Gen
COL7A1
collagen type VII alpha 1 chain
- HGNC 2214↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000114270↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 1294↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 3p21.31
- Souřadnice
- Chromozom 3: 48 564 073–48 595 329 (GRCh38)
- Exony
- 119 exonů na 31,3 kb
- Protein
- 2 944 aminokyselin
- Předchozí symboly
- EBDCT, EBD1, EBR1
- Transkript MANE Select
- ENST00000681320.1NM_000094.4
- Typ lokusu
- gene with protein product
Referenční genomGRCh38hg38
Pozice na stránkách genů a variant se řídí touto volbou v tomto prohlížeči.
Přečtěte si COL7A1 i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorovaný report související s tímto genem
Epidermolysis Bullosa
- Inherited epidermolysis bullosa
All inherited forms of skin fragility with blistering, including simplex, junctional and dystrophic epidermolysis bullosa and Kindler syndrome.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 6 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Co přináší znalost
Recessive dystrophic forms need regular skin cancer surveillance, and gene-based wound therapy is now available for dystrophic EB.
Jak je COL7A1 uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 9,2 kb z 31,3 kb genu; 8 835 těchto bází kódují protein.
Jak genetický test čte COL7A1
720
pozic v genu COL7A1, které ClinVar řadí mezi patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Žádné z nich neleží v oblasti, kterou krátká čtení obtížně zachycují.
Celý genom pokrývá všech 31,3 kb genu COL7A1, včetně intronů, nikoli jen 9,2 kb exonů.
Geny spojené se stejnými onemocněními
- CD151CD151 molecule (Raph blood group)Sdílí 1 onemocnění
- COL17A1collagen type XVII alpha 1 chainSdílí 1 onemocnění
- DSPdesmoplakinSdílí 1 onemocnění
- DSTdystoninSdílí 1 onemocnění
- EXPH5exophilin 5Sdílí 1 onemocnění
- FERMT1FERM domain containing kindlin 1Sdílí 1 onemocnění
- ITGA3integrin subunit alpha 3Sdílí 1 onemocnění
- ITGA6integrin subunit alpha 6Sdílí 1 onemocnění
- ITGB4integrin subunit beta 4Sdílí 1 onemocnění
- JUPjunction plakoglobinSdílí 1 onemocnění
- KLHL24kelch like family member 24Sdílí 1 onemocnění
- KRT14keratin 14Sdílí 1 onemocnění
Rysy spojené s COL7A1
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit COL7A1. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Abnormality of the integument
- Abnormal blistering of the skin
- Itching
- Poor nail formation
- Sub-lamina densa cleavage
- Sunken or indented skin due to damage
- Atypical scarring of skin
- Brittle nails
- Fragile skin
Zobrazit ještě 47 rysů
- Generalized abnormality of skin
- Localized skin lesion
- Milk spot
- Pretibial blistering
- Thick nail
- Abnormal fingernails
- Abnormal subungual morphology
- Abnormality of the toenail
- Absent nails
- Acral blistering
- Chronic cutaneous wound
- Erythematous plaque
- Genital blistering
- Irregular hyperpigmentation
- Keloids
- Lichenification
- Overgrowth and curving of fingernail
- Overgrowth and curving of toenails
- Photosensitive skin
- Poikiloderma
- Poor fingernail formation
- Poor toenail formation
- Skin degeneration
- Skin erosion
- Skin plaque
- Squamous cell carcinoma
- Thin skin
- Absence of part of skin at birth
- Absent fingernail
- Absent toenail
- Atypical nail growth
- Cutaneous melanoma
- Erythematous papule
- Firm lump under the skin
- Hyperkeratosis
- Hyperkeratotic papule
- Lamina lucida cleavage
- Mole
- Papule
- Recurrent loss of toenails and fingernails
- Skin vesicle
- Small nail
- Abnormal skin pigmentation
- Abnormal skin structure
- Basal cell carcinoma
- Congenital localized absence of skin
- Hair loss
Abnormality of limbs
- Mitten deformity
- Abnormality of the elbow
- Abnormality of the lower limb
- Abnormality of the wrist
- Palmoplantar blistering
- Thickening of the outer layer of the skin of the palms and soles
- Abnormality of the forearm
- Abnormality of the knee
Zobrazit ještě 2 rysů
Abnormality of head or neck
- Oral mucosal blisters
- Dental cavities
- Abnormality of the scalp
- Erosion of oral mucosa
- Abnormality of head or neck
- Narrow mouth
- Tongue tied
- Pink eye
Zobrazit ještě 1 rys
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud údaje pocházejí
- HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-16: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
- Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen COL7A1: collagen type VII alpha 1 chain. Staženo 16. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/col7a1
Dante Labs. Gen COL7A1: collagen type VII alpha 1 chain [Internet]. [citováno 16. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/col7a1
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů