Geeni
IFT172
intraflagellar transport 172
- HGNC 30391↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000138002↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 26160↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 2p23.3
- Koordinaatit
- Kromosomi 2: 27 444 377–27 489 743 (GRCh38)
- Eksonit
- 48 eksonia 45,4 kb:n alueella
- Proteiini
- 1 749 aminohappoa
- Periytyminen
- Autosomaalinen resessiivinen
- Tunnetaan myös nimellä
- SLB, wim, osm-1, NPHP17, BBS20
- MANE Select -transkripti
- ENST00000260570.8NM_015662.3
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue IFT172 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja
Bardet-Biedlin ja Alströmin oireyhtymät
- Bardet-Biedlin oireyhtymäAutosomaalinen resessiivinen
Resessiivisesti periytyvä siliopatia, jonka aiheuttavat variantit yli 20 geenissä (yleisimmin BBS1 ja BBS10). Se aiheuttaa verkkokalvon dystrofiaa, lihavuutta, ylimääräisiä sormia tai varpaita, munuaispoikkeavuuksia ja oppimisvaikeuksia.
- 1 GenCC-arvioija arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
Diagnoosi mahdollistaa silmien, munuaisten ja diabeteksen seurannan. Setmelanotidi on Bardet-Biedlin oireyhtymään liittyvän lihavuuden hyväksytty hoito.
Laajemmat ryhmät
Retinitis pigmentosa
Yksi 77 siihen liittyvästä geenistä
Perinnöllisten verkkokalvon dystrofioiden ryhmä, jossa sauvasolut ja sitten tappisolut menettävät asteittain toimintakykynsä. Tästä seuraa yösokeutta ja hitaasti etenevä reunanäön heikkeneminen.
- 1 GenCC-arvioija arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Periytyminen
- Autosomaalinen resessiivinen
- Tarvitaan muuttunut kopio kummaltakin vanhemmalta. Yhdellä olet kantaja ja yleensä oireeton. Kun molemmat vanhemmat ovat kantajia, kullakin lapsella on yksi neljästä mahdollisuudesta periä kaksi muuttunutta kopiota.
IFT172-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 5,4 kb geenin 45,4 kb:stä; 5 250 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä IFT172
135
IFT172-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 45,4 kb geenistä IFT172, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 5,4 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- ARL6ARF like GTPase 6Yhteisiä sairauksia: 2
- BBS2Bardet-Biedl syndrome 2Yhteisiä sairauksia: 2
- CFAP418cilia and flagella associated protein 418Yhteisiä sairauksia: 2
- TTC8tetratricopeptide repeat domain 8Yhteisiä sairauksia: 2
- ABCA4ATP binding cassette subfamily A member 4Yhteinen sairaus: 1
- AGBL5AGBL carboxypeptidase 5Yhteinen sairaus: 1
- AHRaryl hydrocarbon receptorYhteinen sairaus: 1
- ARHGEF18Rho/Rac guanine nucleotide exchange factor 18Yhteinen sairaus: 1
- ARL2BPARF like GTPase 2 binding proteinYhteinen sairaus: 1
- ARL3ARF like GTPase 3Yhteinen sairaus: 1
- BBIP1BBSome interacting protein 1Yhteinen sairaus: 1
- BBS1Bardet-Biedl syndrome 1Yhteinen sairaus: 1
Geeniin IFT172 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita IFT172 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the eye
- Astigmatism
- Breakdown of light-sensitive cells in back of eye
- Difficulties with night vision
- Farsightedness
- Limited peripheral vision
- Optic disc drusen
- Optic disc pallor
- Papilledema
Näytä 31 piirrettä lisää
- Perifoveal ring of hyperautofluorescence
- Abnormal electroretinogram
- Abnormal retinal pigmentation
- Blindness
- Cone/cone-rod dystrophy
- Extreme sensitivity of the eyes to light
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Optic atrophy
- Progressive night blindness
- Retina degeneration
- Spicular pigmentation of the retina
- Visual impairment
- Abnormal central response of multifocal electroretinogram
- Abnormal color vision
- Abnormal full-field electroretinogram
- Bulging cornea
- Cystoid macular edema
- Day blindness
- Decreased clarity of vision
- Eye muscle paralysis
- Glaucoma
- Loss of peripheral vision
- Photoreceptor outer segment loss on macular OCT
- Posterior subcapsular cataract
- Retinal atrophy
- Rod-cone dystrophy
- Clouding of the lens of the eye
- Cross-eyed
- Oculomotor apraxia
- Photopsia
- Wide-set eyes
Abnormality of the digestive system
- Pancreatic inflammation
- Abnormality of the gastrointestinal tract
- Abnormality of the liver
- Feeding difficulties in infancy
- Hepatic fibrosis
- Celiac disease
- Enlarged colon lacking nerve cells
- Inflammation of the large intestine
Näytä 3 piirrettä lisää
Abnormality of the cardiovascular system
- An opening in the wall separating the top two chambers of the heart
- Narrowing of blood vessels in back of eye
- Retinal vascular tortuosity
- Abnormality of retina blood vessels
- High blood pressure
- Abnormality of the heart
- Hole in heart wall separating two lower heart chambers
- Disease of the heart muscle
Näytä 1 piirre lisää
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). IFT172-geeni: intraflagellar transport 172. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/ift172
Dante Labs. IFT172-geeni: intraflagellar transport 172 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/ift172
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa