Geeni
TET2
tet methylcytosine dioxygenase 2
- HGNC 25941↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000168769↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 54790↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 4q24
- Koordinaatit
- Kromosomi 4: 105 146 876–105 279 803 (GRCh38)
- Eksonit
- 11 eksonia 132,9 kb:n alueella
- Proteiini
- 2 002 aminohappoa
- Tunnetaan myös nimellä
- FLJ20032
- Aiemmat symbolit
- KIAA1546
- MANE Select -transkripti
- ENST00000380013.9NM_001127208.3
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue TET2 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyvä kuratoitu raportti
Muut synnynnäiset immuunijärjestelmän häiriöt
- Immuunipuutossairaus
Yksi 170 siihen liittyvästä geenistä
Sairaus, jossa immuniteettimekanismeissa on puutetta tai vikaa, joko solullisessa tai humoraalisessa immuniteetissa.
- 2 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
HSCT vakavan yhdistelmäimmuunipuutoksen (SCID) ja vakavien primaaristen immuunipuutosten hoitoon; immunoglobuliinikorvaushoito (IVIG/SCIG) vasta-ainepuutoksiin; leniolisib (Joenja, FDA 2023) APDS-oireyhtymään; geenihoito ADA-SCID-tautiin; abatasepti CTLA4- ja LRBA-puutoksiin; profylaktiset antibiootit; G-CSF krooniseen granulomatoottiseen sairauteen (CGD)
TET2-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 9,6 kb geenin 132,9 kb:stä; 6 009 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä TET2
8
TET2-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 132,9 kb geenistä TET2, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 9,6 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- ADAadenosine deaminaseYhteinen sairaus: 1
- AICDAactivation induced cytidine deaminaseYhteinen sairaus: 1
- AK2adenylate kinase 2Yhteinen sairaus: 1
- ARPC1Bactin related protein 2/3 complex subunit 1BYhteinen sairaus: 1
- ARPC5actin related protein 2/3 complex subunit 5Yhteinen sairaus: 1
- ATMATM serine/threonine kinaseYhteinen sairaus: 1
- ATP6AP1ATPase H+ transporting accessory protein 1Yhteinen sairaus: 1
- B2Mbeta-2-microglobulinYhteinen sairaus: 1
- BACH2BACH transcriptional regulator 2Yhteinen sairaus: 1
- BCL10BCL10 immune signaling adaptorYhteinen sairaus: 1
- BCL11BBCL11 transcription factor BYhteinen sairaus: 1
- BLNKB cell linkerYhteinen sairaus: 1
Geeniin TET2 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita TET2 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Cancer of lymphatic system
- Decreased class-switched memory B cell proportion
- Abnormal mast cell morphology
- Abnormal shape of platelets
- Anemia of inadequate production
- Blood clot in artery
- Blood clot in vein
- Blood tumor
Näytä 53 piirrettä lisää
- Bone marrow disease
- Increased megakaryocyte count
- Increased number of platelets in blood
- Megakaryocyte nucleus hyperlobulation
- Myelodysplasia
- Myeloid leukemia
- Platelet abnormalities
- Prolonged bleeding time
- Refractory anemia with ringed sideroblasts
- Abnormal megakaryocyte morphology
- Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Bleeding tendency
- Bone marrow hypercellularity
- Elevated white blood count
- Erythroid hyperplasia
- Erythroid hypoplasia
- High blood eosinophil count
- Increased CD25+ mast cell proportion
- Low number of red blood cells or hemoglobin
- Low platelet count
- Macrocytic anemia
- Megaloblastic erythroid hyperplasia
- Myeloproliferative disorder
- Normochromic anemia
- Normocytic anemia
- Single lineage myelodysplasia
- Abnormal blood clot
- Abnormal number of granulocyte precursors
- Acute blood cancer
- Acute myeloid leukemia
- Blood cancer
- Blood clot in liver vein
- Blood spots
- Bone marrow failure
- Bruising susceptibility
- Chronic myelomonocytic leukemia
- Dysplastic granulopoesis
- Ecchymosis
- Extramedullary hematopoiesis
- Gastrointestinal bleeding
- Granulocytic hyperplasia
- Hypochromic anemia
- Hyposegmentation of neutrophil nuclei
- Increased blood neutrophil counts
- Increased total basophil count
- Low blood cell count
- Low blood neutrophil count
- Myelofibrosis
- Petechiae
- Poikilocytosis
- Chronic lymphatic leukemia
- Decreased total granulocyte count
- Multiple myeloma
Abnormality of the digestive system
- Abdominal cramps
- Abdominal pain
- Anorexia
- Diarrhea
- Enlarged liver
- Malabsorption
- Accumulation of fluid in the abdomen
- Decreased liver function
Näytä 2 piirrettä lisää
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). TET2-geeni: tet methylcytosine dioxygenase 2. Haettu 16. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/tet2
Dante Labs. TET2-geeni: tet methylcytosine dioxygenase 2 [Internet]. [viitattu 16. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/tet2
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa