősíti
Fanconi Anemia
- Autoszomális recesszív
Fanconi anemia (FA) is a hereditary DNA repair disorder characterized by progressive pancytopenia with bone marrow failure, variable congenital malformations and predisposition to develop hematological or solid tumors.
- A ClinGen szerint a kapcsolat besorolása: definitív
- 4 GenCC-beküldő definitívnek vagy erősnek minősíti
Mit változtat az ismeret
Hematopoietic stem cell transplantation using FA-specific reduced-intensity conditioning; androgens (oxymetholone) as bridge therapy; cancer surveillance for head/neck and gynecological malignancies; gene therapy in clinical trials
Breast and Ovarian Cancer Genes Beyond BRCA1/2
- Hereditary breast cancerAutoszomális domináns
Inherited susceptibility to breast cancer caused by variants in one of several genes.
- 1 GenCC-beküldő definitívnek vagy erősnek minősíti
- Szerepel az ACMG másodlagos leletek listáján
Mit változtat az ismeret
Earlier and more intensive breast screening, including MRI, may be recommended depending on the gene.
PALB2 related diseases
- Fanconi Anemia Complementation Group NAutoszomális recesszív
Any Fanconi anemia in which the cause of the disease is a mutation in the PALB2 gene.
- A ClinGen szerint a kapcsolat besorolása: definitív
- 4 GenCC-beküldő definitívnek vagy erősnek minősíti
- Pancreatic Cancer, Susceptibility To, 3Autoszomális domináns
Any familial pancreatic carcinoma in which the cause of the disease is a mutation in the PALB2 gene.
- 2 GenCC-beküldő definitívnek vagy erősnek minősíti
- PALB2-related cancer predispositionAutoszomális domináns
PALB2 variants that raise the risk of breast cancer and, to a lesser degree, pancreatic and ovarian cancer.
- A ClinGen szerint a kapcsolat besorolása: definitív
- 3 GenCC-beküldő definitívnek vagy erősnek minősíti
Mit változtat az ismeret
Enhanced breast screening including MRI, with risk-reducing surgery discussed case by case.
Öröklődési mód
- Autoszomális domináns
- Egy megváltozott másolat bármelyik szülőtől is származik, elegendő. Az a szülő, akinek van ilyen másolata, minden gyermekének 50%-os eséllyel adja tovább.
- Autoszomális recesszív
- Mindkét szülőtől egy-egy megváltozott másolat szükséges. Egy megváltozott másolattal hordozó lesz, és általában nem érintett; ha mindkét szülő hordozó, minden gyermeknek 25%-os eséllyel öröklődik mindkét másolat.
A PALB2 felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Ismert betegségokozó helyek
- Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
- Oldallal rendelkező variánsok
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 38,1 kb-jából 4 kb-ot tesznek ki; ezek közül 3561 bázis kódolja a fehérjét.
Hogyan olvassa a genomteszt a(z) PALB2 gént
1092
pozíció a(z) PALB2 génben, ahol a ClinVar a változást kórokozónak vagy valószínűleg kórokozónak minősíti
Ezek közül egyik sem esik olyan régióba, amelyet a rövid olvasatok nehezen értelmeznek.
A teljes genom a PALB2 gén mind a 38,1 kb-ját lefedi, az intronokat is beleértve, nem csak az 4 kb exonját.
Oldallal rendelkező variánsok (552)
Az itt található, oldallal rendelkező PALB2 variánsok, a legtöbb csillaggal rendelkezők először. Minden oldal a variáns ClinVar nyilvános adatbázisbeli bejegyzését írja le, sosem egy eredményt.
