Gène
CYP27A1
cytochrome P450 family 27 subfamily A member 1
- HGNC 2605↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
- Gène Ensembl ENSG00000135929↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
- Gène NCBI 1593↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
Résumé
- Localisation cytogénétique
- 2q35
- Coordonnées
- Chromosome 2 : 218 782 147–218 815 293 (GRCh38)
- Exons
- 9 exons sur 33,1 kb
- Protéine
- 531 acides aminés
- Aussi appelé
- CTX, CP27
- Symboles précédents
- CYP27
- Transcrit MANE Select
- ENST00000258415.9NM_000784.4
- Type de locus
- Codant pour une protéine
- Très élevé
- Fiable
- Faible
- Très faible
Cette page en données
Ajoutez .json à l'adresse de la page, ou demandez application/json, pour la lire au format JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/cyp27a1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLisez CYP27A1, et le reste de votre génome, avec un seul test.
À partir de 449 $Livraison gratuite · Résultats sous 6 à 8 semaines
Obtenir mon Genome TestRapports d'expertise pertinents pour ce gène
Xanthomatose cérébrotendineuse
- Autosomique récessif
Un déficit en stérol 27-hydroxylase entraîne, dès l'enfance, des diarrhées chroniques et des cataractes, des xanthomes tendineux, puis une ataxie, une spasticité, un déclin cognitif et des modifications de la substance blanche.
- ClinGen juge le lien définitif
- 6 évaluateurs GenCC le classent comme définitif ou fort
▶Actionnabilité
Un traitement par acide chénodésoxycholique peut prévenir ou ralentir l'évolution de la maladie neurologique, surtout lorsqu'il est débuté tôt.
Regroupements plus larges
Ataxies cérébelleuses autosomiques récessives (dont CANVAS et AVED)
- Ataxie cérébelleuse autosomique récessiveAutosomique récessif
L'un des 57 gènes qui lui sont liés
Un groupe d'ataxies à transmission récessive causées par des variants biallèliques dans des gènes tels que RFC1, FXN, SACS, TTPA, SETX, APTX, PNKP, ANO10 et SYNE1.
- ClinGen juge le lien définitif
- 6 évaluateurs GenCC le classent comme définitif ou fort
▶Actionnabilité
L'ataxie avec déficit en vitamine E (TTPA) peut être traitée par des suppléments de vitamine E ; les autres formes sont prises en charge par la kinésithérapie et des soins visant les symptômes, et un dépistage de porteur peut être proposé aux apparentés.
Maladies neurodégénératives héréditaires
- Maladie neurodégénérative liée à KIF5AAutosomique dominant
L'un des 372 gènes qui lui sont liés
Causée par des modifications d'une copie du gène KIF5A, qui code une protéine motrice dotée d'une queue de liaison à sa cargaison. Différents types de modifications entraînent différentes affections : la paraplégie spastique héréditaire de type 10, une forme axonale de la maladie de Charcot-Marie-Tooth et la sclérose latérale amyotrophique (SLA).
- ClinGen juge le lien définitif
- 6 évaluateurs GenCC le classent comme définitif ou fort
▶Actionnabilité
La prise en charge est symptomatique et dépend de la forme clinique ; elle comprend la kinésithérapie, des médicaments contre la spasticité et un suivi pluridisciplinaire de la SLA. Chaque enfant d'une personne atteinte a une chance sur 2 d'hériter de la modification ; le conseil génétique aide les familles à comprendre ce risque.
Autres leucodystrophies héréditaires
- Leucodystrophie (autres types et types non précisés)
L'un des 80 gènes qui lui sont liés
Maladies héréditaires qui altèrent ou empêchent la formation normale de la myéline, la substance blanche du cerveau et de la moelle épinière. Selon le gène concerné, les différents types suivent une hérédité autosomique récessive, autosomique dominante ou liée à l'X.
- ClinGen juge le lien définitif
- 6 évaluateurs GenCC le classent comme définitif ou fort
▶Actionnabilité
Connaître la cause génétique précise peut mettre fin à une recherche diagnostique, guider les soins de soutien et la surveillance, indiquer s'il existe un traitement spécifique et permettre le dépistage des apparentés.
Maladie de surcharge lysosomale
- Maladie de surcharge lysosomale (autres types et types non précisés)
L'un des 59 gènes qui lui sont liés
Couvre les maladies de surcharge lysosomale sans rapport dédié, telles que la maladie de Farber et d'autres troubles liés à ASAH1, les déficits en prosaposine (PSAP), le déficit en sulfatases multiples, les mucopolysaccharidoses de types IX et X, et la maladie de Dorfman-Chanarin ; le mode de transmission varie selon le sous-type, le plus souvent autosomique récessif.
- ClinGen juge le lien définitif
- 6 évaluateurs GenCC le classent comme définitif ou fort
Neuropathies périphériques héréditaires rares
- Neuropathie périphérique héréditaire
L'un des 233 gènes qui lui sont liés
Causée par des modifications dans l'un des nombreux gènes nécessaires au maintien en bon état des longues fibres nerveuses. Dans ce rapport, ces gènes comprennent IGHMBP2 et PLEKHG5, dont la transmission est récessive.
- ClinGen juge le lien définitif
- 6 évaluateurs GenCC le classent comme définitif ou fort
▶Actionnabilité
La kinésithérapie, les orthèses et l'ergothérapie aident à préserver la mobilité, avec une chirurgie des déformations du pied si nécessaire. Certaines formes nécessitent une surveillance respiratoire. Le conseil génétique oriente le dépistage familial selon le mode de transmission du gène concerné.
Structure de CYP27A1
- Séquence codante
- Région non traduite
- Intron
- Sens de la transcription
- Sites connus associés à une maladie
- Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.
Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.
Les exons représentent 1,9 kb sur les 33,1 kb du gène ; 1 596 de ces bases codent pour la protéine.
Séquençage de CYP27A1
3Facile
Difficulté de séquençage de CYP27A1 avec des lectures courtes, sur 100
0 · Facile100 · Difficile
Presque tous les exons de CYP27A1 se situent dans des zones où les lectures courtes se positionnent sans ambiguïté.
Facteur aggravant : la part des exons de CYP27A1 située dans chaque type de région difficile
- MappabilitéPortions où des lectures de 100 ou 250 pb ne peuvent pas être placées de façon unique, si bien qu'un appel dans ces zones peut être manquant ou erroné. À lui seul, un gène entièrement situé dans ce type de région obtiendrait un score de 100.0 %
- HomologieDuplications segmentaires : copies ailleurs dans le génome, comme les paralogues et les pseudogènes, à 90 % d'identité ou plus. À lui seul, un gène entièrement situé dans ce type de région obtiendrait un score de 60.0 %
- Partagé avec le chrYLes régions pseudoautosomales et la région transposée du X, où les chrX et chrY portent la même séquence ou une séquence presque identique, si bien qu'une lecture issue de l'un peut être placée sur l'autre. À lui seul, un gène entièrement situé dans ce type de région obtiendrait un score de 60.0 %
- Couverture de la référenceLacunes dans l'assemblage de référence à proximité, où il n'existe aucune séquence sur laquelle les lectures peuvent s'aligner. À lui seul, un gène entièrement situé dans ce type de région obtiendrait un score de 50.0 %
- RépétitionsRépétitions en tandem et suites d'une même base, sur lesquelles les lectures glissent et qu'elles peuvent ne pas couvrir en entier. À lui seul, un gène entièrement situé dans ce type de région obtiendrait un score de 30.2,3 %
- Teneur en GCFenêtres comportant moins de 25 % ou plus de 65 % de G et de C, que la préparation de la bibliothèque couvre mal. À lui seul, un gène entièrement situé dans ce type de région obtiendrait un score de 20.13 %
Un score Dante Labs issu de nos propres recherches, fondé sur les cartes des régions difficiles à séquencer de Genome in a Bottle du NIST.Mode de calcul du scoreChaque barre représente la part des bases exoniques de CYP27A1 située dans ce type de région difficile. Chaque type peut à lui seul rendre un gène difficile, et chaque type supplémentaire ajoute moins : 0 lorsqu'aucune base ne se trouve dans l'un d'eux, 100 lorsque toutes les bases se trouvent dans des zones où les lectures ne peuvent pas être placées de façon unique.
186
positions dans CYP27A1 où ClinVar classe une variation comme pathogène ou probablement pathogène
Aucune d'entre elles ne se trouve dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.
