Gen
SOS1
SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1
- HGNC 11187↗(åbnes i en ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000115904↗(åbnes i en ny fane)
- NCBI Gene 6654↗(åbnes i en ny fane)
Oversigt
- Cytogenetisk placering
- 2p22.1
- Koordinater
- Kromosom 2: 38.981.549–39.121.051 (GRCh38)
- Exoner
- 23 exoner fordelt over 139,5 kb
- Protein
- 1.333 aminosyrer
- Arvelighed
- Autosomal dominant
- Også kendt som
- HGF, GF1
- Tidligere symboler
- GINGF
- MANE Select-transkript
- ENST00000402219.8NM_005633.4
- Lokustype
- gene with protein product
- Meget høj
- Sikker
- Lav
- Meget lav
ReferencegenomGRCh38hg38
Positioner på gen- og variantsider følger dette valg i denne browser.
Læs SOS1 og resten af dit genom med én test.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger
Bestil min Genome TestKurerede rapporter relevant for dette gen
Arvelig gingivafibromatose
- Autosomal dominant
Langsomt progressiv, ikke-inflammatorisk overvækst af tandkødsvævet, forbundet med gener som SOS1 og REST, og som ofte begynder, når de permanente tænder bryder frem.
- 1 GenCC-indsender vurderer den som definitiv eller stærk
Hvad viden ændrer
Viden kan understøtte en tidligere diagnose og planlægning af tandkirurgi og tandregulering samt informere dine slægtninge.
Noonan syndrom
- Autosomal dominant
Noonan syndrom (NS) kendetegnes ved kort statur, typiske ansigtstræk og medfødte hjertefejl.
- ClinGen vurderer forbindelsen som definitivt
- 5 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
Hvad viden ændrer
Kardiologisk overvågning, udviklingsstøtte, væksthormonbehandling, genetisk rådgivning, forsøg med MEK-hæmmere
- Noonan-syndrom og Noonan-lignende syndromer
En gruppe sygdomme i RAS-signalvejen, herunder Noonan-, Costello-, cardiofaciocutane og Legius-syndrom, med varierende hjertedefekter, lav vækst og karakteristiske ansigtstræk.
- ClinGen vurderer forbindelsen som definitivt
- 5 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
Hvad viden ændrer
Viden om den understøtter vurdering af hjerte, vækst og udvikling.
Bredere grupperinger
Hypertrofisk kardiomyopati
- Autosomal dominant
Et af 62 gener, der er knyttet til det
En tilstand, hvor myokardiet er hypertrofieret uden en tydelig årsag. Hypertrofien er generelt asymmetrisk og kan være forbundet med obstruktion af ventrikulær udflydningsbane.
- ClinGen vurderer forbindelsen som definitivt
- 5 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
Hvad viden ændrer
Betablokkere, ikke-dihydropyridin calciumkanalblokkere, begrænsning af fysisk aktivitet, genetisk rådgivning
Arvegang
- Autosomal dominant
- Én ændret kopi, fra enten far eller mor, er nok. En forælder med én ændret kopi overfører den til hvert barn med en chance på en ud af to.
Sådan er SOS1 opbygget
- Kodende sekvens
- Utranslateret region
- Intron
- Transkriptionsretning
- Kendte sygdomsfremkaldende steder
- Regioner, som korte læsninger har svært ved
- Varianter med en side
Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.
Eksoner udgør 8,9 kb af genets 139,5 kb; 4.002 af disse baser koder for proteinet.
Sådan læser en genomtest SOS1
51
positioner i SOS1, hvor ClinVar klassificerer en ændring som patogen eller sandsynligvis patogen
Ingen af dem ligger i en region, som korte læsninger har svært ved.
En helgenomsanalyse dækker alle 139,5 kb af SOS1, inklusive introner, og ikke kun de 8,9 kb eksoner.
Varianter med en side (13)
Her vises de SOS1-varianter med en side, med de flest anmeldelsesstjerner først. Hver side beskriver ClinVars offentlige registrering af varianten, aldrig et resultat.
| Variant | HGVS c. | Exon eller intron | Position (GRCh38) | ClinVar-klassifikation | Gennemgangsstatus |
|---|---|---|---|---|---|
| E108K | c.322G>A | Exon 3 | 39.058.696 | Patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel |
| E846K | c.2536G>A | Exon 16 | 39.007.168 | Patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel |
| F623I | c.1867T>A | Exon 11 | 39.014.838 | Sandsynligvis patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel |
| K170E | c.508A>G | Exon 4 | 39.056.704 | Patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel |
| M269T | c.806T>C | Exon 6 | 39.051.202 | Patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel |
| R552G | c.1654A>G | Exon 10 | 39.022.774 | Patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel |
| R552K | c.1655G>A | Exon 10 | 39.022.773 | Patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel |
| R552M | c.1655G>T | Exon 10 | 39.022.773 | Sandsynligvis patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel |
| R552S | c.1656G>T | Exon 10 | 39.022.772 | Patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel |
| R552T | c.1655G>C | Exon 10 | 39.022.773 | Patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel |
Gener knyttet til de samme sygdomme
- BRAFB-Raf proto-oncogene, serine/threonine kinaseDeler 3 sygdomme
- ERFETS2 repressor factorDeler 3 sygdomme
- KRASKRas proto-oncogene, GTPaseDeler 3 sygdomme
- LZTR1leucine zipper like post translational regulator 1Deler 3 sygdomme
- MAPK1mitogen-activated protein kinase 1Deler 3 sygdomme
- MRASmuscle RAS oncogene homologDeler 3 sygdomme
- NRASNRAS proto-oncogene, GTPaseDeler 3 sygdomme
- PPP1CBprotein phosphatase 1 catalytic subunit betaDeler 3 sygdomme
- PTPN11protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11Deler 3 sygdomme
- RAF1Raf-1 proto-oncogene, serine/threonine kinaseDeler 3 sygdomme
- RIT1Ras like without CAAX 1Deler 3 sygdomme
- RRAS2RAS related 2Deler 3 sygdomme
Træk knyttet til SOS1
Human Phenotype Ontology angiver disse som kendetegn ved de sjældne tilstande, SOS1 kan forårsage. Hvert træks side viser de andre gener, der er knyttet til det.
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Prolonged partial thromboplastin time
- Reduced factor VIII activity
- Reduced factor XI activity
- Abnormal platelet function
- Abnormality of coagulation
- Bleeding tendency
- Bruising susceptibility
- Juvenile myelomonocytic leukemia
Vis 1 træk mere
Eksterne links
Genposter
Transkript
Protein
Hvor oplysningerne kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
- GenCC og ClinGen, udgivet 2026-10-16: hvilke sygdomme genet er knyttet til, og hvor stærkt.
- ACMG-listen over sekundære fund, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifikationerne: kendte sygdomsfremkaldende positioner og de regioner, som korte læsninger har svært ved at aflæse.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: de træk, der er knyttet til genet. Læs mere på hpo.jax.org.
- Dataudgivelse 2026.10.16-c6eea6bf.
Citér denne side
Dante Labs. (u.d.). SOS1-genet: SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1. Hentet 16. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/sos1
Dante Labs. SOS1-genet: SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1 [Internet]. [citeret 16. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/sos1
Én test. Svar for hele livet.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger