Genă
SOS1
SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1
- HGNC 11187↗(se deschide într-un tab nou)
- Genă Ensembl ENSG00000115904↗(se deschide într-un tab nou)
- NCBI Gene 6654↗(se deschide într-un tab nou)
Rezumat
- Localizare citogenetică
- 2p22.1
- Coordonate
- Cromozomul 2: 38.981.549–39.121.051 (GRCh38)
- Exoni
- 23 de exoni pe 139,5 kb
- Proteină
- 1.333 de aminoacizi
- Denumiri alternative
- HGF, GF1
- Simboluri anterioare
- GINGF
- Transcriptul MANE Select
- ENST00000402219.8NM_005633.4
- Tip de locus
- Protein-coding
- Foarte ridicată
- Ridicată
- Scăzută
- Foarte scăzută
This page as data
Add .json to the page's address, or ask for application/json, to read it as JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/sos1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameCitiți SOS1 și restul genomului dumneavoastră cu un singur test.
De la 449 $Livrare gratuită · Rezultate în 6–8 săptămâni
Comandați Genome Test-ul meuRapoarte curatoriate relevante pentru această genă
Fibromatoza gingivală ereditară
- Autozomal dominantă
Supracreștere lent progresivă, non-inflamatorie, a țesutului gingival, asociată cu gene precum SOS1 și REST, care începe adesea odată cu erupția dinților permanenți.
- 1 transmițător GenCC o evaluează ca definitivă sau puternică
▶Acționabilitate
Cunoașterea acestei afecțiuni poate sprijini un diagnostic mai timpuriu și planificarea intervenției chirurgicale gingivale și a tratamentului ortodontic, precum și informarea rudelor.
Sindromul Noonan
- Autozomal dominantă
Sindromul Noonan (SN) se caracterizează prin statură scurtă, dismorfism facial tipic și malformații cardiace congenitale.
- ClinGen evaluează legătura ca definitivă
- 5 de transmițători GenCC o evaluează ca definitivă sau puternică
▶Acționabilitate
Supraveghere cardiacă, sprijin pentru dezvoltare, terapie cu hormon de creștere, consiliere genetică, studii clinice cu inhibitori MEK
- Sindromul Noonan și sindroamele asociate Noonan
Un grup de afecțiuni ale căii RAS, inclusiv sindroamele Noonan, Costello, cardiofaciocutanat și Legius, cu defecte cardiace variabile, statură scundă și trăsături faciale distinctive.
- ClinGen evaluează legătura ca definitivă
- 5 de transmițători GenCC o evaluează ca definitivă sau puternică
▶Acționabilitate
Cunoașterea acestui aspect sprijină evaluarea inimii, a creșterii și a dezvoltării.
Grupări mai largi
Cardiomiopatie hipertrofică
- Autozomal dominantă
Una dintre cele 62 gene legate de ea
Afecțiune în care miocardul este hipertrofiat fără o cauză evidentă. Hipertrofia este, în general, asimetrică și poate fi asociată cu obstrucția tractului de ejecție al ventriculului.
- ClinGen evaluează legătura ca definitivă
- 5 de transmițători GenCC o evaluează ca definitivă sau puternică
▶Acționabilitate
Beta-blocante, blocante ale canalelor de calciu non-dihidropiridinice, restricții de activitate, consiliere genetică
Structura genei SOS1
- Secvență codificatoare
- Regiune netranslată
- Intron
- Sensul transcripției
- Situri cunoscute asociate bolilor
- Regiuni pe care citirile scurte le găsesc dificile
- Variante cu pagină
Exonii transcriptului MANE Select al genei (versiunea v1.5), din NCBI și EMBL-EBI, pe genomul de referință GRCh38.
Benzile cromozomale din ideograma GRCh38 a UCSC (2022-10-29).
Genele din apropiere, din Ensembl, versiunea 116, pe GRCh38.
Exonii reprezintă 8,9 kb din cei 139,5 kb ai genei; 4.002 dintre aceste baze codifică proteina.
Secvențierea SOS1
51
poziții în SOS1 unde ClinVar clasifică o modificare drept patogenă sau probabil patogenă
Niciuna dintre ele nu se află într-o regiune pe care citirile scurte o identifică greu.
Un genom întreg acoperă toate cele 139,5 kb din SOS1, inclusiv intronii, nu doar cei 8,9 kb de exoni.