Un génome complet couvre les 33,1 kb de CYP27A1 dans leur totalité, introns compris, et pas seulement les 1,9 kb d'exons.
ClinVar pathogenic variants (212)
The CYP27A1 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Pathogène 98
- Pathogène/probablement pathogène 54
- Probablement pathogène 60
| Variant | Conditions | Classification ClinVar | Statut de révision |
|---|---|---|---|
| NM_000784.4(CYP27A1):c.11_20dup (p.Arg8fs) (opens in a new tab) | cerebrotendinous xanthomatosis | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000784.4(CYP27A1):c.5dup (p.Ala3fs) (opens in a new tab) | cerebrotendinous xanthomatosis | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000784.4(CYP27A1):c.256-2A>G (opens in a new tab) | cerebrotendinous xanthomatosis | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000784.4(CYP27A1):c.256-1G>T (opens in a new tab) | cerebrotendinous xanthomatosis | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000784.4(CYP27A1):c.303del (p.Pro102fs) (opens in a new tab) | cerebrotendinous xanthomatosis | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000784.4(CYP27A1):c.379C>T (p.Arg127Trp) (opens in a new tab) | cerebrotendinous xanthomatosis | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000784.4(CYP27A1):c.380G>A (p.Arg127Gln) (opens in a new tab) | cerebrotendinous xanthomatosis | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000784.4(CYP27A1):c.446+1G>A (opens in a new tab) | cerebrotendinous xanthomatosis | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000784.4(CYP27A1):c.446+1G>T (opens in a new tab) | cerebrotendinous xanthomatosis | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000784.4(CYP27A1):c.475C>T (p.Gln159Ter) (opens in a new tab) | cerebrotendinous xanthomatosis | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000784.4(CYP27A1):c.562C>T (p.Arg188Ter) (opens in a new tab) | cerebrotendinous xanthomatosis | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000784.4(CYP27A1):c.571C>T (p.Gln191Ter) (opens in a new tab) | cerebrotendinous xanthomatosis | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000784.4(CYP27A1):c.646G>C (p.Ala216Pro) (opens in a new tab) | cerebrotendinous xanthomatosis | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000784.4(CYP27A1):c.667G>T (p.Glu223Ter) (opens in a new tab) | cerebrotendinous xanthomatosis | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000784.4(CYP27A1):c.691C>T (p.Arg231Ter) (opens in a new tab) | cerebrotendinous xanthomatosis | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000784.4(CYP27A1):c.745C>T (p.Gln249Ter) (opens in a new tab) | cerebrotendinous xanthomatosis | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000784.4(CYP27A1):c.808C>T (p.Arg270Ter) (opens in a new tab) | cerebrotendinous xanthomatosis | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000784.4(CYP27A1):c.819del (p.Asp273fs) (opens in a new tab) | cerebrotendinous xanthomatosis | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000784.4(CYP27A1):c.844+1G>A (opens in a new tab) | cerebrotendinous xanthomatosis | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000784.4(CYP27A1):c.844+1G>T (opens in a new tab) | cerebrotendinous xanthomatosis | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000784.4(CYP27A1):c.845-2A>G (opens in a new tab) | cerebrotendinous xanthomatosis | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000784.4(CYP27A1):c.845-1G>A (opens in a new tab) | cerebrotendinous xanthomatosis | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000784.4(CYP27A1):c.850A>T (p.Lys284Ter) (opens in a new tab) | cerebrotendinous xanthomatosis | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000784.4(CYP27A1):c.886C>T (p.Gln296Ter) (opens in a new tab) | cerebrotendinous xanthomatosis | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000784.4(CYP27A1):c.1184+1G>A (opens in a new tab) | cerebrotendinous xanthomatosis | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
See all 212 with every other CYP27A1 variant in ClinVar → (opens in a new tab)
Gènes liés aux mêmes affections
- ARSAarylsulfatase APartage 4 affections
- GALCgalactosylceramidasePartage 4 affections
- PEX6peroxisomal biogenesis factor 6Partage 4 affections
- PSAPprosaposinPartage 4 affections
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Partage 3 affections
- COQ8Acoenzyme Q8APartage 3 affections
- EARS2glutamyl-tRNA synthetase 2, mitochondrialPartage 3 affections
- HEXAhexosaminidase subunit alphaPartage 3 affections
- HEXBhexosaminidase subunit betaPartage 3 affections
- MTTPmicrosomal triglyceride transfer proteinPartage 3 affections
- PEX1peroxisomal biogenesis factor 1Partage 3 affections
- PEX10peroxisomal biogenesis factor 10Partage 3 affections
Traits associés à CYP27A1
L'Human Phenotype Ontology répertorie ces traits comme caractéristiques des maladies rares que CYP27A1 peut provoquer. La page de chaque trait indique les autres gènes qui lui sont associés.
