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Gène

CTDSP1

CTD small phosphatase 1

Résumé

Localisation cytogénétique
2q35
Coordonnées
Chromosome 2 : 218 399 868–218 405 941 (GRCh38)
Exons
7 exons sur 6,1 kb
Protéine
261 acides aminés
Aussi appelé
NLIIF, SCP1
Transcrit MANE Select
ENST00000273062.7NM_021198.3
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore CTDSP1. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de CTDSP1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
Chromosome 2, avec un crochet à l'emplacement de CTDSP1. CTDSP1 et 24 gènes à proximité sur le chromosome 2, de 217 902 905 à 218 902 904.Chromosome 22q35p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23.3p23.2p23.1p22.3p22.2p22.1p21p16.3p16.2p16.1p15p14p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13q14.1q14.2q14.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q33.1q33.2q33.3q34q35q36.1q36.2q36.3q37.1q37.2q37.3218 Mb218,2 Mb218,4 Mb218,6 Mb218,8 MbTNS1 : 217 799 588–218 033 982, brin inverseTNS1RUFY4 : 218 034 960–218 090 649, brin directRUFY4CXCR2 : 218 125 269–218 137 251, brin directCXCR2CXCR1 : 218 162 841–218 166 969, brin inverseCXCR1ARPC2 : 218 216 630–218 254 356, brin directARPC2GPBAR1 : 218 259 496–218 263 861, brin directGPBAR1AAMP : 218 264 125–218 270 889, brin inverseAAMPPNKD : 218 269 651–218 347 057, brin directPNKDTMBIM1 : 218 274 193–218 292 589, brin inverseTMBIM1CATIP : 218 356 838–218 369 962, brin directCATIPSLC11A1 : 218 382 006–218 396 906, brin directSLC11A1CTDSP1 : 218 399 868–218 405 941, brin directCTDSP1VIL1 : 218 419 083–218 453 295, brin directVIL1USP37 : 218 450 251–218 568 768, brin inverseUSP37CNOT9 : 218 568 575–218 597 080, brin directCNOT9PLCD4 : 218 607 855–218 637 186, brin directPLCD4ZNF142 : 218 633 329–218 659 655, brin inverseZNF142BCS1L : 218 658 764–218 668 759, brin directBCS1LRNF25 : 218 662 081–218 672 009, brin inverseRNF25STK36 : 218 672 027–218 702 717, brin directSTK36TTLL4 : 218 710 773–218 759 724, brin directTTLL4CYP27A1 : 218 781 688–218 825 335, brin directCYP27A1PRKAG3 : 218 819 050–218 832 086, brin inversePRKAG3WNT6 : 218 859 795–218 874 233, brin directWNT6WNT10A : 218 880 852–218 899 581, brin directWNT10ASchéma de CTDSP1 : 7 exons sur le brin direct du chromosome 2Exon 1 : 218 399 868–218 400 157, 290 basesExon 2 : 218 401 564–218 401 712, 149 basesExon 3 : 218 402 111–218 402 215, 105 basesExon 4 : 218 402 349–218 402 405, 57 basesExon 5 : 218 403 035–218 403 127, 93 basesExon 6 : 218 403 232–218 403 417, 186 basesExon 7 : 218 404 297–218 405 941, 1 645 bases12345675′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 2,5 kb sur les 6,1 kb du gène ; 786 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

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Dante Labs. (s.d.). Gène CTDSP1 : CTD small phosphatase 1. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/ctdsp1

Vancouver

Dante Labs. Gène CTDSP1 : CTD small phosphatase 1 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/ctdsp1

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