Geeni
ABCA4
ATP binding cassette subfamily A member 4
- HGNC 34↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000198691↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 24↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 1p22.1
- Koordinaatit
- Kromosomi 1: 93 992 834–94 121 148 (GRCh38)
- Eksonit
- 50 eksonia 128,3 kb:n alueella
- Proteiini
- 2 273 aminohappoa
- Periytyminen
- Autosomaalinen resessiivinen
- Tunnetaan myös nimellä
- FFM, ARMD2, CORD3
- Aiemmat symbolit
- STGD1, ABCR, RP19, STGD
- MANE Select -transkripti
- ENST00000370225.4NM_000350.3
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue ABCA4 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja
Stargardtin tauti
- ABCA4-liittyvä retinopatiaAutosomaalinen resessiivinen
Verkkokalvon dystrofia, joka johtuu ABCA4-geenin molemmissa kopioissa olevista muutoksista. ABCA4-geenin muutokset ovat yleisin Stargardtin taudin aiheuttaja, ja ne voivat aiheuttaa myös kartio-sauvasolu-dystrofian.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 6 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Perinnöllinen maculadystrofia, joka liittyy useimmiten ABCA4-geeniin. Siihen liittyy lipofuskiinin kertymistä ja keskinäön asteittaista heikkenemistä.
- 3 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Laajemmat ryhmät
Retinitis pigmentosa
Yksi 77 siihen liittyvästä geenistä
Perinnöllisten verkkokalvon dystrofioiden ryhmä, jossa sauvasolut ja sitten tappisolut menettävät asteittain toimintakykynsä. Tästä seuraa yösokeutta ja hitaasti etenevä reunanäön heikkeneminen.
- 1 GenCC-arvioija arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Periytyminen
- Autosomaalinen resessiivinen
- Tarvitaan muuttunut kopio kummaltakin vanhemmalta. Yhdellä olet kantaja ja yleensä oireeton. Kun molemmat vanhemmat ovat kantajia, kullakin lapsella on yksi neljästä mahdollisuudesta periä kaksi muuttunutta kopiota.
ABCA4-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
- Variantit, joilla on sivu
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 7,3 kb geenin 128,3 kb:stä; 6 822 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä ABCA4
664
ABCA4-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 128,3 kb geenistä ABCA4, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 7,3 kb eksoneja.
Variantit, joilla on sivu (107)
Tässä ovat ABCA4-variantit, joilla on sivu, eniten arvostelutähtiä saaneet ensin. Jokainen sivu kuvaa ClinVarin julkista tietuetta variantista, ei koskaan tulosta.
| Variantti | HGVS c. | Eksoni tai introni | Sijainti (GRCh38) | ClinVar-luokitus | Arvioinnin tila |
|---|---|---|---|---|---|
| A960Dfs*17 | c.2879del | Eksoni 19 | 94 046 957 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| A967V | c.2900C>T | Eksoni 19 | 94 046 937 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| A1773V | c.5318C>T | Eksoni 38 | 94 014 685 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| A1791Gfs*9 | c.5371dup | Eksoni 38 | 94 014 631 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| c.1A>G | Eksoni 1 | 94 121 045 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima | |
| c.3G>T | Eksoni 1 | 94 121 043 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima | |
| c.1937+1G>A | Introni 13 | 94 062 576 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima | |
| c.3328+2T>A | Introni 22 | 94 042 759 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima | |
| c.3523-1G>A | Introni 23 | 94 040 128 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima | |
| c.4253+43G>A | Introni 28 | 94 030 953 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- AGBL5AGBL carboxypeptidase 5Yhteinen sairaus: 1
- AHRaryl hydrocarbon receptorYhteinen sairaus: 1
- ARHGEF18Rho/Rac guanine nucleotide exchange factor 18Yhteinen sairaus: 1
- ARL2BPARF like GTPase 2 binding proteinYhteinen sairaus: 1
- ARL3ARF like GTPase 3Yhteinen sairaus: 1
- ARL6ARF like GTPase 6Yhteinen sairaus: 1
- BBS2Bardet-Biedl syndrome 2Yhteinen sairaus: 1
- BEST1bestrophin 1Yhteinen sairaus: 1
- CA4carbonic anhydrase 4Yhteinen sairaus: 1
- CC2D2Acoiled-coil and C2 domain containing 2AYhteinen sairaus: 1
- CDHR1cadherin related family member 1Yhteinen sairaus: 1
- CERKLCERK like autophagy regulatorYhteinen sairaus: 1
Geeniin ABCA4 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita ABCA4 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the eye
- Abnormal color vision
- Cross-eyed
- Decreased clarity of vision
- Abnormal choroid morphology
- Abnormal electroretinogram
- Abnormal foveal morphology
- Abnormal macular pigmentation
- Abnormal retinal pigmentation
Näytä 46 piirrettä lisää
- Abnormality of visual evoked potentials
- Blind spot located at fixation point
- Blindness
- Difficulties with night vision
- Extreme sensitivity of the eyes to light
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Macular degeneration
- Optic atrophy
- Paroxysmal involuntary eye movements
- Progressive night blindness
- Retina degeneration
- Retinal pigment epithelial atrophy
- Retinal pigment epithelial mottling
- Retinal thinning
- Spicular pigmentation of the retina
- Visual impairment
- Abnormal amplitude of light-adapted flicker electroretinogram
- Abnormal central response of multifocal electroretinogram
- Abnormal full-field electroretinogram
- Aplasia/Hypoplasia of the macula
- Bulging cornea
- Bull's eye maculopathy
- Color blindness
- Cystoid macular edema
- Dark choroid
- Eye muscle paralysis
- Glaucoma
- Loss of peripheral vision
- Optic disc drusen
- Optic disc pallor
- Photopsia
- Photoreceptor outer segment loss on macular OCT
- Posterior subcapsular cataract
- Progressive loss of vision
- Retinal atrophy
- Undetectable electroretinogram
- Yellow/white macular lesion
- Abnormal amplitude of light-adapted single flash electroretinogram
- Metamorphopsia
- Cone/cone-rod dystrophy
- ERG: Reduced dark-adapted b-wave amplitude
- Limited peripheral vision
- Pigmentary retinopathy
- Retinal flecks
- Rod-cone dystrophy
- Visual loss
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). ABCA4-geeni: ATP binding cassette subfamily A member 4. Haettu 16. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/abca4
Dante Labs. ABCA4-geeni: ATP binding cassette subfamily A member 4 [Internet]. [viitattu 16. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/abca4
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa