Gene
FLNC
filamin C
- HGNC 3756↗(si apre in una nuova scheda)
- Gene Ensembl ENSG00000128591↗(si apre in una nuova scheda)
- NCBI Gene 2318↗(si apre in una nuova scheda)
Sintesi
- Localizzazione citogenetica
- 7q32.1
- Coordinate
- Cromosoma 7: 128.830.406–128.859.272 (GRCh38)
- Esoni
- 48 esoni su 28,9 kb
- Proteina
- 2725 amminoacidi
- Noto anche come
- ABP-280, ABPL
- Simboli precedenti
- FLN2
- Trascritto MANE Select
- ENST00000325888.13NM_001458.5
- Tipo di locus
- Codificanti per proteine
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Cardiomiopatia dilatativa
Ingrandimento e indebolimento del ventricolo sinistro non spiegati da malattia delle arterie coronarie o delle valvole; le forme ereditarie coinvolgono TTN, LMNA, RBM20, FLNC, BAG3, DSP, MYH7, TNNT2, DES, PLN e molti altri geni, e includono la sindrome di Barth e le distrofie muscolari di Emery-Dreifuss.
- ClinGen valuta il legame come definitivo
- 4 submitter GenCC lo valutano come definitivo o forte
▶Azionabilità
Conoscere una causa genetica favorisce un monitoraggio cardiaco precoce e lo screening dei familiari; per i geni associati a un elevato rischio di aritmie, come LMNA, FLNC e RBM20, orienta le decisioni sul monitoraggio del ritmo e sull'eventuale impianto di defibrillatori.
Miopatie distali
- Miopatia distale
Un gruppo di malattie muscolari ereditarie in cui la debolezza inizia nelle mani, negli avambracci, nella parte inferiore delle gambe o nei piedi, causata da geni come TTN, DYSF, FLNC, MYH7, ADSS1, SMPX e MATR3.
- 1 submitter GenCC lo valuta come definitivo o forte
Miopatie miofibrillari
- Miopatia miofibrillare
Un gruppo di malattie muscolari in cui si deteriora la struttura contrattile delle fibre muscolari, causate da geni come DES, CRYAB, MYOT, LDB3, FLNC e BAG3.
- ClinGen valuta il legame come definitivo
- 4 submitter GenCC lo valutano come definitivo o forte
- Nella lista ACMG dei risultati secondari
▶Azionabilità
Poiché il cuore è spesso coinvolto, si raccomandano controlli cardiaci regolari (come ECG ed ecocardiografia) anche in assenza di sintomi.
Raggruppamenti più ampi
Cardiomiopatia ipertrofica
- Autosomica dominante
Uno di 62 geni collegati ad esso
Una condizione in cui il miocardio si presenta ipertrofico in assenza di una causa evidente. L'ipertrofia è generalmente asimmetrica e può associarsi a un'ostruzione del tratto di efflusso ventricolare.
- 1 submitter GenCC lo valuta come definitivo o forte
- Nella lista ACMG dei risultati secondari
▶Azionabilità
Beta-bloccanti, calcio-antagonisti non diidropiridinici, limitazione dell'attività fisica, consulenza genetica
Struttura di FLNC
- Sequenza codificante
- Regione non tradotta
- Introne
- Direzione della trascrizione
- Siti noti causativi di malattia
- Regioni che le letture brevi faticano a leggere
- Varianti con una pagina
Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.
Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).
Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.
Gli esoni costituiscono 9,2 kb dei 28,9 kb del gene; 8178 di queste basi codificano la proteina.
Sequenziamento di FLNC
10Moderata
Quanto è difficile sequenziare FLNC con letture corte, su 100Ogni barra indica la quota di basi degli esoni di FLNC che si trovano in quel tipo di regione difficile. Il punteggio le pondera in base a quanto ciascuna pesa su una chiamata con letture corte: 0 quando nessuna base si trova in una regione di questo tipo, 100 quando ogni base si trova in tutte.
- MappabilitàTratti in cui le letture da 100 o 250 bp non possono essere collocate in modo univoco, quindi una chiamata in quelle zone potrebbe mancare o essere errata. Peso 35%.3,6%
- OmologiaDuplicazioni segmentali: copie altrove nel genoma, come paraloghi e pseudogeni, con identità del 90% o superiore. Peso 30%.13%
- RipetizioniRipetizioni in tandem e sequenze di una stessa base ripetuta, su cui le letture tendono a scivolare e che potrebbero non essere coperte per intero. Peso 15%.3,3%
- Contenuto di GCFinestre con meno del 25% o più del 65% di G e C, che la preparazione della libreria copre con difficoltà. Peso 10%.45%
- Copertura di riferimentoLacune nell'assemblaggio di riferimento vicine, dove non c'è una sequenza a cui le letture possano allinearsi. Peso 10%.0%
484
posizioni in FLNC in cui ClinVar classifica una variante come patogenica o probabilmente patogenica
48 di queste (9,9%) cadono in regioni che le letture corte faticano a sequenziare.
- Low mappabilityRegions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely. (10 siti)
- Segmental duplicationsCopies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy. (48 siti)
Un genoma intero copre tutti i 28,9 kb di FLNC, introni inclusi, e non solo i 9,2 kb degli esoni.
Varianti con una pagina (31)
Le varianti FLNC con una pagina qui, prima quelle con più stelle di revisione. Ogni pagina descrive il registro pubblico di ClinVar sulla variante, mai un risultato.
| Variante | HGVS c. | Esone o introne | Posizione (GRCh38) | Classificazione ClinVar | Stato di revisione |
|---|---|---|---|---|---|
| A193T | c.577G>A | Esone 2 | 128.835.550 | Patogena | ★★★★2 stelle su 4 criteri forniti, più sottomittenti, nessun conflitto |
| A1186V | c.3557C>T | Esone 21 | 128.845.022 | Patogena | ★★★★2 stelle su 4 criteri forniti, più sottomittenti, nessun conflitto |
| c.970-4A>G | Introne 5 | 128.837.983 | Patogena | ★★★★2 stelle su 4 criteri forniti, più sottomittenti, nessun conflitto | |
| c.2550+2T>C | Introne 16 | 128.842.956 | Patogena/probabilmente patogena | ★★★★2 stelle su 4 criteri forniti, più sottomittenti, nessun conflitto | |
| c.3193-2A>G | Introne 20 | 128.844.656 | Probabilmente patogena | ★★★★2 stelle su 4 criteri forniti, più sottomittenti, nessun conflitto | |
| c.3791-1G>C | Introne 21 | 128.845.989 | Patogena/probabilmente patogena | ★★★★2 stelle su 4 criteri forniti, più sottomittenti, nessun conflitto | |
| c.5199+1G>T | Introne 30 | 128.849.579 | Patogena/probabilmente patogena | ★★★★2 stelle su 4 criteri forniti, più sottomittenti, nessun conflitto | |
| c.6727+1G>A | Introne 40 | 128.854.217 | Probabilmente patogena | ★★★★2 stelle su 4 criteri forniti, più sottomittenti, nessun conflitto | |
| D1061Ifs*17 | c.3180del | Esone 20 | 128.844.253 | Patogena | ★★★★2 stelle su 4 criteri forniti, più sottomittenti, nessun conflitto |
| F298Wfs*48 | c.893_908del | Esone 5 | 128.837.677 | Patogena/probabilmente patogena | ★★★★2 stelle su 4 criteri forniti, più sottomittenti, nessun conflitto |
Geni associati alle stesse condizioni
- LDB3LIM domain binding 3Condivide 4 condizioni
- MYH7myosin heavy chain 7Condivide 3 condizioni
- TTNtitinCondivide 3 condizioni
- ACTC1actin alpha cardiac muscle 1Condivide 2 condizioni
- BAG3BAG cochaperone 3Condivide 2 condizioni
- CRYABcrystallin alpha BCondivide 2 condizioni
- DESdesminCondivide 2 condizioni
- JPH2junctophilin 2Condivide 2 condizioni
- MYBPC3myosin binding protein C3Condivide 2 condizioni
- MYOTmyotilinCondivide 2 condizioni
- MYPNmyopalladinCondivide 2 condizioni
- PLNphospholambanCondivide 2 condizioni
Tratti collegati a FLNC
L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che FLNC può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.
Abnormality of the cardiovascular system
- Abnormal left ventricular function
- Left ventricular systolic dysfunction
- Stretched and thinned heart muscle
- Abnormal heart rate
- Cardiac failure
- Interstitial cardiac fibrosis
- Left atrial enlargement
- Pulmonary venous hypertension
Mostra altri 19 tratti
- Quivering upper heart chambers resulting in irregular heartbeat
- Right atrial enlargement
- Abnormality of the cardiovascular system
- Complete right bundle branch block
- Disease of the heart muscle
- Enlarged and thickened heart muscle
- Interruption of electrical communication between upper and lower chambers of heart
- Left bundle branch block
- Left ventricular diastolic dysfunction
- Left ventricular hypertrophy
- Mitral regurgitation
- Permanent atrial fibrillation
- Prolonged QTc interval
- Stroke
- Sudden cardiac death
- Supraventricular arrhythmia
- Tricuspid regurgitation
- Fainting spell
- Left anterior fascicular block
Abnormality of the nervous system
- Abnormal gait
- Inability to walk
- Abnormality of balance
- Abnormality of peripheral nervous system electrophysiology
- Peripheral neuropathy
- Abnormal peripheral nervous system structure
- Decreased reflex response
- Somatic sensory dysfunction
Mostra altri 1 tratto
Link esterni
Schede genetiche
Trascritto
Proteina
Da dove provengono questi dati
- HGNC: il simbolo del gene, il nome, gli altri simboli e la posizione.
- MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
- GenCC e ClinGen, rilasciati nel 2026-10-17: le condizioni a cui il gene è associato e il grado di associazione.
- L'elenco ACMG dei reperti secondari, SF v3.2.
- ClinVar e le stratificazioni GIAB: i siti noti che causano malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili.
- Le stratificazioni del genoma Genome in a Bottle, da NIST: il punteggio di difficoltà di sequenziamento.
- The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
- Rilascio dei dati 2026.10.17-8666dff2.
Cita questa pagina
Dante Labs. (s.d.). Gene FLNC: filamin C. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/flnc
Dante Labs. Gene FLNC: filamin C [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/flnc
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