Gen
COL6A1
collagen type VI alpha 1 chain
- HGNC 2211↗(otwiera się w nowej karcie)
- Gen Ensembl ENSG00000142156↗(otwiera się w nowej karcie)
- NCBI Gene 1291↗(otwiera się w nowej karcie)
Podsumowanie
- Lokalizacja cytogenetyczna
- 21q22.3
- Współrzędne
- Chromosom 21: 45 981 770–46 005 048 (GRCh38)
- Eksony
- 35 eksonów na odcinku 23,3 kb
- Białko
- 1028 aminokwasów
- Transkrypt MANE Select
- ENST00000361866.8NM_001848.3
- Typ locus
- gene with protein product
- Bardzo wysoka
- Pewna
- Niska
- Bardzo niska
Genom referencyjnyGRCh38hg38
Pozycje na stronach genów i wariantów zależą od tego wyboru, w tej przeglądarce.
Odczytaj COL6A1 oraz resztę swojego genomu dzięki jednemu badaniu.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
Zamawiam Genome TestWyselekcjonowane raporty dotyczące tego genu
Wrodzone dystrofie mięśniowe
- Miopatia związana z kolagenem VI
Spektrum chorób mięśni wywołanych wariantami COL6A1, COL6A2 lub COL6A3, od ciężkiej wrodzonej dystrofii mięśniowej Ullricha po łagodniejszą miopatię Bethlema, z osłabieniem i przykurczami stawów.
- ClinGen ocenia związek jako: definitywne
- 4 podmiotów GenCC ocenia go jako definitywny lub silny
- Wrodzona dystrofia mięśniowa
Grupa dystrofii mięśniowych ujawniających się przy urodzeniu lub w niemowlęctwie, w tym dystroglikanopatie (takie jak postacie związane z FKRP, FKTN i POMT1/2).
- 3 podmiotów GenCC ocenia go jako definitywny lub silny
Dystrofia mięśniowa kończynowo-obręczowa
Dystrofia mięśniowa kończynowo-obręczowa jest określeniem obejmującym liczne podtypy o różnych wzorcach dziedziczenia (a także różnej wystarczalności diagnostycznej). Osoby, u których wykryto warianty związane z tym schorzeniem, powinny zasięgnąć porady specjalisty chorób mięśniowo-szkieletowych w celu postawienia ostatecznej diagnozy.
- 3 podmiotów GenCC ocenia go jako definitywny lub silny
Budowa genu COL6A1
- Sekwencja kodująca
- Region nieulegający translacji
- Intron
- Kierunek transkrypcji
- Znane miejsca powodujące choroby
- Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.
Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.
Eksony stanowią 4,2 kb z 23,3 kb genu; 3087 z tych zasad kodują białko.
Jak test genomu odczytuje COL6A1
138
pozycje w COL6A1, w których ClinVar klasyfikuje zmianę jako patogenną lub prawdopodobnie patogenną
Żadne z nich nie przypada na region, który krótkie odczyty trudno odczytać.
Pełne sekwencjonowanie genomu obejmuje wszystkie 23,3 kb genu COL6A1, łącznie z intronami, a nie tylko 4,2 kb eksonów.
Geny powiązane z tymi samymi schorzeniami
- COL6A2collagen type VI alpha 2 chainWspólnych schorzeń: 3
- COL6A3collagen type VI alpha 3 chainWspólnych schorzeń: 3
- DAG1dystroglycan 1Wspólnych schorzeń: 2
- FKRPfukutin related proteinWspólnych schorzeń: 2
- FKTNfukutinWspólnych schorzeń: 2
- GMPPBGDP-mannose pyrophosphorylase BWspólnych schorzeń: 2
- LAMA2laminin subunit alpha 2Wspólnych schorzeń: 2
- POMGNT1protein O-linked mannose N-acetylglucosaminyltransferase 1 (beta 1,2-)Wspólnych schorzeń: 2
- SNUPNsnurportin 1Wspólnych schorzeń: 2
- ANO5anoctamin 5Wspólne schorzenie: 1
- B3GALNT2beta-1,3-N-acetylgalactosaminyltransferase 2Wspólne schorzenie: 1
- B4GAT1beta-1,4-glucuronyltransferase 1Wspólne schorzenie: 1
Cechy powiązane z genem COL6A1
Human Phenotype Ontology wymienia te cechy jako objawy rzadkich schorzeń, które może wywoływać COL6A1. Na stronie każdej cechy znajdują się inne geny z nią powiązane.
Abnormality of the musculoskeletal system
- Axial muscle weakness
- Centrally nucleated skeletal muscle fibers
- Difficulty walking up stairs
- Distal lower limb amyotrophy
- Double-Jointed
- Elbow contracture
- EMG: myopathic abnormalities
- Fatty replacement of skeletal muscle
Pokaż jeszcze 34 cech
- Fiber type grouping
- Muscle fiber necrosis
- Neck muscle weakness
- Proximal neurogenic muscle weakness
- Reduced spine movement
- Abnormal muscle fiber morphology
- Flexed joint that cannot be straightened
- Generalized muscle weakness
- Hunched back
- Increased endomysial connective tissue
- Increased variability in muscle fiber diameter
- Increased wrist mobility
- Muscle weakness
- Muscular dystrophy
- Progressive proximal muscle weakness
- Reduced muscle collagen VI
- Scoliosis
- Difficulty running
- Diffuse skeletal muscle wasting
- Frequent falls
- Generalized decreased muscle tone
- Multiple joint contractures
- Weak diaphragm
- Weakness of outermost muscles
- Excessive inward curvature of lower spine
- Gowers sign
- Reduced maximal expiratory pressure
- Rimmed vacuoles
- Decreased lung function due to weak breathing muscles
- Distal joint hypermobility
- Low muscle tone, in neonatal onset
- Muscle degeneration
- Muscle tissue disease
- Type 1 muscle fiber predominance
Abnormality of limbs
- High-arched foot
- Shoulder girdle muscle wasting
- Increased laxity of fingers
- Ankle contracture
- Ankle flexion contracture
- Elbow flexion contracture
- Finger joint contracture
- Hip dislocation
Pokaż jeszcze 16 cech
- Inability to straighten knee
- Interphalangeal joint contracture of finger
- Inward turned thumb
- Limb-girdle muscle weakness
- Long toe
- Permanent flexion of the finger
- Pes valgus
- Quadriceps weakness
- Slender finger
- Wrist flexion contracture
- Curved toe bone
- Foot drop
- Shortening of the achilles tendon
- Winged shoulder blade
- Ankle hypermobility
- Club feet
Linki zewnętrzne
Rekordy genów
Transkrypt
Białko
Skąd pochodzą te dane
- HGNC: symbol genu, jego nazwa, inne symbole i położenie.
- MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
- GenCC i ClinGen, wydanie 2026-10-16: z jakimi schorzeniami gen jest powiązany i jak silne jest to powiązanie.
- Lista ACMG dotycząca wtórnych wyników, SF v3.2.
- ClinVar i stratyfikacje GIAB: znane miejsca powodujące choroby oraz regiony, które krótkie odczyty trudno odczytać.
- Human Phenotype Ontology, wersja 2026-09-01: cechy powiązane z genem. Więcej informacji znajdą Państwo na hpo.jax.org.
- Wydanie danych 2026.10.16-c6eea6bf.
Cytuj tę stronę
Dante Labs. (b.d.). Gen COL6A1: collagen type VI alpha 1 chain. Pobrano 16 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/col6a1
Dante Labs. Gen COL6A1: collagen type VI alpha 1 chain [Internet]. [cytowano 16 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/col6a1
Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni