Geen
SLC2A1
solute carrier family 2 member 1
- HGNC 11005↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000117394↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 6513↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 1p34.2
- Koordinaadid
- Kromosoom 1: 42 925 353–42 958 868 (GRCh38)
- Eksonid
- 10 eksonit, ulatus 33,5 kb
- Valk
- 492 aminohapet
- Pärilikkus
- Autosoomne dominantne
- Tuntud ka kui
- DYT18, DYT9, GLUT-1
- Varasemad tähised
- GLUT1, GLUT, HTLVR, CSE
- MANE Select transkript
- ENST00000426263.10NM_006516.4
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
VõrdlusgenoomGRCh38hg38
Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.
Loe SLC2A1 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanded
Distoonia, müotoonia, paroksüsmaalne düskineesia
- Paroksüsmaalne düskineesiaAutosoomne dominantne
Paroksüsmaalne düskineesia (PD) on harv heterogeenne liikumishäirete rühm, mis avaldub ebanormaalsete tahtmatute liigutustena, mis kordused episoodiliselt ja kestavad vaid lühikest aega. PD hõlmab paroksüsmaalset kinesigeenset düskineesiat (PKD), paroksüsmaalset mittekinesigeenset düskineesiat (PNKD), paroksüsmaalset koormusest põhjustatud düskineesiat (PED) ning PKD varianti, imikueas esinevat krambi- ja khoreoatetoosi sündroomi (ICCA sündroom).
- 1 GenCC-i esitaja hindab seda kindlaks või tugevaks
- Pärilik düstoonia
Üldmõiste, mis hõlmab pärilikke düstooniaid, sealhulgas DYT-TOR1A varajase algusega generaliseerunud düstooniat, DYT-THAP1-d, müokloonus-düstooniat (SGCE) ja KMT2B-seotud düstooniat.
- 2 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Laiemad rühmad
Epilepsia (täielik paneel)
- Epilepsia
Üks 171 sellega seotud geenist
Ajuhaigus, mida iseloomustavad ebanormaalselt suurenenud neuronite aktiivsuse episoodid, mis põhjustavad ajutisi sensoorse või motoorse neuroloogilise talitlushäire või psüühilise talitlushäire episoode. Need episoodid võivad olla seotud teadvuse kaotuse või krampidega, aga ei pruugi.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 5 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Pärandumine
- Autosoomne dominantne
- Üks muudetud koopia kumbast vanemast tahes on piisav. Vanem, kellel see on, annab selle edasi igale lapsele kahe võimalusest ühe tõenäosusega.
Kuidas SLC2A1 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 3,4 kb kogupikkusega 33,5 kb; neist 1479 alust kodeerivad valku.
Kuidas genoomitest loetakse SLC2A1
131
kohad geenis SLC2A1, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.
Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni SLC2A1 33,5 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (3,4 kb).
Samade haigustega seotud geenid
- PRRT2proline rich transmembrane protein 2Jagab 3 haigust
- ATP1A3ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 3Jagab 2 haigust
- KCNJ10potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 10Jagab 2 haigust
- PNKDPNKD metallo-beta-lactamase domain containingJagab 2 haigust
- PNKPpolynucleotide kinase 3'-phosphataseJagab 2 haigust
- TMEM151Atransmembrane protein 151AJagab 2 haigust
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Jagab 1 haigust
- ABAT4-aminobutyrate aminotransferaseJagab 1 haigust
- ACTBactin betaJagab 1 haigust
- ACTL6Bactin like 6BJagab 1 haigust
- ADAM22ADAM metallopeptidase domain 22Jagab 1 haigust
- ALDH7A1aldehyde dehydrogenase 7 family member A1Jagab 1 haigust
Geeniga SLC2A1 seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida SLC2A1 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of the nervous system
- Convulsive status epilepticus
- Delayed CNS myelination
- Delayed speech and language development
- Difficulty articulating speech
- Disorder of involuntary muscle movements
- Epilepsy
- Inability to coordinate movements when walking
- Intellectual disability
Näita veel 82 tunnust
- Interictal EEG abnormality
- Jerking
- Slurred speech
- Ataxia
- Choreoathetosis
- Dystonia
- EEG abnormality
- EEG with focal spike waves
- Encephalopathy
- Episodic hemiplegia
- Generalized myoclonic-atonic seizure
- Global developmental delay
- Paroxysmal dyskinesia
- Repeated seizures without recovery between them
- Abnormal autonomic nervous system physiology
- Abnormal pyramidal sign
- Attention deficit
- Behavioral abnormality
- Bilateral tonic-clonic seizure with generalized onset
- Brief seizures with staring spells
- Chorea
- Confusion
- EEG with polyspike wave complexes
- Episodic ataxia
- Extrapyramidal dyskinesia
- Generalized hyperreflexia
- Generalized myoclonic seizure
- Headache
- Hyperactive deep tendon reflexes
- Increased reflexes
- Intellectual disability, mild
- Intellectual disability, severe
- Involuntary movements
- IQ between 34 and 49
- Lack of peer relationships
- Lethargy
- More active than typical
- Neurodevelopmental delay
- Paralysis
- Pins and needles feeling
- Sudden loss of muscle tone
- Tetraparesis
- Torsion dystonia
- Weakness of one side of body
- Abnormal emotional state
- Abnormality of movement
- Absent reflexes
- Aggressive behavior
- Apraxia
- Autism spectrum disorder
- Brain imaging abnormality
- Bulbar signs
- Can't control feelings
- Cerebral white matter hypoplasia
- Communicating hydrocephalus
- Decreased thalamic volume
- Delayed myelination
- Difficulty sleeping
- EEG with generalized slow activity
- EEG with irregular generalized spike and wave complexes
- Focal motor seizure
- Grand mal seizures
- Impulsivity
- Interictal epileptiform activity
- Irritability
- Migraine
- Poor social interactions
- Simple febrile seizure
- Specific learning disability
- Tremor
- Worsening neurological symptoms
- Epileptic encephalopathy
- Seizure affecting one half of brain
- Unsteady walk
- Abnormal pyramidal tract morphology
- Absent speech development
- Cognitive impairment
- Degeneration of cerebrum
- Epileptic spasm
- Inability to walk
- Paroxysmal dystonia
- Paroxysmal lethargy
Abnormality of the digestive system
- Jaundice
- Abnormality of the gastrointestinal tract
- Gastrointestinal dysmotility
- Abdominal bloating
- Anorexia
- Constipation
- Diarrhea
- Oral-pharyngeal dysphagia
Näita veel 3 tunnust
Abnormality of the musculoskeletal system
- Intracerebral periventricular calcifications
- Low muscle tone
- Spasticity and rigidity of muscles
- Involuntary muscle stiffness, contraction, or spasm
- Muscle stiffness
- Spastic paraplegia
- Rigidity
- Shorter than typical length between neck and abdomen
Näita veel 1 tunnus
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). SLC2A1 geen: solute carrier family 2 member 1. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/slc2a1
Dante Labs. SLC2A1 geen: solute carrier family 2 member 1 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/slc2a1
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast