Gén
COL1A1
collagen type I alpha 1 chain
- HGNC 2197↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000108821↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 1277↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 17q21.33
- Koordináták
- 17. kromoszóma: 50 184 101–50 201 631 (GRCh38)
- Exonok
- 51 exon, összesen 17,5 kb
- Fehérje
- 1464 aminosav
- Más néven ismert
- OI4
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000225964.10NM_000088.4
- Lokusz típusa
- Protein-coding
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Ez az oldal adatként
Adja hozzá a .json végződést az oldal címéhez, vagy kérjen application/json típust, hogy JSON-ként olvassa be.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/col1a1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOlvassa el a COL1A1-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések
Ehlers-Danlos Syndrome
- A ClinGen a kapcsolatot a következőként minősíti: bizonyított
- 4 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
Osteogenesis Imperfecta
A group of inherited connective tissue disorders causing fragile bones that break easily, often with blue sclerae, hearing loss and dental problems.
- A ClinGen a kapcsolatot a következőként minősíti: bizonyított
- 3 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
▶Beavatkozhatóság
Cyclic IV bisphosphonates (pamidronate, zoledronate); orthopedic rodding of long bones; physical therapy; denosumab (in clinical use for pediatric OI); romosozumab (in development); hearing monitoring; dental management for dentinogenesis imperfecta
A COL1A1 génre vonatkozó tulajdonságjelentés
Sports & Performance
- Bone & Ligament Strength
A COL1A1 felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Ismert betegségokozó helyek
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 17,5 kb-jából 5,9 kb-ot tesznek ki; ezek közül 4395 bázis kódolja a fehérjét.
COL1A1 szekvenálása
930
COL1A1-pozíció, ahol a ClinVar a változást kórokozónak vagy valószínűleg kórokozónak minősíti
Ezek közül egyik sem olyan régióba esik, ahol a rövid szekvenciaolvasatok nehezen találnak.
A teljes genomszekvenálás a COL1A1 gén mind a 17,5 kb-nyi szakaszát lefedi, az intronokat is beleértve, nem csupán az exonok 5,9 kb-át.
Ugyanazokhoz a betegségekhez kapcsolódó gének
- COL1A2collagen type I alpha 2 chain2 betegséget oszt meg
- ADAMTS2ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 21 betegséget oszt meg
- AEBP1AE binding protein 11 betegséget oszt meg
- ANO5anoctamin 51 betegséget oszt meg
- ATP6V0A2ATPase H+ transporting V0 subunit a21 betegséget oszt meg
- B3GALT6beta-1,3-galactosyltransferase 61 betegséget oszt meg
- B4GALT7beta-1,4-galactosyltransferase 71 betegséget oszt meg
- BMP1bone morphogenetic protein 11 betegséget oszt meg
- C1Rcomplement C1r1 betegséget oszt meg
- C1Scomplement C1s1 betegséget oszt meg
- CHST14carbohydrate sulfotransferase 141 betegséget oszt meg
- COL12A1collagen type XII alpha 1 chain1 betegséget oszt meg
A(z) COL1A1 génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) COL1A1 gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Abnormality of the musculoskeletal system
- Abnormal formation of the hip
- Bell-shaped thorax
- Crumpled long bones
- Double-Jointed
- Generalized decreased muscle tone
- Increased susceptibility to fractures
- Low solidness and mass of the bones
- Multiple fractures present at birth
Még 37 tulajdonság megjelenítése
- Multiple rib fractures
- Periosteal thickening of long tubular bones
- Recurrent fractures
- Recurrent joint dislocation
- Small chest
- Subperiosteal bone formation
- Thin ribs
- Bacterial infection of skin
- Cortical irregularity
- Hypermobility of all joints
- Multiple joint dislocation
- Scoliosis
- Hernia
- Joint dislocation
- Low muscle tone
- Muscle spasm
- Muscle weakness
- Osteopenia
- Popcorn calcification
- Degenerative joint disease
- Kyphoscoliosis
- Limb pain
- Shoulder dislocation
- Abnormal shape of pelvic girdle bone
- Biconcave flattened vertebrae
- Biconcave vertebral bodies
- Bowing of limbs due to multiple fractures
- Broad long bones
- Flattened vertebrae
- Hunched back
- Joint subluxation
- Osteoporosis
- Premature osteoarthritis
- Severe generalized osteoporosis
- Slender long bone
- Thickened cortex of the clavicle
- Vertebra plana
Abnormality of head or neck
- Absent bone maturation of skullcap
- Delayed closure of the soft spot on the skull
- Depressed nasal bridge
- Eye folds
- Frontal bossing
- Little lower jaw
- Pulp stones
- Receding chin
Még 19 tulajdonság megjelenítése
- Wide fontanelles
- Abnormality of the jaw joint
- Baggy eyes
- Blepharochalasis
- Cleft lip
- Cleft palate
- Dentinogenesis imperfecta
- Extra bones within cranial sutures
- Facial asymmetry
- Midface retrusion
- Overgrowth of skullcap
- Basilar impression
- Beaked nose
- Flattening of the skull base
- Soft skullcap
- Thickened cortex of the mandible
- Triangular face
- Wider-than-typical soft spot of skull
- Zygomatic flattening
Abnormality of limbs
- Bunion
- Congenital bilateral hip dislocation
- Contracture of the proximal interphalangeal joint of the 2nd finger
- Contracture of the proximal interphalangeal joint of the 3rd finger
- Dislocated knee since birth
- Dropped arches
- Increased mobility in finger joint
- Limb undergrowth
Még 18 tulajdonság megjelenítése
- Avascular necrosis of the capital femoral epiphysis
- Hip dislocation
- Abnormal feet structure
- Talipes
- Club feet
- Cortical thickening of long bone diaphyses
- Dislocated kneecap
- Dislocated radial head
- Phalangeal dislocation
- Swan neck-like deformities of the fingers
- Abnormally indented hip sockets
- Bowed legs
- Bowed shankbone
- Bowed thighbone
- Bowing of thighbone at birth, straightening with time
- Thickened cortex of the radius
- Thickened cortex of the ulna
- Thickened tibial cortex
Abnormality of the cardiovascular system
- Redness of skin or mucous membrane
- An opening in the wall separating the top two chambers of the heart
- Arterial rupture
- Abnormal heart valve physiology
- Arterial dissection
- Arteriovenous fistula
- Brain aneurysm
- Bulge in wall of root of large artery that carries blood away from heart
Még 9 tulajdonság megjelenítése
Abnormality of the digestive system
- Acid reflux
- Chronic constipation
- Inguinal hernia
- Nausea
- Vomiting
- Feeding difficulties in infancy
- Femoral hernia
- Incisional hernia
Még 3 tulajdonság megjelenítése
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Honnan származnak az adatok
- HGNC: a gén szimbóluma, neve, egyéb szimbólumai és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI-tól és az EMBL-EBI-tól: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-17 kiadás: mely betegségekkel kapcsolódik a gén, és milyen erősen.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- ClinVar és a GIAB-rétegződések: ismert, betegséget okozó helyek, valamint azok a régiók, amelyeket a rövid leolvasások nehezen térképeznek fel.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.17-8666dff2.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). COL1A1 gén: collagen type I alpha 1 chain. Lekérve: 2026. október 17., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/col1a1
Dante Labs. COL1A1 gén: collagen type I alpha 1 chain [Internet]. [idézve: 2026. október 17.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/col1a1
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt