Gen
ATM
ATM serine/threonine kinase
- HGNC 795↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000149311↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 472↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 11q22.3
- Koordinater
- Kromosom 11: 108 223 067–108 369 102 (GRCh38)
- Exoner
- 63 exoner på 146 kb
- Protein
- 3 056 aminosyror
- Arvsgång
- Autosomalt dominant Autosomalt recessiv
- Även känd som
- TEL1, TELO1
- Tidigare symboler
- ATA, ATDC, ATC, ATD
- MANE Select-transkript
- ENST00000675843.1NM_000051.4
- Lokustyp
- gene with protein product
ReferensgenomGRCh38hg38
Positioner på gen- och variantsidorna följer det här valet, i den här webbläsaren.
Läs ATM, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterade rapporter som är relevanta för denna gen
Ataxi-telangiektasi
- Autosomalt recessiv
Progressiv cerebellär ataxi, telangiektasi, immunbrist och cancerpredisposition orsakade av bialleliska förändringar i ATM.
- ClinGen bedömer kopplingen som definitiv
- 8 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Vad kunskapen förändrar
Diagnosen styr förebyggande av infektioner och substitutionsbehandling med immunglobuliner, minimering av exponering för joniserande strålning, cancer- och lungövervakning samt bärarundersökning av släktingar.
Kvinnlig infertilitet
Nedsatt eller frånvarande förmåga hos en kvinna att bli gravid.
- ClinGen bedömer kopplingen som definitiv
- 8 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Gener för bröst- och äggstockscancer utöver BRCA1/2
- Cancerpredisposition relaterad till ATMAutosomalt dominant
En enskild variant i ATM ökar måttligt risken för bröstcancer och är kopplad till cancer i bukspottkörteln och prostatacancer.
- ClinGen bedömer kopplingen som definitiv
- 1 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Vad kunskapen förändrar
Utökad screening av brösten rekommenderas i allmänhet; bärare vars partner också bär en ATM-variant kan vilja veta risken för ataxi-telangiektasi hos sina barn.
- Ärftlig bröstcancerAutosomalt dominant
Ärftlig känslighet för bröstcancer orsakad av varianter i någon av flera gener.
- 2 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Vad kunskapen förändrar
Tidigare och mer intensiv mammografiundersökning, inklusive MRT, kan rekommenderas beroende på gen.
Bredare grupperingar
Andra medfödda immunbristsjukdomar
- Immunbristsjukdom
En av 170 gener kopplade till den
Sjukdom där det finns en brist eller defekt i immunförsvarets mekanismer, antingen cellulära eller humorala.
- ClinGen bedömer kopplingen som definitiv
- 8 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Vad kunskapen förändrar
HSCT vid SCID och allvarliga PID; immunglobulinersättning (IVIG/SCIG) vid antikroppsbrist; leniolisib (Joenja, FDA 2023) vid APDS; genterapi vid ADA-SCID; abatacept vid CTLA4- och LRBA-brist; profylaktiska antibiotika; G-CSF vid CGD
Nedärvning
- Autosomalt dominant
- En förändrad kopia, från någon av föräldrarna, räcker. En förälder som har en sådan för den vidare till varje barn med en chans på en av två.
- Autosomalt recessiv
- Det krävs en förändrad kopia från vardera föräldern. Med en är du bärare och oftast opåverkad. När båda föräldrarna är bärare har varje barn en chans på en av fyra att ärva två.
Så är ATM uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
- Varianter med egen sida
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 12,9 kb av genens 146 kb, och 9 171 av dessa baser kodar för proteinet.
Så läser ett genomtest ATM
2 935
positioner i ATM där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
11 av dem (0,4 %) ligger i områden som korta läsningar har svårt för.
- Low mappability (11 ställen)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
En helgenomsanalys täcker alla 146 kb av ATM, med introner inräknade, inte bara de 12,9 kb exoner.
Varianter med egen sida (808)
De ATM-varianter som har en egen sida här, med flest recensionsstjärnor först. Varje sida beskriver ClinVars offentliga register över varianten, aldrig ett resultat.
| Variant | HGVS c. | Exon eller intron | Position (GRCh38) | ClinVar-klassificering | Granskningsstatus |
|---|---|---|---|---|---|
| A911Rfs*19 | c.2730_2731insAG | Exon 18 | 108 268 501 | Patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel |
| c.2T>C | Exon 2 | 108 227 626 | Patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel | |
| c.332-1G>A | Intron 4 | 108 235 669 | Patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel | |
| c.496+5G>A | Intron 5 | 108 235 839 | Patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel | |
| c.1122_1123del | Exon 9 | 108 248 987 | Patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel | |
| c.1607+1G>T | Intron 10 | 108 251 073 | Patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel | |
| c.2251-2A>T | Intron 14 | 108 257 479 | Patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel | |
| c.2251-4A>G | Intron 14 | 108 257 477 | Sannolikt patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel | |
| c.2466+5G>C | Intron 16 | 108 259 080 | Sannolikt patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel | |
| c.2639-23_2639-21del | Intron 17 | 108 268 386 | Patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel |
Gener kopplade till samma tillstånd
- ADAadenosine deaminaseDelar 1 tillstånd
- AICDAactivation induced cytidine deaminaseDelar 1 tillstånd
- AK2adenylate kinase 2Delar 1 tillstånd
- ANKRD31ankyrin repeat domain 31Delar 1 tillstånd
- ARPC1Bactin related protein 2/3 complex subunit 1BDelar 1 tillstånd
- ARPC5actin related protein 2/3 complex subunit 5Delar 1 tillstånd
- ATP6AP1ATPase H+ transporting accessory protein 1Delar 1 tillstånd
- B2Mbeta-2-microglobulinDelar 1 tillstånd
- BACH2BACH transcriptional regulator 2Delar 1 tillstånd
- BARD1BRCA1 associated RING domain 1Delar 1 tillstånd
- BCL10BCL10 immune signaling adaptorDelar 1 tillstånd
- BCL11BBCL11 transcription factor BDelar 1 tillstånd
Egenskaper kopplade till ATM
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som ATM kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Abnormality of the nervous system
- Ataxia
- Difficulty articulating speech
- Progressive cerebellar ataxia
- Abnormal gait
- Abnormal speech pattern
- Abnormality of movement
- Choreoathetosis
- Glioblastoma multiforme
Visa ytterligare 29 egenskaper
- Tremor
- Anxiety
- Attention deficit
- Behavioral abnormality
- Delayed speech and language development
- Depression
- Difficulty performing quick and alternating movements
- Epilepsy
- Inability to walk
- Intention tremor
- Irritability
- Migraine
- Rise in pressure inside skull
- Slurred speech
- Abnormal pyramidal sign
- Benign neoplasm of the central nervous system
- Cancer of early nerve cells
- Cognitive impairment
- Disorder of involuntary muscle movements
- Disturbed sensory perception
- Dysgraphia
- Hallucinations
- Loss of developmental milestones
- Memory impairment
- Paralysis or weakness of one side of body
- Pins and needles feeling
- Diminished deep tendon reflex
- Dystonia
- Jerking
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- B-cell lymphoma
- Decreased blood lymphocyte number
- Acute lymphoblastic leukemia
- Bone marrow disease
- Gastrointestinal bleeding
- Blood cancer
- Cancer of lymphatic system
- Decreased total CD4+ T cell proportion
Visa ytterligare 3 egenskaper
Abnormality of the genitourinary system
- Abnormal fallopian tube morphology
- Ovarian cancer
- Polycystic ovaries
- Abnormality of the testis
- Prostate cancer
- Urinary tract neoplasm
- Uterine cancer
- Abnormal sperm development
Visa ytterligare 1 egenskap
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppt 2026-10-16: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt kopplingen är.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsorsakande positioner och de regioner där korta läsningar har svårt.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.16-c6eea6bf.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). ATM-genen: ATM serine/threonine kinase. Hämtad 16 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/atm
Dante Labs. ATM-genen: ATM serine/threonine kinase [Internet]. [citerad 16 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/atm
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor