Genă
COL18A1
collagen type XVIII alpha 1 chain
- HGNC 2195↗(se deschide într-un tab nou)
- Genă Ensembl ENSG00000182871↗(se deschide într-un tab nou)
- NCBI Gene 80781↗(se deschide într-un tab nou)
Rezumat
- Localizare citogenetică
- 21q22.3
- Coordonate
- Cromozomul 21: 45.405.165–45.513.720 (GRCh38)
- Exoni
- 42 de exoni pe 108,6 kb
- Proteină
- 1.339 de aminoacizi
- Denumiri alternative
- KS, KNO1
- Simboluri anterioare
- KNO
- Transcriptul MANE Select
- ENST00000651438.1NM_001379500.1
- Tip de locus
- gene with protein product
- Foarte ridicată
- Ridicată
- Scăzută
- Foarte scăzută
Genom de referințăGRCh38hg38
Pozițiile de pe paginile genelor și variantelor urmează această alegere, în acest browser.
Citiți COL18A1 și restul genomului dumneavoastră cu un singur test.
De la 449 $Livrare gratuită · Rezultate în 6–8 săptămâni
Comandați Genome Test-ul meuRaport curatoriat relevant pentru această genă
Vitreoretinopatie
- Degenerescență vitreoretiniană
- ClinGen evaluează legătura drept definitivă
- 4 de evaluatori GenCC o clasifică drept definitivă sau puternică
Structura genei COL18A1
- Secvență codificatoare
- Regiune netranslată
- Intron
- Sensul transcripției
- Situri cunoscute asociate bolilor
- Regiuni pe care citirile scurte le găsesc dificile
Exonii transcriptului MANE Select al genei (versiunea v1.5), din NCBI și EMBL-EBI, pe genomul de referință GRCh38.
Benzile cromozomale din ideograma GRCh38 a UCSC (2022-10-29).
Genele din apropiere, din Ensembl, versiunea 116, pe GRCh38.
Exonii reprezintă 5,4 kb din cei 108,6 kb ai genei; 4.020 dintre aceste baze codifică proteina.
Cum citește un test genomic COL18A1
41
poziții în COL18A1 în care ClinVar clasifică o modificare drept patogenă sau probabil patogenă
Niciuna dintre ele nu se află într-o regiune pe care citirile scurte o găsesc dificilă.
Un test genomic complet acoperă toți cei 108,6 kb ai genei COL18A1, inclusiv intronii, nu doar cei 5,4 kb de exoni.
Gene asociate acelorași afecțiuni
- BEST1bestrophin 1Are 1 afecțiune în comun
- CAPN5calpain 5Are 1 afecțiune în comun
- COL11A1collagen type XI alpha 1 chainAre 1 afecțiune în comun
- COL2A1collagen type II alpha 1 chainAre 1 afecțiune în comun
- COL9A1collagen type IX alpha 1 chainAre 1 afecțiune în comun
- COL9A2collagen type IX alpha 2 chainAre 1 afecțiune în comun
- COL9A3collagen type IX alpha 3 chainAre 1 afecțiune în comun
- CTNNB1catenin beta 1Are 1 afecțiune în comun
- DYNC1H1dynein cytoplasmic 1 heavy chain 1Are 1 afecțiune în comun
- FZD4frizzled class receptor 4Are 1 afecțiune în comun
- KCNJ13potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 13Are 1 afecțiune în comun
- LRP5LDL receptor related protein 5Are 1 afecțiune în comun
Trăsături asociate cu COL18A1
Human Phenotype Ontology le enumeră drept caracteristici ale afecțiunilor rare pe care le poate provoca COL18A1. Pagina fiecărei trăsături enumeră celelalte gene asociate cu aceasta.
Abnormality of the eye
- Chorioretinal atrophy
- Gaze-evoked nystagmus
- Glaucoma
- Macular hypoplasia
- Peripapillary atrophy
- Visual impairment
- Close sighted
- Macular degeneration
Afișați încă 25 de trăsături
- Retinal detachment
- Severe near sightedness
- Vitreoretinopathy
- Abnormal vitreous humor morphology
- Band keratopathy
- Clouding of the lens of the eye at birth
- Cortical cataract
- High eye pressure
- Horizontal nystagmus
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Iris transillumination defect
- Optic disc pallor
- Partially dislocated lens
- Progressive loss of vision
- Visual loss
- Angle closure glaucoma
- Clouding of the lens of the eye
- Cross-eyed
- Ectopia lentis
- Persistent pupillary membrane
- Anterior synechiae of the anterior chamber
- Increased cup-to-disc ratio
- Partial loss of field of vision
- Phthisis bulbi
- Slow pupillary light response
Abnormality of head or neck
- Abnormally small head
- Bulbous nose
- Horizontal eyebrow
- Narrow face
- Narrow forehead
- Prominent forehead
- Brain tissue sticks out through back of skull
- Cranial defect
Afișați încă 5 de trăsături
Legături externe
Înregistrări ale genei
Transcript
Proteină
De unde provin acestea
- HGNC: simbolul genei, numele, alte simboluri și localizarea.
- MANE Select v1.5, de la NCBI și EMBL-EBI: transcriptul, exonii și secvența codificatoare.
- GenCC și ClinGen, publicate în 2026-10-16: de care afecțiuni este legată gena și cât de puternică este legătura.
- Lista ACMG de descoperiri secundare, SF v3.2.
- ClinVar și stratificările GIAB: locurile cunoscute asociate bolilor și regiunile pe care citirile scurte le consideră dificile.
- Human Phenotype Ontology, versiunea 2026-09-01: trăsăturile asociate genei. Aflați mai multe la hpo.jax.org.
- Versiunea datelor 2026.10.16-c6eea6bf.
Citează această pagină
Dante Labs. (s.a.). Gena COL18A1: collagen type XVIII alpha 1 chain. Accesat 17 octombrie 2026, de la https://dantelabs.com/ro/genes/col18a1
Dante Labs. Gena COL18A1: collagen type XVIII alpha 1 chain [Internet]. [citat 17 octombrie 2026]. Disponibil la: https://dantelabs.com/ro/genes/col18a1
Un test. Răspunsuri pentru o viață.
De la 449 $Livrare gratuită · Rezultate în 6–8 săptămâni