Variante cu pagină (13)
Variantele SOS1 cu pagină aici, cu cele mai multe stele de revizuire primele. Fiecare pagină descrie înregistrarea publică a ClinVar despre variantă, niciodată un rezultat.
| Variantă | HGVS c. | Exon sau intron | Poziție (GRCh38) | Clasificare ClinVar | Stare de revizuire |
|---|---|---|---|---|---|
| E108K | c.322G>A | Exon 3 | 39.058.696 | Patogenă | ★★★★3 stele din 4 revizuit de un grup de experți |
| E846K | c.2536G>A | Exon 16 | 39.007.168 | Patogenă | ★★★★3 stele din 4 revizuit de un grup de experți |
| F623I | c.1867T>A | Exon 11 | 39.014.838 | Probabil patogenă | ★★★★3 stele din 4 revizuit de un grup de experți |
| K170E | c.508A>G | Exon 4 | 39.056.704 | Patogenă | ★★★★3 stele din 4 revizuit de un grup de experți |
| M269T | c.806T>C | Exon 6 | 39.051.202 | Patogenă | ★★★★3 stele din 4 revizuit de un grup de experți |
| R552G | c.1654A>G | Exon 10 | 39.022.774 | Patogenă | ★★★★3 stele din 4 revizuit de un grup de experți |
| R552K | c.1655G>A | Exon 10 | 39.022.773 | Patogenă | ★★★★3 stele din 4 revizuit de un grup de experți |
| R552M | c.1655G>T | Exon 10 | 39.022.773 | Probabil patogenă | ★★★★3 stele din 4 revizuit de un grup de experți |
| R552S | c.1656G>T | Exon 10 | 39.022.772 | Patogenă | ★★★★3 stele din 4 revizuit de un grup de experți |
| R552T | c.1655G>C | Exon 10 | 39.022.773 | Patogenă | ★★★★3 stele din 4 revizuit de un grup de experți |
Gene asociate acelorași afecțiuni
- BRAFB-Raf proto-oncogene, serine/threonine kinaseAre 3 de afecțiuni în comun
- ERFETS2 repressor factorAre 3 de afecțiuni în comun
- KRASKRas proto-oncogene, GTPaseAre 3 de afecțiuni în comun
- LZTR1leucine zipper like post translational regulator 1Are 3 de afecțiuni în comun
- MAPK1mitogen-activated protein kinase 1Are 3 de afecțiuni în comun
- MRASmuscle RAS oncogene homologAre 3 de afecțiuni în comun
- NRASNRAS proto-oncogene, GTPaseAre 3 de afecțiuni în comun
- PPP1CBprotein phosphatase 1 catalytic subunit betaAre 3 de afecțiuni în comun
- PTPN11protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11Are 3 de afecțiuni în comun
- RAF1Raf-1 proto-oncogene, serine/threonine kinaseAre 3 de afecțiuni în comun
- RIT1Ras like without CAAX 1Are 3 de afecțiuni în comun
- RRAS2RAS related 2Are 3 de afecțiuni în comun
Trăsături asociate cu SOS1
Human Phenotype Ontology le enumeră drept caracteristici ale afecțiunilor rare pe care le poate provoca SOS1. Pagina fiecărei trăsături enumeră celelalte gene asociate cu aceasta.
Abnormality of the musculoskeletal system
- Abnormality of the sternum
- Delayed bone maturation
- Funnel chest
- Scoliosis
- Double-Jointed
- Muscle weakness
- Pigeon chest
- Wide rib cage
Afișați încă 3 de trăsături
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Prolonged partial thromboplastin time
- Reduced factor VIII activity
- Reduced factor XI activity
- Abnormal platelet function
- Abnormality of coagulation
- Bleeding tendency
- Bruising susceptibility
- Juvenile myelomonocytic leukemia
Afișați încă 1 trăsătură
Legături externe
Înregistrări ale genei
Transcript
Proteină
De unde provin acestea
- HGNC: simbolul genei, numele, alte simboluri și localizarea.
- MANE Select v1.5, de la NCBI și EMBL-EBI: transcriptul, exonii și secvența codificatoare.
- GenCC și ClinGen, publicate în 2026-10-17: de care afecțiuni este legată gena și cât de puternică este legătura.
- Lista ACMG de descoperiri secundare, SF v3.2.
- ClinVar și stratificările GIAB: locurile cunoscute asociate bolilor și regiunile pe care citirile scurte le consideră dificile.
- Human Phenotype Ontology, versiunea 2026-09-01: trăsăturile asociate genei. Aflați mai multe la hpo.jax.org.
- Versiunea datelor 2026.10.17-8666dff2.
Citează această pagină
Dante Labs. (s.a.). Gena SOS1: SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1. Accesat 17 octombrie 2026, de la https://dantelabs.com/ro/genes/sos1
Dante Labs. Gena SOS1: SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1 [Internet]. [citat 17 octombrie 2026]. Disponibil la: https://dantelabs.com/ro/genes/sos1
Un test. Răspunsuri pentru o viață.
De la 449 $Livrare gratuită · Rezultate în 6–8 săptămâni