Geeni
PRRT2
proline rich transmembrane protein 2
- HGNC 30500↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000167371↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 112476↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 16p11.2
- Koordinaatit
- Kromosomi 16: 29 812 193–29 815 881 (GRCh38)
- Eksonit
- 4 eksonia 3,7 kb:n alueella
- Proteiini
- 340 aminohappoa
- Periytyminen
- Autosomaalinen dominantti
- Tunnetaan myös nimellä
- FLJ25513, DKFZp547J199, IFITMD1, FICCA, DSPB3, PKC, EKD1
- Aiemmat symbolit
- ICCA, DYT10
- MANE Select -transkripti
- ENST00000358758.12NM_145239.3
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue PRRT2 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja
Dystonia, myotonia, paroksysmaalinen dyskinesia
- PRRT2-liitännäinen paroksysmaalinen liikehäiriöAutosomaalinen dominantti
Lyhyitä tahattomien liikkeiden kohtauksia, joita laukaisee äkillinen liike (paroksysmaalinen kinesigeeninen dyskinesia). Joskus niihin liittyy lapsuusiän kohtauksia. Yleensä hyvin hoitoon vastaa pieniannoksinen epilepsialääke.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 6 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
- Paroksysmaalinen dyskinesiaAutosomaalinen dominantti
Paroksysmaalinen dyskinesia (PD) on harvinainen, osin erilaisista muodoista koostuva liikehäiriöryhmä, jossa esiintyy poikkeavia tahattomia liikkeitä. Ne toistuvat jaksoittain ja kestävät vain lyhyen aikaa. PD:hen kuuluvat paroksysmaalinen kinesigeeninen dyskinesia (PKD), paroksysmaalinen ei-kinesigeeninen dyskinesia (PNKD), paroksysmaalinen rasituksen aiheuttama dyskinesia (PED) sekä PKD:n muunnelmamuoto, lapsuusiän kouristukset ja korea-atetoosi (ICCA-oireyhtymä).
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 4 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
- Perinnöllinen dystonia
Yleisnimitys perinnöllisille dystonioille, mukaan lukien DYT-TOR1A-varhaisalkuinen yleistynyt dystonia, DYT-THAP1, myoklonus-dystonia (SGCE) ja KMT2B-liitännäinen dystonia.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 4 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Laajemmat ryhmät
Epilepsia (laaja paneeli)
- Epilepsia
Yksi 171 siihen liittyvästä geenistä
Aivosairaus, jolle on tyypillistä hermosolujen epänormaalin voimakkaan purkautumisen aiheuttamat jaksot. Ne aiheuttavat ohimeneviä aistihermoston tai motoriikan neurologisia toimintahäiriöitä tai psyykkisiä toimintahäiriöitä. Jaksoihin voi liittyä tajunnan menetys tai kouristuksia, mutta näin ei aina ole.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 4 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Periytyminen
- Autosomaalinen dominantti
- Yksi muuttunut kopio kummalta vanhemmalta tahansa riittää. Vanhempi, jolla on yksi, siirtää sen kullekin lapselleen todennäköisyydellä yksi kahdesta.
PRRT2-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 2,5 kb geenin 3,7 kb:stä; 1 023 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä PRRT2
114
PRRT2-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 3,7 kb geenistä PRRT2, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 2,5 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- SLC2A1solute carrier family 2 member 1Yhteisiä sairauksia: 3
- ATP1A3ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 3Yhteisiä sairauksia: 2
- KCNJ10potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 10Yhteisiä sairauksia: 2
- PNKDPNKD metallo-beta-lactamase domain containingYhteisiä sairauksia: 2
- PNKPpolynucleotide kinase 3'-phosphataseYhteisiä sairauksia: 2
- TMEM151Atransmembrane protein 151AYhteisiä sairauksia: 2
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Yhteinen sairaus: 1
- ABAT4-aminobutyrate aminotransferaseYhteinen sairaus: 1
- ACTBactin betaYhteinen sairaus: 1
- ACTL6Bactin like 6BYhteinen sairaus: 1
- ADAM22ADAM metallopeptidase domain 22Yhteinen sairaus: 1
- ALDH7A1aldehyde dehydrogenase 7 family member A1Yhteinen sairaus: 1
Geeniin PRRT2 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita PRRT2 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the nervous system
- Paroxysmal dystonia
- Abnormal speech pattern
- Chorea
- Choreoathetosis
- Disorder of involuntary muscle movements
- Dystonia
- EEG abnormality
- Focal motor seizure
Näytä 82 piirrettä lisää
- Focal sensory seizure
- Generalized-onset seizure
- Involuntary movements
- Involuntary writhing movements in fingers, hands, toes, and feet
- Migraine with aura
- Neonatal seizure
- Normal interictal EEG
- Paroxysmal dyskinesia
- Balance impairment
- Bilateral tonic-clonic seizure with focal onset
- Brief seizures with staring spells
- Complex febrile seizure
- Confusion
- CSF lymphocytic pleiocytosis
- CSF pleocytosis
- Difficulty articulating speech
- Dissociated sensory loss
- Epilepsy
- Febrile seizure (within the age range of 3 months to 6 years)
- Focal clonic seizure
- Focal impaired awareness autonomic seizure
- Focal impaired awareness seizure
- Focal manual automatism seizure
- Focal pedal automatism seizure
- Focal tonic seizure
- Generalized clonic seizure
- Generalized tonic seizure
- Grand mal seizures
- Hyperactive deep tendon reflexes
- Hyperactive movements
- Intellectual disability
- Paroxysmal choreoathetosis
- Pins and needles feeling
- Progressive gait ataxia
- Seizure affecting one half of brain
- Torsion dystonia
- Weakness of one side of body
- Aggressive behavior
- Alien limb phenomenon
- Ataxia
- Atypical absence status epilepticus
- Cognitive impairment
- Coma
- Cortical dysplasia
- Decreased vigilance
- Degeneration of cerebellum
- Difficulty finding words
- EEG with generalized sharp slow waves
- EEG with spike-wave complexes
- Experiential epileptic aura
- Eyelid myoclonia seizure
- Focal head nodding automatism seizure
- Generalized cerebral degeneration/underdevelopment
- Generalized myoclonic seizure
- Impaired temperature sensation
- Incoordination
- Infantile spasms
- Irritability
- Language impairment
- Limb myoclonus
- Loss of developmental milestones
- Migraine
- Neonatal electro-clinical seizure with behavior arrest
- Paralysis on one side of body
- Poor fine motor coordination
- Specific learning disability
- Spontaneous pain sensation
- Sudden loss of muscle tone
- Writer's cramp
- Anxiety
- Autism spectrum disorder
- EEG with focal sharp waves
- Intellectual disability, mild
- Interictal epileptiform activity
- Obsessive-compulsive trait
- Repeated seizures without recovery between them
- Simple febrile seizure
- Slow movements
- Tremor
- Brain imaging abnormality
- Orofacial dyskinesia
- Psychomotor deterioration
Abnormality of the eye
- Blind spot
- Double vision
- Metamorphopsia
- Photopsia
- Gaze-evoked horizontal nystagmus
- Seesaw nystagmus
- Staring gaze
- Vertical nystagmus
Näytä 1 piirre lisää
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). PRRT2-geeni: proline rich transmembrane protein 2. Haettu 16. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/prrt2
Dante Labs. PRRT2-geeni: proline rich transmembrane protein 2 [Internet]. [viitattu 16. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/prrt2
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa