Γονίδιο
COL6A1
collagen type VI alpha 1 chain
- HGNC 2211↗(ανοίγει σε νέα καρτέλα)
- Γονίδιο Ensembl ENSG00000142156↗(ανοίγει σε νέα καρτέλα)
- NCBI Gene 1291↗(ανοίγει σε νέα καρτέλα)
Σύνοψη
- Κυτογενετική θέση
- 21q22.3
- Συντεταγμένες
- Χρωμόσωμα 21: 45.981.770–46.005.048 (GRCh38)
- Εξόνια
- 35 έξώνια σε 23,3 kb
- Πρωτεΐνη
- 1.028 αμινοξέα
- Μεταγράφημα MANE Select
- ENST00000361866.8NM_001848.3
- Τύπος locus
- gene with protein product
- Πολύ υψηλή
- Υψηλή
- Χαμηλή
- Πολύ χαμηλή
Γονιδίωμα αναφοράςGRCh38hg38
Οι θέσεις στις σελίδες γονιδίων και παραλλαγών ακολουθούν αυτή την επιλογή, σε αυτό το πρόγραμμα περιήγησης.
Διαβάστε το COL6A1, και το υπόλοιπο γονιδίωμά σας, με μία εξέταση.
Από 449 $Δωρεάν αποστολή · Αποτελέσματα σε 6–8 εβδομάδες
Αποκτήστε το Genome Test σαςΕπιμελημένες αναφορές που σχετίζονται με αυτό το γονίδιο
Συγγενείς μυϊκές δυστροφίες
- Μυοπάθεια που σχετίζεται με το κολλαγόνο VI
Φάσμα μυϊκών διαταραχών που προκαλούνται από παραλλαγές στα COL6A1, COL6A2 ή COL6A3, από σοβαρή συγγενή μυϊκή δυστροφία Ullrich έως ηπιότερη μυοπάθεια Bethlem, με αδυναμία και συσπάσεις των αρθρώσεων.
- Το ClinGen κατατάσσει τη σύνδεση ως οριστική
- 4 υποβολείς GenCC την κατατάσσουν ως οριστική ή ισχυρή
- Συγγενής μυϊκή δυστροφία
Ομάδα μυϊκών δυστροφιών με έναρξη κατά τη γέννηση ή στη βρεφική ηλικία, συμπεριλαμβανομένων των διστρογλυκανοπαθειών (όπως μορφές που σχετίζονται με τα FKRP, FKTN και POMT1/2).
- 3 υποβολείς GenCC την κατατάσσουν ως οριστική ή ισχυρή
Μυοδυστροφία των ζωνών των άκρων
Η μυοδυστροφία των ζωνών των άκρων ορίζεται ως μια ομάδα πολλών υποτύπων με διαφορετικά πρότυπα κληρονομικότητας (ενώ και η διαγνωστική επάρκεια ποικίλλει). Οι φορείς παραλλαγών που σχετίζονται με την πάθηση θα πρέπει να απευθυνθούν σε ειδικό μυοσκελετικών παθήσεων για οριστική διάγνωση.
- 3 υποβολείς GenCC την κατατάσσουν ως οριστική ή ισχυρή
Πώς είναι διαταγμένο το COL6A1
- Κωδικοποιούσα αλληλουχία
- Μη μεταφραζόμενη περιοχή
- Ιντρόνιο
- Κατεύθυνση μεταγραφής
- Γνωστές θέσεις που προκαλούν νόσο
- Περιοχές που τα σύντομα αναγνώσματα βρίσκουν δύσκολες
Εξόνια του μεταγράφηματος MANE Select του γονιδίου (έκδοση v1.5), από τα NCBI και το EMBL-EBI, στο γονιδίωμα αναφοράς GRCh38.
Ζώνες χρωμοσωμάτων από το ιδεόγραμμα GRCh38 του UCSC (2022-10-29).
Γειτονικά γονίδια από την έκδοση 116 του Ensembl, στο GRCh38.
Τα εξόνια αποτελούν 4,2 kb από τα 23,3 kb του γονιδίου· 3.087 από αυτές τις βάσεις κωδικοποιούν την πρωτεΐνη.
Πώς διαβάζει ένα τεστ γονιδιώματος το COL6A1
138
θέσεις στο COL6A1 όπου το ClinVar κατατάσσει μια μεταβολή ως παθογόνο ή πιθανώς παθογόνο
Καμία από αυτές δεν βρίσκεται σε περιοχή που τα σύντομα αναγνώσματα βρίσκουν δύσκολη.
Η ολόκληρη γονιδιωματική ανάλυση καλύπτει και τα 23,3 kb του COL6A1, συμπεριλαμβανομένων των ιντρονίων, και όχι μόνο τα 4,2 kb των εξονίων.
Γονίδια που σχετίζονται με τις ίδιες παθήσεις
- COL6A2collagen type VI alpha 2 chainΜοιράζεται 3 παθήσεις
- COL6A3collagen type VI alpha 3 chainΜοιράζεται 3 παθήσεις
- DAG1dystroglycan 1Μοιράζεται 2 παθήσεις
- FKRPfukutin related proteinΜοιράζεται 2 παθήσεις
- FKTNfukutinΜοιράζεται 2 παθήσεις
- GMPPBGDP-mannose pyrophosphorylase BΜοιράζεται 2 παθήσεις
- LAMA2laminin subunit alpha 2Μοιράζεται 2 παθήσεις
- POMGNT1protein O-linked mannose N-acetylglucosaminyltransferase 1 (beta 1,2-)Μοιράζεται 2 παθήσεις
- SNUPNsnurportin 1Μοιράζεται 2 παθήσεις
- ANO5anoctamin 5Μοιράζεται 1 πάθηση
- B3GALNT2beta-1,3-N-acetylgalactosaminyltransferase 2Μοιράζεται 1 πάθηση
- B4GAT1beta-1,4-glucuronyltransferase 1Μοιράζεται 1 πάθηση
Χαρακτηριστικά που συνδέονται με το COL6A1
Το Human Phenotype Ontology καταγράφει αυτά ως χαρακτηριστικά των σπάνιων παθήσεων που μπορεί να προκαλέσει το COL6A1. Η σελίδα κάθε χαρακτηριστικού εμφανίζει τα άλλα γονίδια που συνδέονται με αυτό.
Abnormality of the musculoskeletal system
- Axial muscle weakness
- Centrally nucleated skeletal muscle fibers
- Difficulty walking up stairs
- Distal lower limb amyotrophy
- Double-Jointed
- Elbow contracture
- EMG: myopathic abnormalities
- Fatty replacement of skeletal muscle
Εμφάνιση 34 ακόμη χαρακτηριστικών
- Fiber type grouping
- Muscle fiber necrosis
- Neck muscle weakness
- Proximal neurogenic muscle weakness
- Reduced spine movement
- Abnormal muscle fiber morphology
- Flexed joint that cannot be straightened
- Generalized muscle weakness
- Hunched back
- Increased endomysial connective tissue
- Increased variability in muscle fiber diameter
- Increased wrist mobility
- Muscle weakness
- Muscular dystrophy
- Progressive proximal muscle weakness
- Reduced muscle collagen VI
- Scoliosis
- Difficulty running
- Diffuse skeletal muscle wasting
- Frequent falls
- Generalized decreased muscle tone
- Multiple joint contractures
- Weak diaphragm
- Weakness of outermost muscles
- Excessive inward curvature of lower spine
- Gowers sign
- Reduced maximal expiratory pressure
- Rimmed vacuoles
- Decreased lung function due to weak breathing muscles
- Distal joint hypermobility
- Low muscle tone, in neonatal onset
- Muscle degeneration
- Muscle tissue disease
- Type 1 muscle fiber predominance
Abnormality of limbs
- High-arched foot
- Shoulder girdle muscle wasting
- Increased laxity of fingers
- Ankle contracture
- Ankle flexion contracture
- Elbow flexion contracture
- Finger joint contracture
- Hip dislocation
Εμφάνιση 16 ακόμη χαρακτηριστικών
- Inability to straighten knee
- Interphalangeal joint contracture of finger
- Inward turned thumb
- Limb-girdle muscle weakness
- Long toe
- Permanent flexion of the finger
- Pes valgus
- Quadriceps weakness
- Slender finger
- Wrist flexion contracture
- Curved toe bone
- Foot drop
- Shortening of the achilles tendon
- Winged shoulder blade
- Ankle hypermobility
- Club feet
Εξωτερικοί σύνδεσμοι
Εγγραφές γονιδίου
Μεταγράφημα
Πρωτεΐνη
Από πού προέρχονται τα στοιχεία
- HGNC: το σύμβολο, το όνομα, τα άλλα σύμβολα και η θέση του γονιδίου.
- MANE Select v1.5, από το NCBI και το EMBL-EBI: το μεταγράφημα, τα εξόνια και η κωδικοποιούσα αλληλουχία.
- GenCC και ClinGen, έκδοση 2026-10-16: ποιες παθήσεις σχετίζονται με το γονίδιο και πόσο ισχυρή είναι η σχέση.
- Ο κατάλογος δευτερευόντων ευρημάτων του ACMG, SF v3.2.
- ClinVar και οι στρωματοποιήσεις GIAB: γνωστές θέσεις που προκαλούν νόσο και περιοχές που δυσκολεύουν τις αναγνώσεις μικρού μήκους.
- Το Human Phenotype Ontology, έκδοση 2026-09-01: τα χαρακτηριστικά που συνδέονται με το γονίδιο. Μάθετε περισσότερα στο hpo.jax.org.
- Έκδοση δεδομένων 2026.10.16-c6eea6bf.
Παραπομπή σε αυτή τη σελίδα
Dante Labs. (χ.η.). Γονίδιο COL6A1: collagen type VI alpha 1 chain. Ανάκτηση 17 Οκτωβρίου 2026, από https://dantelabs.com/el/genes/col6a1
Dante Labs. Γονίδιο COL6A1: collagen type VI alpha 1 chain [Internet]. [ανακτήθηκε 17 Οκτωβρίου 2026]. Διαθέσιμο από: https://dantelabs.com/el/genes/col6a1
Ένα τεστ. Απαντήσεις για όλη τη ζωή.
Από 449 $Δωρεάν αποστολή · Αποτελέσματα σε 6–8 εβδομάδες