Gen
SQSTM1
sequestosome 1
- HGNC 11280↗(åbnes i en ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000161011↗(åbnes i en ny fane)
- NCBI Gene 8878↗(åbnes i en ny fane)
Oversigt
- Cytogenetisk placering
- 5q35.3
- Koordinater
- Kromosom 5: 179.820.905–179.838.078 (GRCh38)
- Exoner
- 8 exoner fordelt over 17,2 kb
- Protein
- 440 aminosyrer
- Også kendt som
- p62, p60, p62B, A170
- Tidligere symboler
- PDB3, OSIL
- MANE Select-transkript
- ENST00000389805.9NM_003900.5
- Lokustype
- Protein-coding
- Meget høj
- Sikker
- Lav
- Meget lav
This page as data
Add .json to the page's address, or ask for application/json, to read it as JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/sqstm1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLæs SQSTM1 og resten af dit genom med én test.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger
Bestil min Genome TestKurerede rapporter relevant for dette gen
Amyotrofisk lateral sklerose (ALS)
- Amyotrofisk lateral sklerose
En neurodegenerativ sygdom i de øvre og nedre motoriske neuroner, som forekommer i sporadiske og familiære former.
- ClinGen vurderer forbindelsen som moderat
- 2 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
▶Handlingsrelevans
Tofersen (Qalsody, FDA 2023) til SOD1-ALS; ASO-forsøg for C9orf72 og FUS; riluzol; edaravon; AMX0035 (natriumphenylbutyrat-tauroursodiol); tværfaglig ALS-klinik; respiratorisk støtte; genetisk rådgivning til familiemedlemmer
Familiær Pagets sygdom i knoglerne
- Pagets sygdom i knoglerne (SQSTM1-relateret)Autosomal dominant
Pagets sygdom i knoglerne med debut i voksenalderen, forårsaget af SQSTM1-varianter, den hyppigste genetiske årsag til familiær Pagets sygdom.
- 2 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
▶Handlingsrelevans
Pagets sygdom reagerer typisk godt på behandling med bisphosphonater, og slægtninge kan undersøges for tidlige tegn.
Frontotemporal demens
- Autosomal dominant
Frontotemporal demens (FTD) omfatter en gruppe neurodegenerative sygdomme, der kendetegnes ved progressive ændringer i adfærd, nedsat exekutiv funktion og sprogforstyrrelser som følge af degeneration af den mediale præfrontale og frontoinsulære cortex. Der er identificeret fire kliniske undertyper: semantisk demens, progressiv non-fluent afasi, adfærdsvariant FTD og højresidig temporal lobær atrofi.
- ClinGen vurderer forbindelsen som moderat
- 2 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
- Frontotemporal demens og/eller amyotrofisk lateral skleroseAutosomal dominant
Samlebetegnelse for det genetiske spektrum af frontotemporal demens og ALS, herunder former forårsaget af C9orf72, TBK1, VCP, SQSTM1 og andre gener.
- ClinGen vurderer forbindelsen som moderat
- 2 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
Sådan er SQSTM1 opbygget
- Kodende sekvens
- Utranslateret region
- Intron
- Transkriptionsretning
- Kendte sygdomsfremkaldende steder
- Regioner, som korte læsninger har svært ved
Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.
Eksoner udgør 2,8 kb af genets 17,2 kb; 1.323 af disse baser koder for proteinet.
Sekventering af SQSTM1
53
positioner i SQSTM1, hvor ClinVar klassificerer en ændring som patogen eller sandsynligvis patogen
Ingen af dem ligger i en region, som korte læsninger har svært ved at dække.
En helgenomsanalyse dækker alle 17,2 kb af SQSTM1, inklusive introner, og ikke kun de 2,8 kb eksoner.
Gener knyttet til de samme sygdomme
- CHMP2Bcharged multivesicular body protein 2BDeler 3 sygdomme
- VCPvalosin containing proteinDeler 3 sygdomme
- C9orf72C9orf72-SMCR8 complex subunitDeler 2 sygdomme
- CCNFcyclin FDeler 2 sygdomme
- CHCHD10coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 10Deler 2 sygdomme
- CYLDCYLD lysine 63 deubiquitinaseDeler 2 sygdomme
- GRNgranulin precursorDeler 2 sygdomme
- HNRNPA1heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1Deler 2 sygdomme
- TBK1TANK binding kinase 1Deler 2 sygdomme
- ALS2alsin Rho guanine nucleotide exchange factor ALS2Deler 1 sygdom
- ANGangiogeninDeler 1 sygdom
- ANXA11annexin A11Deler 1 sygdom
Træk knyttet til SQSTM1
Human Phenotype Ontology angiver disse som kendetegn ved de sjældne tilstande, SQSTM1 kan forårsage. Hvert træks side viser de andre gener, der er knyttet til det.
Abnormality of the nervous system
- Ataxia
- Cognitive impairment
- Difficulty articulating speech
- Lou Gehrig's disease
- Abnormal lower motor neuron morphology
- Abnormal shape of upper motor neuron
- Aggressive behavior
- Behavioral abnormality
Vis 72 træk mere
- Difficulty finding words
- Difficulty making arithmetical calculations
- Disinhibition
- Dysgraphia
- Echoing another person's speech
- Emotional poverty
- Frontotemporal cerebral atrophy
- Frontotemporal dementia
- Hyperorality
- Inappropriate behavior
- Irritability
- Lack of insight
- Loss of speech
- Memory impairment
- Mental deterioration
- Motor neuron atrophy
- Ongoing loss of nerve cells
- Perseverative thought
- Personality changes
- Poor speech
- Reading disability
- Repetitive movements
- Restlessness
- Restrictive behavior
- Abnormal brain FDG positron emission tomography
- Abnormal cerebral white matter morphology
- Abnormal gait
- Abnormality of extrapyramidal motor function
- Anxiety
- Apraxia
- Babinski sign
- Can't control feelings
- Clumsiness
- Compulsive hoarding
- Degeneration of cerebellum
- Degeneration of the lateral corticospinal tracts
- Depression
- Disorder of involuntary muscle movements
- Dystonia
- EEG with continuous slow activity
- Gliosis
- Hallucinations
- High stepping
- Hoffmann sign
- Increased reflexes
- Lack of feeling, emotion, interest
- Muscle twitch
- Neuronal loss in the cerebral cortex
- Paralysis
- Parkinsonism
- Partial paralysis of legs
- Progressive cerebellar ataxia
- Tetraparesis
- Weakness due to upper motor neuron dysfunction
- Abnormal pyramidal sign
- Abulia
- Astrocytosis
- Decreased reflex response
- Difficulty sleeping
- Generalized brain degeneration
- Grand mal seizures
- Inability to speak
- Jaw hyperreflexia
- Language impairment
- Psychosis
- Tremor
- Upper motor neuron dysfunction
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Difficulty performing quick and alternating movements
- Inability to coordinate movements when walking
- Lack of coordination of movement
- Limb ataxia
Abnormality of the musculoskeletal system
- EMG: myopathic abnormalities
- Internally nucleated skeletal muscle fibers
- Generalized muscle weakness
- Muscle tissue disease
- Diffuse skeletal muscle wasting
- Distal muscle wasting
- Fatigable weakness of bulbar muscles
- Fatigable weakness of respiratory muscles
Vis 18 træk mere
- Fatigable weakness of swallowing muscles
- Involuntary muscle stiffness, contraction, or spasm
- Muscle degeneration
- Muscle spasm
- Progressive distal muscular atrophy
- Proximal neurogenic muscle weakness
- Rimmed vacuoles
- Weakness of outermost muscles
- Bulbar palsy
- Spastic paraparesis
- Bone cell cancer
- Bone pain
- Breakdown of bone
- Increased variability in muscle fiber diameter
- Muscle weakness
- Recurrent long bone fractures
- Uneven increase in bone density
- Z-band streaming
Abnormality of limbs
- Foot drop
- Distal upper limb muscle weakness
- Intrinsic hand muscle atrophy
- Weakness of long finger extensor muscles
- Decreased arm strength
- Distal upper limb amyotrophy
- Lower limb muscle weakness
- Winged shoulder blade
Vis 1 træk mere
Eksterne links
Genposter
Transkript
Protein
Hvor oplysningerne kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
- GenCC og ClinGen, udgivet 2026-10-16: hvilke sygdomme genet er knyttet til, og hvor stærkt.
- ACMG-listen over sekundære fund, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifikationerne: kendte sygdomsfremkaldende positioner og de regioner, som korte læsninger har svært ved at aflæse.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: de træk, der er knyttet til genet. Læs mere på hpo.jax.org.
- Dataudgivelse 2026.10.16-c6eea6bf.
Citér denne side
Dante Labs. (u.d.). SQSTM1-genet: sequestosome 1. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/sqstm1
Dante Labs. SQSTM1-genet: sequestosome 1 [Internet]. [citeret 17. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/sqstm1
Én test. Svar for hele livet.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger