Gen
ABCC6
ATP binding cassette subfamily C member 6
- HGNC 57↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000091262↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 368↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 16p13.11
- Souřadnice
- Chromozom 16: 16 149 565–16 223 494 (GRCh38)
- Exony
- 31 exonů na 73,9 kb
- Protein
- 1 503 aminokyselin
- Dědičnost
- Autozomálně recesivní
- Další názvy
- MRP6, EST349056, MLP1, URG7
- Předchozí symboly
- ARA, PXE
- Transkript MANE Select
- ENST00000205557.12NM_001171.6
- Typ lokusu
- gene with protein product
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Referenční genomGRCh38hg38
Pozice na stránkách genů a variant se řídí touto volbou v tomto prohlížeči.
Přečtěte si ABCC6 i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorované reporty související s tímto genem
Hereditary Arterial Calcification
- Generalised Arterial Calcification of InfancyAutozomálně recesivní
Severe calcification and narrowing of large and medium arteries starting before or soon after birth, caused by changes in ENPP1 or ABCC6.
- 2 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Co přináší znalost
Knowing about it supports early specialist care and informs carrier and reproductive counselling.
Pseudoxanthoma Elasticum
- Autozomálně recesivní
Calcification of elastic fibres caused by ABCC6 variants, affecting skin, the retina (angioid streaks) and arteries.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 6 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Co přináší znalost
Regular eye checks allow early anti-VEGF treatment of retinal bleeding; arterial disease and gastrointestinal bleeding are monitored, and contact sports are best avoided.
Dědičnost
- Autozomálně recesivní
- Je potřeba změněná kopie od každého z rodičů. S jednou kopií jste nositelem a obvykle nejste postiženi; pokud jsou oba rodiče nositeli, má každé dítě pravděpodobnost jedna ku čtyřem, že zdědí dvě.
Jak je ABCC6 uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 5,1 kb z 73,9 kb genu; 4 512 těchto bází kódují protein.
Jak genetický test čte ABCC6
126
pozic v genu ABCC6, které ClinVar řadí mezi patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Z nich 20 (16 %) leží v oblastech, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Low mappability (20 míst)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
- Segmental duplications (20 míst)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
Celý genom pokrývá všech 73,9 kb genu ABCC6, včetně intronů, nikoli jen 5,1 kb exonů.
Geny spojené se stejnými onemocněními
Rysy spojené s ABCC6
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit ABCC6. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Abnormality of the cardiovascular system
- Abdominal aortic calcification
- Arterial calcification
- Cardiac failure
- Cardiogenic shock
- Carotid artery calcification
- Coronary artery calcification
- Enlarged heart
- Generalized arterial calcification
Zobrazit ještě 38 rysů
- Heart attack
- Narrowing of kidney artery
- Reduced left ventricular ejection fraction
- Stretched and thinned heart muscle
- Abnormal cardiovascular system morphology
- Abnormality of the cerebral blood vessels
- Calcification of the aorta
- Narrowing of an artery
- High blood pressure
- Intermittent claudication
- Left ventricular systolic dysfunction
- Medial calcification of large arteries
- Medial calcification of medium-sized arteries
- Mitral regurgitation
- Right atrial enlargement
- Sinus tachycardia
- Tricuspid regurgitation
- Abnormal endocardium morphology
- Angina pectoris
- Fluid around heart
- Mini stroke
- Mitral valve prolapse
- Narrowing of aortic valve
- Renovascular hypertension
- Restrictive cardiomyopathy
- Stroke
- Sudden cardiac death
- Telangiectasia of the skin
- Ventricular hypertrophy
- Weak pulse
- Increased blood pressure in blood vessels of lungs
- Mitral stenosis
- Myocardial calcification
- Plaque build-up in arteries supplying blood to heart
- Tear in inner wall of large artery that carries blood away from heart
- Accelerated plaque build-up in arteries
- Hardened artery wall
- Premature occlusive vascular stenosis
Abnormality of the integument
- Abnormality of the skin
- Excessive wrinkled skin
- Tight skin
- Blue discoloration of the skin
- Hanging skin
- Hyperpigmented papule
- Loose redundant skin
- Stretch marks
Zobrazit ještě 4 rysů
Abnormality of the eye
- Retinal peau d'orange
- Angioid streaks
- Noninflammatory retina disease
- Choroidal neovascularization
- Visual impairment
- Blue outer white part of eyeball
- Decreased clarity of vision
- Macular degeneration
Zobrazit ještě 3 rysů
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud údaje pocházejí
- HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-16: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
- Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen ABCC6: ATP binding cassette subfamily C member 6. Staženo 17. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/abcc6
Dante Labs. Gen ABCC6: ATP binding cassette subfamily C member 6 [Internet]. [citováno 17. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/abcc6
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů