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Gène

ATG9A

autophagy related 9A

Résumé

Localisation cytogénétique
2q35
Coordonnées
Chromosome 2 : 219 219 380–219 229 636 (GRCh38)
Exons
16 exons sur 10,3 kb
Protéine
839 acides aminés
Aussi appelé
FLJ22169
Symboles précédents
APG9L1
Transcrit MANE Select
ENST00000361242.9NM_001077198.3
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

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Structure de ATG9A

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 2, avec un crochet à l'emplacement de ATG9A. ATG9A et 39 gènes à proximité sur le chromosome 2, de 218 724 508 à 219 724 507.Chromosome 22q35p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23.3p23.2p23.1p22.3p22.2p22.1p21p16.3p16.2p16.1p15p14p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13q14.1q14.2q14.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q33.1q33.2q33.3q34q35q36.1q36.2q36.3q37.1q37.2q37.3218,8 Mb219 Mb219,2 Mb219,4 Mb219,6 MbTTLL4 : 218 710 773–218 759 724, brin directTTLL4CYP27A1 : 218 781 688–218 825 335, brin directCYP27A1PRKAG3 : 218 819 050–218 832 086, brin inversePRKAG3WNT6 : 218 859 795–218 874 233, brin directWNT6WNT10A : 218 880 852–218 899 581, brin directWNT10ACDK5R2 : 218 959 666–218 962 155, brin directCDK5R2FEV : 218 981 087–218 985 566, brin inverseFEVCRYBA2 : 218 990 189–218 994 270, brin inverseCRYBA2CFAP65 : 219 002 846–219 041 527, brin inverseCFAP65IHH : 219 054 424–219 061 064, brin inverseIHHNHEJ1 : 219 069 355–219 160 869, brin inverseNHEJ1 : 219 075 329–219 170 827, brin inverseSLC23A3 : 219 161 465–219 170 095, brin inverseSLC23A3CNPPD1 : 219 170 704–219 182 664, brin inverseRETREG2 : 219 176 225–219 185 917, brin directZFAND2B : 219 195 237–219 209 651, brin directABCB6 : 219 209 765–219 219 012, brin inverseABCB6 : 219 209 772–219 222 738, brin inverseATG9A : 219 219 380–219 229 636, brin inverseATG9AANKZF1 : 219 229 769–219 236 679, brin directANKZF1GLB1L : 219 236 598–219 245 478, brin inverseSTK16 : 219 245 212–219 250 339, brin directTUBA4A : 219 249 710–219 277 902, brin inverseTUBA4B : 219 253 243–219 272 197, brin directDNAJB2 : 219 279 308–219 286 900, brin directPTPRN : 219 289 623–219 309 648, brin inversePTPRNRESP18 : 219 327 407–219 335 552, brin inverseRESP18DNPEP : 219 360 090–219 400 022, brin inverseDNPEPDES : 219 417 474–219 426 740, brin directDESSPEG : 219 434 471–219 493 629, brin directSPEG : 219 491 867–219 498 244, brin directSPEGNB : 219 496 129–219 498 287, brin directSPEGNBGMPPA : 219 498 618–219 513 898, brin directGMPPAASIC4 : 219 514 170–219 538 772, brin directASIC4CHPF : 219 538 949–219 543 818, brin inverseCHPFTMEM198 : 219 543 130–219 550 595, brin directOBSL1 : 219 550 727–219 572 076, brin inverseOBSL1INHA : 219 569 162–219 575 711, brin directSTK11IP : 219 595 805–219 616 452, brin directSTK11IPSLC4A3 : 219 627 011–219 641 982, brin directSLC4A3Schéma de ATG9A : 16 exons sur le brin inverse du chromosome 2Exon 16 : 219 219 380–219 220 452, 1 073 basesExon 15 : 219 220 747–219 220 892, 146 basesExon 14 : 219 221 080–219 221 302, 223 basesExon 13 : 219 222 050–219 222 167, 118 basesExon 12 : 219 222 272–219 222 450, 179 basesExon 11 : 219 222 645–219 222 893, 249 basesExon 10 : 219 223 585–219 223 764, 180 basesExon 9 : 219 223 869–219 224 022, 154 basesExon 8 : 219 224 106–219 224 854, 749 basesExon 7 : 219 225 071–219 225 212, 142 basesExon 6 : 219 225 411–219 225 572, 162 basesExon 5 : 219 226 869–219 226 933, 65 basesExon 4 : 219 227 770–219 227 813, 44 basesExon 3 : 219 227 922–219 228 053, 132 basesExon 2 : 219 228 434–219 228 485, 52 basesExon 1 : 219 229 535–219 229 636, 102 bases161514131211109876543215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 3,8 kb sur les 10,3 kb du gène ; 2 520 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

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Dante Labs. (s.d.). Gène ATG9A : autophagy related 9A. Consulté le 16 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/atg9a

Vancouver

Dante Labs. Gène ATG9A : autophagy related 9A [Internet]. [consulté le 16 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/atg9a

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