Abnormality of the nervous system
- Abnormal gait
- Babinski sign
- Degeneration of cerebellum
- Degeneration of cerebrum
- EEG with generalized slow activity
- Abnormal auditory evoked potentials
- Abnormal cerebellar peduncle morphology
- Abnormal globus pallidus morphology
Afficher 47 traits supplémentaires
- Abnormal motor evoked potentials
- Abnormal pyramidal sign
- Abnormality of extrapyramidal motor function
- Abnormality of somatosensory evoked potentials
- Abnormality of the cerebellum
- Ataxia
- Behavioral abnormality
- Cognitive impairment
- Decreased nerve conduction velocity
- Difficulty articulating speech
- Dystonia
- Epilepsy
- Hyperintensity of cerebral white matter on MRI
- Increased reflexes
- Intellectual disability
- Neurodevelopmental delay
- Orofacial dyskinesia
- Partial paralysis of legs
- Peripheral neuropathy
- Progressive psychomotor deterioration
- Specific learning disability
- Abnormal dentate nucleus morphology
- Aggressive behavior
- Agitation
- Attention deficit
- Autism
- Axonal degeneration
- CNS demyelination
- Depression
- Elevated brain choline level by MRS
- Elevated brain lactate level by MRS
- Generalized brain degeneration
- Gliosis
- Hallucinations
- Long-tract sign
- Parkinsonism
- Personality disorder
- Resting tremor
- Short attention span
- Suicidal ideation
- Myelopathy
- Palatal tremor
- Somatic sensory dysfunction
- Abnormal periventricular white matter morphology
- Delayed somatosensory central conduction time
- Delusions
- Dementia
Abnormality of limbs
- Abnormal rhythmic movements of ankle
- Lower limb muscle weakness
- Abnormalities of the fingers
- Abnormality of the Achilles tendon
- Abnormality of the plantar skin of foot
- Abnormality of the shankbone
- High-arched foot
- Abnormality of the elbow
Afficher 2 traits supplémentaires
Abnormality of the eye
- Juvenile cataract
- Visual impairment
- Abnormality of visual evoked potentials
- Damaged optic nerve
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Optic disc pallor
- Bulging eye
- Hypermyelinated retinal nerve fibers
Afficher 2 traits supplémentaires
Abnormality of the musculoskeletal system
- Distal muscle wasting
- Involuntary muscle stiffness, contraction, or spasm
- Osteoporosis
- Abnormality of the vertebral spinous processes
- Increased susceptibility to fractures
- Osteopenia
- Thoracic kyphosis
- Spastic paraparesis
Afficher 1 trait supplémentaire
Liens externes
Fiches de gènes
Transcrit
Protéine
D'où proviennent ces données
- HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
- MANE Select v1.5, issu de NCBI et d'EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
- GenCC et ClinGen, publiés en 2026-10-19 : les maladies auxquelles le gène est associé et la solidité de ce lien.
- La liste ACMG des résultats secondaires, SF v3.2.
- ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
- Les stratifications du génome Genome in a Bottle, publiées par le NIST : le score de difficulté de séquençage.
- L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
- Version des données 2026.10.19-9814e911.
Citer cette page
Dante Labs. (s.d.). Gène CYP27A1 : cytochrome P450 family 27 subfamily A member 1. Consulté le 19 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/cyp27a1
Dante Labs. Gène CYP27A1 : cytochrome P450 family 27 subfamily A member 1 [Internet]. [consulté le 19 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/cyp27a1
Un seul test. Des réponses pour toute la vie.
À partir de 449 $Livraison gratuite · Résultats sous 6 à 8 semaines