| Variáns | HGVS c. | Exon vagy intron | Pozíció (GRCh38) | ClinVar-besorolás | Felülvizsgálati állapot |
|---|---|---|---|---|---|
| A842Sfs*7 | c.2524_2535delinsTCAGA | 6. exon | 23 629 255 | Patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| c.108+1_108+2insC | 2. intron | 23 638 068 | Valószínűleg patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte | |
| c.2559C>T | 6. exon | 23 629 231 | Valószínűleg patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte | |
| c.3350+4A>G | 12. intron | 23 607 860 | Valószínűleg patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte | |
| c.3549C>A | 13. exon | 23 603 471 | Patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte | |
| E3X | c.7G>T | 1. exon | 23 641 151 | Patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| E178Nfs*15 | c.532del | 4. exon | 23 636 013 | Patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| G1121Vfs*3 | c.3362del | 13. exon | 23 603 657 | Valószínűleg patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| L531Cfs*30 | c.1592del | 4. exon | 23 634 953 | Patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| N280Tfs*8 | c.839del | 4. exon | 23 635 706 | Patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
Ugyanazokhoz a betegségekhez kapcsolódó gének
- BRIP1BRCA1 interacting DNA helicase 13 betegséget oszt meg
- BRCA1BRCA1 DNA repair associated2 betegséget oszt meg
- BRCA2BRCA2 DNA repair associated2 betegséget oszt meg
- ERCC4ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunit2 betegséget oszt meg
- FANCAFA complementation group A2 betegséget oszt meg
- FANCBFA complementation group B2 betegséget oszt meg
- FANCCFA complementation group C2 betegséget oszt meg
- FANCD2FA complementation group D22 betegséget oszt meg
- FANCEFA complementation group E2 betegséget oszt meg
- FANCFFA complementation group F2 betegséget oszt meg
- FANCGFA complementation group G2 betegséget oszt meg
- FANCIFA complementation group I2 betegséget oszt meg
A(z) PALB2 génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) PALB2 gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Abnormality of the genitourinary system
- Abnormal kidney location
- Abnormal fallopian tube morphology
- Ovarian cancer
- Abnormally shaped kidney
- Nephroblastoma
- Urinary tract abnormalities
- Abnormal localisation of kidneys
- Abnormal preputium morphology
Még 17 tulajdonság megjelenítése
- Abnormality of the testis
- Abnormality of the uterus
- Absent kidney on one side
- Absent sperm in semen
- Absent testes
- Absent/small kidney
- Decreased fertility in males
- Frequent urinary tract infections
- Heart shaped uterus
- Horseshoe kidney
- Hydroureter
- Hypospadias
- Ovarian carcinoma
- Pelvic kidney
- Prostate cancer
- Renal failure
- Undescended testes
Abnormality of the digestive system
- Pancreatic adenocarcinoma
- Abdominal pain
- Anorexia
- Inability to properly digest food due to lack of pancreatic digestive enzymes
- Poor appetite
- Primary peritoneal carcinoma
- Extrahepatic cholestasis
- Functional intestinal obstruction
Még 15 tulajdonság megjelenítése
- Intestinal pseudo-obstruction
- Jaundice
- Abnormal connection between trachea and esophagus
- Abnormality of the liver
- Absent anus
- Cancer of the pancreas
- Colon cancer
- Duodenal stenosis
- Enlarged colon lacking nerve cells
- Intermittent diarrhea
- Liver cancer
- Meckel diverticulum
- Nausea and vomiting
- Peritoneal abscess
- Umbilical hernia
Abnormality of the cardiovascular system
- Abnormal cardiac septum morphology
- Swollen lymph nodes
- Abnormal aortic morphology
- Abnormal aortic valve morphology
- Abnormal carotid artery morphology
- An opening in the wall separating the top two chambers of the heart
- Arteriovenous malformation
- Enlarged and thickened heart muscle
Még 4 tulajdonság megjelenítése
Abnormality of the eye
- Wide-set eyes
- Abnormally small eyeball
- Abnormality of the eye
- Abnormality of vision
- Absent/small iris
- Astigmatism
- Bulging eye
- Clouding of the lens of the eye
Még 4 tulajdonság megjelenítése
Abnormality of the nervous system
- Global developmental delay
- Intellectual disability
- Medulloblastoma
- Abnormal shape of nervous system
- Cancer of early nerve cells
- Cranial nerve paralysis
- Increased reflexes
- Split spine
Még 2 tulajdonság megjelenítése
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Honnan származnak az adatok
- HGNC: a gén szimbóluma, neve, egyéb szimbólumai és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI-tól és az EMBL-EBI-tól: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-16 kiadás: mely betegségekkel kapcsolódik a gén, és milyen erősen.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- ClinVar és a GIAB-rétegződések: ismert, betegséget okozó helyek, valamint azok a régiók, amelyeket a rövid leolvasások nehezen térképeznek fel.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.16-c6eea6bf.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). PALB2 gén: partner and localizer of BRCA2. Lekérve: 2026. október 17., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/palb2
Dante Labs. PALB2 gén: partner and localizer of BRCA2 [Internet]. [idézve: 2026. október 17.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/palb2
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt