Geeni
SLC2A1
solute carrier family 2 member 1
- HGNC 11005↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000117394↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 6513↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 1p34.2
- Koordinaatit
- Kromosomi 1: 42 925 353–42 958 868 (GRCh38)
- Eksonit
- 10 eksonia 33,5 kb:n alueella
- Proteiini
- 492 aminohappoa
- Periytyminen
- Autosomaalinen dominantti
- Tunnetaan myös nimellä
- DYT18, DYT9, GLUT-1
- Aiemmat symbolit
- GLUT1, GLUT, HTLVR, CSE
- MANE Select -transkripti
- ENST00000426263.10NM_006516.4
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue SLC2A1 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja
Dystonia, myotonia, paroksysmaalinen dyskinesia
- Paroksysmaalinen dyskinesiaAutosomaalinen dominantti
Paroksysmaalinen dyskinesia (PD) on harvinainen, osin erilaisista muodoista koostuva liikehäiriöryhmä, jossa esiintyy poikkeavia tahattomia liikkeitä. Ne toistuvat jaksoittain ja kestävät vain lyhyen aikaa. PD:hen kuuluvat paroksysmaalinen kinesigeeninen dyskinesia (PKD), paroksysmaalinen ei-kinesigeeninen dyskinesia (PNKD), paroksysmaalinen rasituksen aiheuttama dyskinesia (PED) sekä PKD:n muunnelmamuoto, lapsuusiän kouristukset ja korea-atetoosi (ICCA-oireyhtymä).
- 1 GenCC-arvioija arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
- Perinnöllinen dystonia
Yleisnimitys perinnöllisille dystonioille, mukaan lukien DYT-TOR1A-varhaisalkuinen yleistynyt dystonia, DYT-THAP1, myoklonus-dystonia (SGCE) ja KMT2B-liitännäinen dystonia.
- 2 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Laajemmat ryhmät
Epilepsia (laaja paneeli)
- Epilepsia
Yksi 171 siihen liittyvästä geenistä
Aivosairaus, jolle on tyypillistä hermosolujen epänormaalin voimakkaan purkautumisen aiheuttamat jaksot. Ne aiheuttavat ohimeneviä aistihermoston tai motoriikan neurologisia toimintahäiriöitä tai psyykkisiä toimintahäiriöitä. Jaksoihin voi liittyä tajunnan menetys tai kouristuksia, mutta näin ei aina ole.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 5 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Periytyminen
- Autosomaalinen dominantti
- Yksi muuttunut kopio kummalta vanhemmalta tahansa riittää. Vanhempi, jolla on yksi, siirtää sen kullekin lapselleen todennäköisyydellä yksi kahdesta.
SLC2A1-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 3,4 kb geenin 33,5 kb:stä; 1 479 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä SLC2A1
131
SLC2A1-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 33,5 kb geenistä SLC2A1, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 3,4 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- PRRT2proline rich transmembrane protein 2Yhteisiä sairauksia: 3
- ATP1A3ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 3Yhteisiä sairauksia: 2
- KCNJ10potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 10Yhteisiä sairauksia: 2
- PNKDPNKD metallo-beta-lactamase domain containingYhteisiä sairauksia: 2
- PNKPpolynucleotide kinase 3'-phosphataseYhteisiä sairauksia: 2
- TMEM151Atransmembrane protein 151AYhteisiä sairauksia: 2
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Yhteinen sairaus: 1
- ABAT4-aminobutyrate aminotransferaseYhteinen sairaus: 1
- ACTBactin betaYhteinen sairaus: 1
- ACTL6Bactin like 6BYhteinen sairaus: 1
- ADAM22ADAM metallopeptidase domain 22Yhteinen sairaus: 1
- ALDH7A1aldehyde dehydrogenase 7 family member A1Yhteinen sairaus: 1
Geeniin SLC2A1 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita SLC2A1 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the nervous system
- Convulsive status epilepticus
- Delayed CNS myelination
- Delayed speech and language development
- Difficulty articulating speech
- Disorder of involuntary muscle movements
- Epilepsy
- Inability to coordinate movements when walking
- Intellectual disability
Näytä 82 piirrettä lisää
- Interictal EEG abnormality
- Jerking
- Slurred speech
- Ataxia
- Choreoathetosis
- Dystonia
- EEG abnormality
- EEG with focal spike waves
- Encephalopathy
- Episodic hemiplegia
- Generalized myoclonic-atonic seizure
- Global developmental delay
- Paroxysmal dyskinesia
- Repeated seizures without recovery between them
- Abnormal autonomic nervous system physiology
- Abnormal pyramidal sign
- Attention deficit
- Behavioral abnormality
- Bilateral tonic-clonic seizure with generalized onset
- Brief seizures with staring spells
- Chorea
- Confusion
- EEG with polyspike wave complexes
- Episodic ataxia
- Extrapyramidal dyskinesia
- Generalized hyperreflexia
- Generalized myoclonic seizure
- Headache
- Hyperactive deep tendon reflexes
- Increased reflexes
- Intellectual disability, mild
- Intellectual disability, severe
- Involuntary movements
- IQ between 34 and 49
- Lack of peer relationships
- Lethargy
- More active than typical
- Neurodevelopmental delay
- Paralysis
- Pins and needles feeling
- Sudden loss of muscle tone
- Tetraparesis
- Torsion dystonia
- Weakness of one side of body
- Abnormal emotional state
- Abnormality of movement
- Absent reflexes
- Aggressive behavior
- Apraxia
- Autism spectrum disorder
- Brain imaging abnormality
- Bulbar signs
- Can't control feelings
- Cerebral white matter hypoplasia
- Communicating hydrocephalus
- Decreased thalamic volume
- Delayed myelination
- Difficulty sleeping
- EEG with generalized slow activity
- EEG with irregular generalized spike and wave complexes
- Focal motor seizure
- Grand mal seizures
- Impulsivity
- Interictal epileptiform activity
- Irritability
- Migraine
- Poor social interactions
- Simple febrile seizure
- Specific learning disability
- Tremor
- Worsening neurological symptoms
- Epileptic encephalopathy
- Seizure affecting one half of brain
- Unsteady walk
- Abnormal pyramidal tract morphology
- Absent speech development
- Cognitive impairment
- Degeneration of cerebrum
- Epileptic spasm
- Inability to walk
- Paroxysmal dystonia
- Paroxysmal lethargy
Abnormality of the digestive system
- Jaundice
- Abnormality of the gastrointestinal tract
- Gastrointestinal dysmotility
- Abdominal bloating
- Anorexia
- Constipation
- Diarrhea
- Oral-pharyngeal dysphagia
Näytä 3 piirrettä lisää
Abnormality of the musculoskeletal system
- Intracerebral periventricular calcifications
- Low muscle tone
- Spasticity and rigidity of muscles
- Involuntary muscle stiffness, contraction, or spasm
- Muscle stiffness
- Spastic paraplegia
- Rigidity
- Shorter than typical length between neck and abdomen
Näytä 1 piirre lisää
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). SLC2A1-geeni: solute carrier family 2 member 1. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/slc2a1
Dante Labs. SLC2A1-geeni: solute carrier family 2 member 1 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/slc2a1
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa