Gen
COL18A1
collagen type XVIII alpha 1 chain
- HGNC 2195↗(otwiera się w nowej karcie)
- Gen Ensembl ENSG00000182871↗(otwiera się w nowej karcie)
- NCBI Gene 80781↗(otwiera się w nowej karcie)
Podsumowanie
- Lokalizacja cytogenetyczna
- 21q22.3
- Współrzędne
- Chromosom 21: 45 405 165–45 513 720 (GRCh38)
- Eksony
- 42 eksonów na odcinku 108,6 kb
- Białko
- 1339 aminokwasów
- Znany również jako
- KS, KNO1
- Poprzednie symbole
- KNO
- Transkrypt MANE Select
- ENST00000651438.1NM_001379500.1
- Typ locus
- gene with protein product
- Bardzo wysoka
- Pewna
- Niska
- Bardzo niska
Genom referencyjnyGRCh38hg38
Pozycje na stronach genów i wariantów zależą od tego wyboru, w tej przeglądarce.
Odczytaj COL18A1 oraz resztę swojego genomu dzięki jednemu badaniu.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
Zamawiam Genome TestWyselekcjonowany raport dotyczący tego genu
Witreoretinopatia
- Witreoretinalna degeneracja
- ClinGen ocenia związek jako: definitywne
- 4 podmiotów GenCC ocenia go jako definitywny lub silny
Budowa genu COL18A1
- Sekwencja kodująca
- Region nieulegający translacji
- Intron
- Kierunek transkrypcji
- Znane miejsca powodujące choroby
- Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.
Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.
Eksony stanowią 5,4 kb z 108,6 kb genu; 4020 z tych zasad kodują białko.
Jak test genomu odczytuje COL18A1
41
pozycje w COL18A1, w których ClinVar klasyfikuje zmianę jako patogenną lub prawdopodobnie patogenną
Żadne z nich nie przypada na region, który krótkie odczyty trudno odczytać.
Pełne sekwencjonowanie genomu obejmuje wszystkie 108,6 kb genu COL18A1, łącznie z intronami, a nie tylko 5,4 kb eksonów.
Geny powiązane z tymi samymi schorzeniami
- BEST1bestrophin 1Wspólne schorzenie: 1
- CAPN5calpain 5Wspólne schorzenie: 1
- COL11A1collagen type XI alpha 1 chainWspólne schorzenie: 1
- COL2A1collagen type II alpha 1 chainWspólne schorzenie: 1
- COL9A1collagen type IX alpha 1 chainWspólne schorzenie: 1
- COL9A2collagen type IX alpha 2 chainWspólne schorzenie: 1
- COL9A3collagen type IX alpha 3 chainWspólne schorzenie: 1
- CTNNB1catenin beta 1Wspólne schorzenie: 1
- DYNC1H1dynein cytoplasmic 1 heavy chain 1Wspólne schorzenie: 1
- FZD4frizzled class receptor 4Wspólne schorzenie: 1
- KCNJ13potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 13Wspólne schorzenie: 1
- LRP5LDL receptor related protein 5Wspólne schorzenie: 1
Cechy powiązane z genem COL18A1
Human Phenotype Ontology wymienia te cechy jako objawy rzadkich schorzeń, które może wywoływać COL18A1. Na stronie każdej cechy znajdują się inne geny z nią powiązane.
Abnormality of the eye
- Chorioretinal atrophy
- Gaze-evoked nystagmus
- Glaucoma
- Macular hypoplasia
- Peripapillary atrophy
- Visual impairment
- Close sighted
- Macular degeneration
Pokaż jeszcze 25 cech
- Retinal detachment
- Severe near sightedness
- Vitreoretinopathy
- Abnormal vitreous humor morphology
- Band keratopathy
- Clouding of the lens of the eye at birth
- Cortical cataract
- High eye pressure
- Horizontal nystagmus
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Iris transillumination defect
- Optic disc pallor
- Partially dislocated lens
- Progressive loss of vision
- Visual loss
- Angle closure glaucoma
- Clouding of the lens of the eye
- Cross-eyed
- Ectopia lentis
- Persistent pupillary membrane
- Anterior synechiae of the anterior chamber
- Increased cup-to-disc ratio
- Partial loss of field of vision
- Phthisis bulbi
- Slow pupillary light response
Linki zewnętrzne
Rekordy genów
Transkrypt
Białko
Skąd pochodzą te dane
- HGNC: symbol genu, jego nazwa, inne symbole i położenie.
- MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
- GenCC i ClinGen, wydanie 2026-10-16: z jakimi schorzeniami gen jest powiązany i jak silne jest to powiązanie.
- Lista ACMG dotycząca wtórnych wyników, SF v3.2.
- ClinVar i stratyfikacje GIAB: znane miejsca powodujące choroby oraz regiony, które krótkie odczyty trudno odczytać.
- Human Phenotype Ontology, wersja 2026-09-01: cechy powiązane z genem. Więcej informacji znajdą Państwo na hpo.jax.org.
- Wydanie danych 2026.10.16-c6eea6bf.
Cytuj tę stronę
Dante Labs. (b.d.). Gen COL18A1: collagen type XVIII alpha 1 chain. Pobrano 17 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/col18a1
Dante Labs. Gen COL18A1: collagen type XVIII alpha 1 chain [Internet]. [cytowano 17 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/col18a1
Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni