Gen
COL18A1
collagen type XVIII alpha 1 chain
- HGNC 2195↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000182871↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 80781↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 21q22.3
- Coördinaten
- Chromosoom 21: 45.405.165–45.513.720 (GRCh38)
- Exons
- 42 exons over 108,6 kb
- Eiwit
- 1.339 aminozuren
- Ook bekend als
- KS, KNO1
- Eerdere symbolen
- KNO
- MANE Select-transcript
- ENST00000651438.1NM_001379500.1
- Type locus
- gene with protein product
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
ReferentiegenoomGRCh38hg38
Posities op gen- en variantpagina's volgen deze keuze, in deze browser.
Lees COL18A1 en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerd rapport over dit gen
Vitreoretinopathie
- Vitreoretinale Degeneratie
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 4 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
Opbouw van COL18A1
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
- Gebieden die korte reads moeilijk vinden
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 5,4 kb van de 108,6 kb van het gen; 4.020 van die basen coderen voor het eiwit.
Hoe een genoomtest COL18A1 leest
41
posities in COL18A1 waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen classificeert
Geen daarvan valt in een gebied dat korte reads moeilijk vinden.
Een volledig genoom dekt alle 108,6 kb van COL18A1, inclusief introns, en niet alleen de 5,4 kb aan exonen.
Genen die aan dezelfde aandoeningen zijn gekoppeld
- BEST1bestrophin 1Deelt 1 aandoening
- CAPN5calpain 5Deelt 1 aandoening
- COL11A1collagen type XI alpha 1 chainDeelt 1 aandoening
- COL2A1collagen type II alpha 1 chainDeelt 1 aandoening
- COL9A1collagen type IX alpha 1 chainDeelt 1 aandoening
- COL9A2collagen type IX alpha 2 chainDeelt 1 aandoening
- COL9A3collagen type IX alpha 3 chainDeelt 1 aandoening
- CTNNB1catenin beta 1Deelt 1 aandoening
- DYNC1H1dynein cytoplasmic 1 heavy chain 1Deelt 1 aandoening
- FZD4frizzled class receptor 4Deelt 1 aandoening
- KCNJ13potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 13Deelt 1 aandoening
- LRP5LDL receptor related protein 5Deelt 1 aandoening
Kenmerken gekoppeld aan COL18A1
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die COL18A1 kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Abnormality of the eye
- Chorioretinal atrophy
- Gaze-evoked nystagmus
- Glaucoma
- Macular hypoplasia
- Peripapillary atrophy
- Visual impairment
- Close sighted
- Macular degeneration
Toon 25 kenmerken meer
- Retinal detachment
- Severe near sightedness
- Vitreoretinopathy
- Abnormal vitreous humor morphology
- Band keratopathy
- Clouding of the lens of the eye at birth
- Cortical cataract
- High eye pressure
- Horizontal nystagmus
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Iris transillumination defect
- Optic disc pallor
- Partially dislocated lens
- Progressive loss of vision
- Visual loss
- Angle closure glaucoma
- Clouding of the lens of the eye
- Cross-eyed
- Ectopia lentis
- Persistent pupillary membrane
- Anterior synechiae of the anterior chamber
- Increased cup-to-disc ratio
- Partial loss of field of vision
- Phthisis bulbi
- Slow pupillary light response
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool van het gen, de naam, andere symbolen en de locatie.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht 2026-10-16: aan welke aandoeningen het gen is gekoppeld, en hoe sterk dat verband is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende plaatsen en de regio's waar korte reads moeite mee hebben.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.16-c6eea6bf.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). COL18A1-gen: collagen type XVIII alpha 1 chain. Geraadpleegd op 17 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/col18a1
Dante Labs. COL18A1-gen: collagen type XVIII alpha 1 chain [Internet]. [geraadpleegd 17 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/col18a1
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken