Gen
COL1A1
collagen type I alpha 1 chain
- HGNC 2197↗(åbnes i en ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000108821↗(åbnes i en ny fane)
- NCBI Gene 1277↗(åbnes i en ny fane)
Oversigt
- Cytogenetisk placering
- 17q21.33
- Koordinater
- Kromosom 17: 50.184.101–50.201.631 (GRCh38)
- Exoner
- 51 exoner fordelt over 17,5 kb
- Protein
- 1.464 aminosyrer
- Også kendt som
- OI4
- MANE Select-transkript
- ENST00000225964.10NM_000088.4
- Lokustype
- gene with protein product
- Meget høj
- Sikker
- Lav
- Meget lav
ReferencegenomGRCh38hg38
Positioner på gen- og variantsider følger dette valg i denne browser.
Læs COL1A1 og resten af dit genom med én test.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger
Bestil min Genome TestKurerede rapporter relevant for dette gen
Ehlers-Danlos syndrom
- ClinGen vurderer forbindelsen som definitivt
- 4 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
Osteogenesis Imperfecta
En gruppe arvelige bindevævssygdomme, der giver skøre knogler, som let brækker, ofte med blå sclerae, høretab og tandproblemer.
- ClinGen vurderer forbindelsen som definitivt
- 3 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
Hvad viden ændrer
Cykliske intravenøse bisphosphonater (pamidronat, zoledronat); ortopædisk markstiftning af lange knogler; fysioterapi; denosumab (i klinisk brug til OI hos børn); romosozumab (under udvikling); hørekontrol; tandbehandling ved dentinogenesis imperfecta
Trækrapport, der viser COL1A1
Sport og præstation
- Knogle- og ledbåndsstyrke
Sådan er COL1A1 opbygget
- Kodende sekvens
- Utranslateret region
- Intron
- Transkriptionsretning
- Kendte sygdomsfremkaldende steder
Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.
Eksoner udgør 5,9 kb af genets 17,5 kb; 4.395 af disse baser koder for proteinet.
Sådan læser en genomtest COL1A1
930
positioner i COL1A1, hvor ClinVar klassificerer en ændring som patogen eller sandsynligvis patogen
Ingen af dem ligger i en region, som korte læsninger har svært ved.
En helgenomsanalyse dækker alle 17,5 kb af COL1A1, inklusive introner, og ikke kun de 5,9 kb eksoner.
Gener knyttet til de samme sygdomme
- COL1A2collagen type I alpha 2 chainDeler 2 sygdomme
- ADAMTS2ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 2Deler 1 sygdom
- AEBP1AE binding protein 1Deler 1 sygdom
- ANO5anoctamin 5Deler 1 sygdom
- ATP6V0A2ATPase H+ transporting V0 subunit a2Deler 1 sygdom
- B3GALT6beta-1,3-galactosyltransferase 6Deler 1 sygdom
- B4GALT7beta-1,4-galactosyltransferase 7Deler 1 sygdom
- BMP1bone morphogenetic protein 1Deler 1 sygdom
- C1Rcomplement C1rDeler 1 sygdom
- C1Scomplement C1sDeler 1 sygdom
- CHST14carbohydrate sulfotransferase 14Deler 1 sygdom
- COL12A1collagen type XII alpha 1 chainDeler 1 sygdom
Træk knyttet til COL1A1
Human Phenotype Ontology angiver disse som kendetegn ved de sjældne tilstande, COL1A1 kan forårsage. Hvert træks side viser de andre gener, der er knyttet til det.
Abnormality of the musculoskeletal system
- Abnormal formation of the hip
- Bell-shaped thorax
- Crumpled long bones
- Double-Jointed
- Generalized decreased muscle tone
- Increased susceptibility to fractures
- Low solidness and mass of the bones
- Multiple fractures present at birth
Vis 37 træk mere
- Multiple rib fractures
- Periosteal thickening of long tubular bones
- Recurrent fractures
- Recurrent joint dislocation
- Small chest
- Subperiosteal bone formation
- Thin ribs
- Bacterial infection of skin
- Cortical irregularity
- Hypermobility of all joints
- Multiple joint dislocation
- Scoliosis
- Hernia
- Joint dislocation
- Low muscle tone
- Muscle spasm
- Muscle weakness
- Osteopenia
- Popcorn calcification
- Degenerative joint disease
- Kyphoscoliosis
- Limb pain
- Shoulder dislocation
- Abnormal shape of pelvic girdle bone
- Biconcave flattened vertebrae
- Biconcave vertebral bodies
- Bowing of limbs due to multiple fractures
- Broad long bones
- Flattened vertebrae
- Hunched back
- Joint subluxation
- Osteoporosis
- Premature osteoarthritis
- Severe generalized osteoporosis
- Slender long bone
- Thickened cortex of the clavicle
- Vertebra plana
Abnormality of head or neck
- Absent bone maturation of skullcap
- Delayed closure of the soft spot on the skull
- Depressed nasal bridge
- Eye folds
- Frontal bossing
- Little lower jaw
- Pulp stones
- Receding chin
Vis 19 træk mere
- Wide fontanelles
- Abnormality of the jaw joint
- Baggy eyes
- Blepharochalasis
- Cleft lip
- Cleft palate
- Dentinogenesis imperfecta
- Extra bones within cranial sutures
- Facial asymmetry
- Midface retrusion
- Overgrowth of skullcap
- Basilar impression
- Beaked nose
- Flattening of the skull base
- Soft skullcap
- Thickened cortex of the mandible
- Triangular face
- Wider-than-typical soft spot of skull
- Zygomatic flattening
Abnormality of limbs
- Bunion
- Congenital bilateral hip dislocation
- Contracture of the proximal interphalangeal joint of the 2nd finger
- Contracture of the proximal interphalangeal joint of the 3rd finger
- Dislocated knee since birth
- Dropped arches
- Increased mobility in finger joint
- Limb undergrowth
Vis 18 træk mere
- Avascular necrosis of the capital femoral epiphysis
- Hip dislocation
- Abnormal feet structure
- Talipes
- Club feet
- Cortical thickening of long bone diaphyses
- Dislocated kneecap
- Dislocated radial head
- Phalangeal dislocation
- Swan neck-like deformities of the fingers
- Abnormally indented hip sockets
- Bowed legs
- Bowed shankbone
- Bowed thighbone
- Bowing of thighbone at birth, straightening with time
- Thickened cortex of the radius
- Thickened cortex of the ulna
- Thickened tibial cortex
Abnormality of the digestive system
- Acid reflux
- Chronic constipation
- Inguinal hernia
- Nausea
- Vomiting
- Feeding difficulties in infancy
- Femoral hernia
- Incisional hernia
Vis 3 træk mere
Eksterne links
Genposter
Transkript
Protein
Hvor oplysningerne kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
- GenCC og ClinGen, udgivet 2026-10-16: hvilke sygdomme genet er knyttet til, og hvor stærkt.
- ACMG-listen over sekundære fund, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifikationerne: kendte sygdomsfremkaldende positioner og de regioner, som korte læsninger har svært ved at aflæse.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: de træk, der er knyttet til genet. Læs mere på hpo.jax.org.
- Dataudgivelse 2026.10.16-c6eea6bf.
Citér denne side
Dante Labs. (u.d.). COL1A1-genet: collagen type I alpha 1 chain. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/col1a1
Dante Labs. COL1A1-genet: collagen type I alpha 1 chain [Internet]. [citeret 17. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/col1a1
Én test. Svar for hele livet.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger